RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461214.1

COL5A3-202, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL5A3, Length 828 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-202ENST00000461214 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.32■■■■□ 3.08
COL5A3-202ENST00000461214 ABCC9O60706 1549 aa30.94■■■□□ 2.54
COL5A3-202ENST00000461214 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.58■■■□□ 2.49
COL5A3-202ENST00000461214 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.73■■■□□ 2.35
COL5A3-202ENST00000461214 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.99■■■□□ 2.23
COL5A3-202ENST00000461214 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
COL5A3-202ENST00000461214 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
COL5A3-202ENST00000461214 NACADO15069 1562 aa28.56■■■□□ 2.16
COL5A3-202ENST00000461214 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.54■■■□□ 2.16
COL5A3-202ENST00000461214 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.53■■■□□ 2.16
COL5A3-202ENST00000461214 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.48■■■□□ 2.15
COL5A3-202ENST00000461214 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.32■■■□□ 2.12
COL5A3-202ENST00000461214 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.16■■■□□ 2.1
COL5A3-202ENST00000461214 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.91■■■□□ 2.06
COL5A3-202ENST00000461214 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.84■■■□□ 2.05
COL5A3-202ENST00000461214 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.84■■■□□ 2.05
COL5A3-202ENST00000461214 SCRIBQ14160 1630 aa27.72■■■□□ 2.03
COL5A3-202ENST00000461214 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.58■■■□□ 2.01
COL5A3-202ENST00000461214 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
COL5A3-202ENST00000461214 CUX2O14529 1486 aa26.87■■□□□ 1.89
COL5A3-202ENST00000461214 ERCC6Q03468 1493 aa26.78■■□□□ 1.88
COL5A3-202ENST00000461214 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
COL5A3-202ENST00000461214 SMARCA4P51532 1647 aa26.63■■□□□ 1.85
COL5A3-202ENST00000461214 TRIM41Q8WV44 630 aa26.45■■□□□ 1.82
COL5A3-202ENST00000461214 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.41■■□□□ 1.82
COL5A3-202ENST00000461214 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.39■■□□□ 1.82
COL5A3-202ENST00000461214 NCAPD3P42695 1498 aa26.38■■□□□ 1.81
COL5A3-202ENST00000461214 NESP48681 1621 aa26.35■■□□□ 1.81
COL5A3-202ENST00000461214 SMARCA2P51531 1590 aa26.32■■□□□ 1.8
COL5A3-202ENST00000461214 WIZO95785 1651 aa26.26■■□□□ 1.79
COL5A3-202ENST00000461214 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
COL5A3-202ENST00000461214 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.23■■□□□ 1.79
COL5A3-202ENST00000461214 HMGXB3Q12766 1538 aa26.2■■□□□ 1.79
COL5A3-202ENST00000461214 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
COL5A3-202ENST00000461214 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
COL5A3-202ENST00000461214 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
COL5A3-202ENST00000461214 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.93■■□□□ 1.74
COL5A3-202ENST00000461214 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.91■■□□□ 1.74
COL5A3-202ENST00000461214 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.84■■□□□ 1.73
COL5A3-202ENST00000461214 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
COL5A3-202ENST00000461214 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.67■■□□□ 1.7
COL5A3-202ENST00000461214 PRDM2Q13029 1718 aa25.64■■□□□ 1.7
COL5A3-202ENST00000461214 OSCARQ8IYS5 282 aa25.61■■□□□ 1.69
COL5A3-202ENST00000461214 WDR62O43379 1518 aa25.59■■□□□ 1.69
COL5A3-202ENST00000461214 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.58■■□□□ 1.69
COL5A3-202ENST00000461214 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.56■■□□□ 1.68
COL5A3-202ENST00000461214 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.42■■□□□ 1.66
COL5A3-202ENST00000461214 CFTRP13569 1480 aa25.35■■□□□ 1.65
COL5A3-202ENST00000461214 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
COL5A3-202ENST00000461214 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
COL5A3-202ENST00000461214 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.34■■□□□ 1.65
COL5A3-202ENST00000461214 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.33■■□□□ 1.65
COL5A3-202ENST00000461214 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
COL5A3-202ENST00000461214 ARHGEF11O15085 1522 aa25.17■■□□□ 1.62
COL5A3-202ENST00000461214 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
COL5A3-202ENST00000461214 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.13■■□□□ 1.61
COL5A3-202ENST00000461214 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
COL5A3-202ENST00000461214 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
COL5A3-202ENST00000461214 IFT140Q96RY7 1462 aa24.92■■□□□ 1.58
COL5A3-202ENST00000461214 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.88■■□□□ 1.57
COL5A3-202ENST00000461214 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.88■■□□□ 1.57
COL5A3-202ENST00000461214 ARAP1Q96P48 1450 aa24.88■■□□□ 1.57
COL5A3-202ENST00000461214 ABCC8Q09428 1581 aa24.85■■□□□ 1.57
COL5A3-202ENST00000461214 FBLN2P98095 1184 aa24.81■■□□□ 1.56
COL5A3-202ENST00000461214 TOP2BQ02880 1626 aa24.81■■□□□ 1.56
COL5A3-202ENST00000461214 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
COL5A3-202ENST00000461214 CHD1O14646 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
COL5A3-202ENST00000461214 CUX1P39880 1505 aa24.78■■□□□ 1.56
COL5A3-202ENST00000461214 TOPBP1Q92547 1522 aa24.78■■□□□ 1.56
COL5A3-202ENST00000461214 SYNJ1O43426 1573 aa24.78■■□□□ 1.56
COL5A3-202ENST00000461214 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
COL5A3-202ENST00000461214 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.55
COL5A3-202ENST00000461214 WDR97A6NE52 1622 aa24.64■■□□□ 1.53
COL5A3-202ENST00000461214 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.61■■□□□ 1.53
COL5A3-202ENST00000461214 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
COL5A3-202ENST00000461214 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
COL5A3-202ENST00000461214 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.44■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.43■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.42■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.41■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.41■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 SOGA1O94964 1423 aa24.4■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 PBRM1Q86U86 1689 aa24.4■■□□□ 1.5
COL5A3-202ENST00000461214 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.36■■□□□ 1.49
COL5A3-202ENST00000461214 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.29■■□□□ 1.48
COL5A3-202ENST00000461214 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
COL5A3-202ENST00000461214 SYNJ2O15056 1496 aa24.2■■□□□ 1.47
COL5A3-202ENST00000461214 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.2■■□□□ 1.46
COL5A3-202ENST00000461214 KIF27Q86VH2 1401 aa24.19■■□□□ 1.46
COL5A3-202ENST00000461214 CUL7Q14999 1698 aa24.19■■□□□ 1.46
COL5A3-202ENST00000461214 GRIN2BQ13224 1484 aa24.19■■□□□ 1.46
COL5A3-202ENST00000461214 EEA1Q15075 1411 aa24.15■■□□□ 1.46
COL5A3-202ENST00000461214 ADAMTS12P58397 1594 aa24.12■■□□□ 1.45
COL5A3-202ENST00000461214 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.08■■□□□ 1.44
COL5A3-202ENST00000461214 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.05■■□□□ 1.44
COL5A3-202ENST00000461214 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
COL5A3-202ENST00000461214 KIF21BO75037 1637 aa23.98■■□□□ 1.43
COL5A3-202ENST00000461214 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.93■■□□□ 1.42
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