RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461075.1

TMLHE-204, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene TMLHE, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-204ENST00000461075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.37■■■■□ 3.41
TMLHE-204ENST00000461075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.37■■■□□ 2.77
TMLHE-204ENST00000461075 ABCC9O60706 1549 aa31.72■■■□□ 2.67
TMLHE-204ENST00000461075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.54■■■□□ 2.48
TMLHE-204ENST00000461075 NACADO15069 1562 aa30.49■■■□□ 2.47
TMLHE-204ENST00000461075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.47■■■□□ 2.47
TMLHE-204ENST00000461075 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.3■■■□□ 2.44
TMLHE-204ENST00000461075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TMLHE-204ENST00000461075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.12■■■□□ 2.41
TMLHE-204ENST00000461075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.76■■■□□ 2.35
TMLHE-204ENST00000461075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
TMLHE-204ENST00000461075 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.55■■■□□ 2.32
TMLHE-204ENST00000461075 SCRIBQ14160 1630 aa29.47■■■□□ 2.31
TMLHE-204ENST00000461075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.32■■■□□ 2.28
TMLHE-204ENST00000461075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.21■■■□□ 2.27
TMLHE-204ENST00000461075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
TMLHE-204ENST00000461075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.7■■■□□ 2.19
TMLHE-204ENST00000461075 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.54■■■□□ 2.16
TMLHE-204ENST00000461075 SMARCA4P51532 1647 aa28.21■■■□□ 2.11
TMLHE-204ENST00000461075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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TMLHE-204ENST00000461075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.11■■■□□ 2.09
TMLHE-204ENST00000461075 SMARCA2P51531 1590 aa28.09■■■□□ 2.09
TMLHE-204ENST00000461075 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.99■■■□□ 2.07
TMLHE-204ENST00000461075 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.96■■■□□ 2.07
TMLHE-204ENST00000461075 HMGXB3Q12766 1538 aa27.95■■■□□ 2.06
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TMLHE-204ENST00000461075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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TMLHE-204ENST00000461075 ERCC6Q03468 1493 aa27.39■■□□□ 1.98
TMLHE-204ENST00000461075 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.33■■□□□ 1.97
TMLHE-204ENST00000461075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.26■■□□□ 1.95
TMLHE-204ENST00000461075 CUX2O14529 1486 aa27.15■■□□□ 1.94
TMLHE-204ENST00000461075 CFTRP13569 1480 aa27.12■■□□□ 1.93
TMLHE-204ENST00000461075 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.1■■□□□ 1.93
TMLHE-204ENST00000461075 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.08■■□□□ 1.92
TMLHE-204ENST00000461075 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
TMLHE-204ENST00000461075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.97■■□□□ 1.91
TMLHE-204ENST00000461075 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.95■■□□□ 1.91
TMLHE-204ENST00000461075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TMLHE-204ENST00000461075 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.92■■□□□ 1.9
TMLHE-204ENST00000461075 PRDM2Q13029 1718 aa26.86■■□□□ 1.89
TMLHE-204ENST00000461075 WDR62O43379 1518 aa26.82■■□□□ 1.88
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TMLHE-204ENST00000461075 ABCC8Q09428 1581 aa26.6■■□□□ 1.85
TMLHE-204ENST00000461075 TOPBP1Q92547 1522 aa26.51■■□□□ 1.83
TMLHE-204ENST00000461075 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.48■■□□□ 1.83
TMLHE-204ENST00000461075 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.46■■□□□ 1.83
TMLHE-204ENST00000461075 IFT140Q96RY7 1462 aa26.4■■□□□ 1.82
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TMLHE-204ENST00000461075 CUX1P39880 1505 aa26.27■■□□□ 1.8
TMLHE-204ENST00000461075 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
TMLHE-204ENST00000461075 SOGA1O94964 1423 aa26.22■■□□□ 1.79
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TMLHE-204ENST00000461075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.2■■□□□ 1.78
TMLHE-204ENST00000461075 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.16■■□□□ 1.78
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TMLHE-204ENST00000461075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
TMLHE-204ENST00000461075 OSCARQ8IYS5 282 aa26.08■■□□□ 1.77
TMLHE-204ENST00000461075 WDR97A6NE52 1622 aa26.07■■□□□ 1.76
TMLHE-204ENST00000461075 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TMLHE-204ENST00000461075 TOP2BQ02880 1626 aa26.04■■□□□ 1.76
TMLHE-204ENST00000461075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.03■■□□□ 1.76
TMLHE-204ENST00000461075 SYNJ1O43426 1573 aa25.99■■□□□ 1.75
TMLHE-204ENST00000461075 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.97■■□□□ 1.75
TMLHE-204ENST00000461075 GRIN2BQ13224 1484 aa25.91■■□□□ 1.74
TMLHE-204ENST00000461075 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.91■■□□□ 1.74
TMLHE-204ENST00000461075 FBLN2P98095 1184 aa25.86■■□□□ 1.73
TMLHE-204ENST00000461075 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TMLHE-204ENST00000461075 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.85■■□□□ 1.73
TMLHE-204ENST00000461075 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.84■■□□□ 1.73
TMLHE-204ENST00000461075 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
TMLHE-204ENST00000461075 CHD1O14646 1710 aa25.8■■□□□ 1.72
TMLHE-204ENST00000461075 PBRM1Q86U86 1689 aa25.8■■□□□ 1.72
TMLHE-204ENST00000461075 SYNJ2O15056 1496 aa25.75■■□□□ 1.71
TMLHE-204ENST00000461075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.68■■□□□ 1.7
TMLHE-204ENST00000461075 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.62■■□□□ 1.69
TMLHE-204ENST00000461075 KIF27Q86VH2 1401 aa25.6■■□□□ 1.69
TMLHE-204ENST00000461075 ADAMTS12P58397 1594 aa25.59■■□□□ 1.69
TMLHE-204ENST00000461075 GRIN2AQ12879 1464 aa25.55■■□□□ 1.68
TMLHE-204ENST00000461075 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
TMLHE-204ENST00000461075 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
TMLHE-204ENST00000461075 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
TMLHE-204ENST00000461075 ARHGEF11O15085 1522 aa25.54■■□□□ 1.68
TMLHE-204ENST00000461075 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.54■■□□□ 1.68
TMLHE-204ENST00000461075 IGF1RP08069 1367 aa25.5■■□□□ 1.67
TMLHE-204ENST00000461075 TRIM41Q8WV44 630 aa25.5■■□□□ 1.67
TMLHE-204ENST00000461075 NUP160Q12769 1436 aa25.45■■□□□ 1.66
TMLHE-204ENST00000461075 CUL7Q14999 1698 aa25.42■■□□□ 1.66
TMLHE-204ENST00000461075 CEP170Q5SW79 1584 aa25.39■■□□□ 1.66
TMLHE-204ENST00000461075 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.38■■□□□ 1.65
TMLHE-204ENST00000461075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.35■■□□□ 1.65
TMLHE-204ENST00000461075 ARAP1Q96P48 1450 aa25.32■■□□□ 1.64
TMLHE-204ENST00000461075 JPH4Q96JJ6 628 aa25.27■■□□□ 1.64
TMLHE-204ENST00000461075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.26■■□□□ 1.63
TMLHE-204ENST00000461075 SHROOM2Q13796 1616 aa25.25■■□□□ 1.63
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