RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460900.1

CRIP1-204, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CRIP1, Length 1,443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-204ENST00000460900 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.54■■■■■ 6.48
CRIP1-204ENST00000460900 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.39■■■■■ 5.5
CRIP1-204ENST00000460900 ABCC9O60706 1549 aa48.47■■■■■ 5.35
CRIP1-204ENST00000460900 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.57■■■■■ 5.05
CRIP1-204ENST00000460900 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.56■■■■■ 5.04
CRIP1-204ENST00000460900 NACADO15069 1562 aa46.49■■■■■ 5.03
CRIP1-204ENST00000460900 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
CRIP1-204ENST00000460900 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.16■■■■■ 4.98
CRIP1-204ENST00000460900 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.92■■■■■ 4.94
CRIP1-204ENST00000460900 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.49■■■■■ 4.87
CRIP1-204ENST00000460900 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.31■■■■■ 4.84
CRIP1-204ENST00000460900 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.12■■■■■ 4.81
CRIP1-204ENST00000460900 SCRIBQ14160 1630 aa45.08■■■■■ 4.81
CRIP1-204ENST00000460900 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.65■■■■■ 4.74
CRIP1-204ENST00000460900 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.58■■■■■ 4.73
CRIP1-204ENST00000460900 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
CRIP1-204ENST00000460900 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.82■■■■■ 4.61
CRIP1-204ENST00000460900 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.56■■■■■ 4.56
CRIP1-204ENST00000460900 SMARCA4P51532 1647 aa43.1■■■■■ 4.49
CRIP1-204ENST00000460900 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
CRIP1-204ENST00000460900 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.91■■■■■ 4.46
CRIP1-204ENST00000460900 NCAPD3P42695 1498 aa42.89■■■■■ 4.46
CRIP1-204ENST00000460900 SMARCA2P51531 1590 aa42.86■■■■■ 4.45
CRIP1-204ENST00000460900 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.79■■■■■ 4.44
CRIP1-204ENST00000460900 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.66■■■■■ 4.42
CRIP1-204ENST00000460900 HMGXB3Q12766 1538 aa42.66■■■■■ 4.42
CRIP1-204ENST00000460900 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
CRIP1-204ENST00000460900 WIZO95785 1651 aa42.34■■■■■ 4.37
CRIP1-204ENST00000460900 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
CRIP1-204ENST00000460900 NESP48681 1621 aa41.9■■■■■ 4.3
CRIP1-204ENST00000460900 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
CRIP1-204ENST00000460900 ERCC6Q03468 1493 aa41.81■■■■■ 4.28
CRIP1-204ENST00000460900 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.78■■■■■ 4.28
CRIP1-204ENST00000460900 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.67■■■■■ 4.26
CRIP1-204ENST00000460900 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.54■■■■■ 4.24
CRIP1-204ENST00000460900 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.4■■■■■ 4.22
CRIP1-204ENST00000460900 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.4■■■■■ 4.22
CRIP1-204ENST00000460900 CFTRP13569 1480 aa41.38■■■■■ 4.21
CRIP1-204ENST00000460900 CUX2O14529 1486 aa41.36■■■■■ 4.21
CRIP1-204ENST00000460900 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
CRIP1-204ENST00000460900 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
CRIP1-204ENST00000460900 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.18■■■■■ 4.18
CRIP1-204ENST00000460900 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.14■■■■■ 4.18
CRIP1-204ENST00000460900 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.08■■■■■ 4.17
CRIP1-204ENST00000460900 PRDM2Q13029 1718 aa41.05■■■■■ 4.16
CRIP1-204ENST00000460900 WDR62O43379 1518 aa40.93■■■■■ 4.14
CRIP1-204ENST00000460900 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
CRIP1-204ENST00000460900 ABCC8Q09428 1581 aa40.52■■■■■ 4.08
CRIP1-204ENST00000460900 TOPBP1Q92547 1522 aa40.5■■■■■ 4.07
CRIP1-204ENST00000460900 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.44■■■■■ 4.06
CRIP1-204ENST00000460900 IFT140Q96RY7 1462 aa40.28■■■■■ 4.04
CRIP1-204ENST00000460900 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.25■■■■■ 4.03
CRIP1-204ENST00000460900 CUX1P39880 1505 aa40.15■■■■■ 4.02
CRIP1-204ENST00000460900 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
CRIP1-204ENST00000460900 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
CRIP1-204ENST00000460900 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.05■■■■■ 4
CRIP1-204ENST00000460900 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
CRIP1-204ENST00000460900 SOGA1O94964 1423 aa40.02■■■■■ 4
CRIP1-204ENST00000460900 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.99■■■■□ 3.99
CRIP1-204ENST00000460900 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
CRIP1-204ENST00000460900 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.98
CRIP1-204ENST00000460900 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.88■■■■□ 3.97
CRIP1-204ENST00000460900 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
CRIP1-204ENST00000460900 TOP2BQ02880 1626 aa39.78■■■■□ 3.96
CRIP1-204ENST00000460900 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.77■■■■□ 3.96
CRIP1-204ENST00000460900 SYNJ1O43426 1573 aa39.76■■■■□ 3.96
CRIP1-204ENST00000460900 WDR97A6NE52 1622 aa39.73■■■■□ 3.95
CRIP1-204ENST00000460900 OSCARQ8IYS5 282 aa39.7■■■■□ 3.95
CRIP1-204ENST00000460900 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.65■■■■□ 3.94
CRIP1-204ENST00000460900 GRIN2BQ13224 1484 aa39.54■■■■□ 3.92
CRIP1-204ENST00000460900 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.54■■■■□ 3.92
CRIP1-204ENST00000460900 FBLN2P98095 1184 aa39.49■■■■□ 3.91
CRIP1-204ENST00000460900 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.49■■■■□ 3.91
CRIP1-204ENST00000460900 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.47■■■■□ 3.91
CRIP1-204ENST00000460900 CHD1O14646 1710 aa39.45■■■■□ 3.91
CRIP1-204ENST00000460900 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
CRIP1-204ENST00000460900 PBRM1Q86U86 1689 aa39.43■■■■□ 3.9
CRIP1-204ENST00000460900 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
CRIP1-204ENST00000460900 SYNJ2O15056 1496 aa39.29■■■■□ 3.88
CRIP1-204ENST00000460900 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.18■■■■□ 3.86
CRIP1-204ENST00000460900 ADAMTS12P58397 1594 aa39.11■■■■□ 3.85
CRIP1-204ENST00000460900 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.08■■■■□ 3.85
CRIP1-204ENST00000460900 KIF27Q86VH2 1401 aa39.08■■■■□ 3.85
CRIP1-204ENST00000460900 GRIN2AQ12879 1464 aa39.02■■■■□ 3.84
CRIP1-204ENST00000460900 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39■■■■□ 3.83
CRIP1-204ENST00000460900 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39■■■■□ 3.83
CRIP1-204ENST00000460900 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39■■■■□ 3.83
CRIP1-204ENST00000460900 ARHGEF11O15085 1522 aa39■■■■□ 3.83
CRIP1-204ENST00000460900 CLASP1Q7Z460 1538 aa39■■■■□ 3.83
CRIP1-204ENST00000460900 TRIM41Q8WV44 630 aa38.95■■■■□ 3.83
CRIP1-204ENST00000460900 IGF1RP08069 1367 aa38.92■■■■□ 3.82
CRIP1-204ENST00000460900 NUP160Q12769 1436 aa38.84■■■■□ 3.81
CRIP1-204ENST00000460900 CEP170Q5SW79 1584 aa38.82■■■■□ 3.8
CRIP1-204ENST00000460900 CUL7Q14999 1698 aa38.8■■■■□ 3.8
CRIP1-204ENST00000460900 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.71■■■■□ 3.79
CRIP1-204ENST00000460900 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.7■■■■□ 3.79
CRIP1-204ENST00000460900 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.67■■■■□ 3.78
CRIP1-204ENST00000460900 ARAP1Q96P48 1450 aa38.66■■■■□ 3.78
CRIP1-204ENST00000460900 SHROOM2Q13796 1616 aa38.55■■■■□ 3.76
CRIP1-204ENST00000460900 JPH4Q96JJ6 628 aa38.51■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms