RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461691.6_PAR_Y

ZBED1-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.76■■■■□ 3.16
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.16■■■□□ 2.58
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ABCC9O60706 1549 aa30.95■■■□□ 2.55
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.56■■■□□ 2.32
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y NACADO15069 1562 aa29.4■■■□□ 2.3
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.27■■■□□ 2.28
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y MYO15BQ96JP2 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.91■■■□□ 2.22
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.84■■■□□ 2.21
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.74■■■□□ 2.19
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y BICRAQ9NZM4 1560 aa28.67■■■□□ 2.18
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SCRIBQ14160 1630 aa28.38■■■□□ 2.13
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.33■■■□□ 2.13
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.98■■■□□ 2.07
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CECR2Q9BXF3 1484 aa27.86■■■□□ 2.05
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y NCAPD3P42695 1498 aa27.12■■□□□ 1.93
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SMARCA4P51532 1647 aa27.1■■□□□ 1.93
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.06■■□□□ 1.92
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SMARCA2P51531 1590 aa27.02■■□□□ 1.92
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y HMGXB3Q12766 1538 aa26.95■■□□□ 1.9
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y PEG3Q9GZU2 1588 aa26.82■■□□□ 1.88
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y MROH2BQ7Z745 1585 aa26.79■■□□□ 1.88
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ERCC6Q03468 1493 aa26.73■■□□□ 1.87
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y NESP48681 1621 aa26.63■■□□□ 1.85
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CUX2O14529 1486 aa26.62■■□□□ 1.85
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.5■■□□□ 1.83
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y WIZO95785 1651 aa26.49■■□□□ 1.83
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.38■■□□□ 1.81
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.33■■□□□ 1.81
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.33■■□□□ 1.81
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CADPSQ9ULU8 1353 aa26.3■■□□□ 1.8
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y MRC2Q9UBG0 1479 aa26.1■■□□□ 1.77
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CFTRP13569 1480 aa26.04■■□□□ 1.76
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CEP164Q9UPV0 1460 aa26.04■■□□□ 1.76
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y WDR62O43379 1518 aa26.02■■□□□ 1.76
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.01■■□□□ 1.75
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y PRDM2Q13029 1718 aa25.86■■□□□ 1.73
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CCDC88BA6NC98 1476 aa25.85■■□□□ 1.73
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y TOPBP1Q92547 1522 aa25.54■■□□□ 1.68
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ABCC8Q09428 1581 aa25.52■■□□□ 1.68
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y IFT140Q96RY7 1462 aa25.5■■□□□ 1.67
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.48■■□□□ 1.67
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y OSCARQ8IYS5 282 aa25.42■■□□□ 1.66
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y TRIM41Q8WV44 630 aa25.31■■□□□ 1.64
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SOGA1O94964 1423 aa25.19■■□□□ 1.62
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.18■■□□□ 1.62
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CUX1P39880 1505 aa25.16■■□□□ 1.62
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.15■■□□□ 1.62
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CHD1O14646 1710 aa25.12■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y WDR97A6NE52 1622 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y FBLN2P98095 1184 aa25.04■■□□□ 1.6
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ARHGEF11O15085 1522 aa25.02■■□□□ 1.6
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.98■■□□□ 1.59
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y GRIN2BQ13224 1484 aa24.95■■□□□ 1.58
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y PBRM1Q86U86 1689 aa24.89■■□□□ 1.58
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y GAPVD1Q14C86 1478 aa24.89■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.88■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SYNJ2O15056 1496 aa24.84■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.84■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.83■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SYNJ1O43426 1573 aa24.83■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y TOP2BQ02880 1626 aa24.82■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CLASP1Q7Z460 1538 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ARAP1Q96P48 1450 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ADAMTS12P58397 1594 aa24.64■■□□□ 1.54
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y GRIN2AQ12879 1464 aa24.62■■□□□ 1.53
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.58■■□□□ 1.53
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y NUP160Q12769 1436 aa24.52■■□□□ 1.52
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CEP170Q5SW79 1584 aa24.52■■□□□ 1.52
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.42■■□□□ 1.5
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y SHROOM2Q13796 1616 aa24.42■■□□□ 1.5
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y KIF27Q86VH2 1401 aa24.34■■□□□ 1.49
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y IGF1RP08069 1367 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED1-204ENST00000461691_PAR_Y CUL7Q14999 1698 aa24.28■■□□□ 1.48
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