RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460473.1

MXRA8-204, Transcript of matrix remodeling associated 8, humanhuman

TSL 2

Gene MXRA8, Length 339 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8-204ENST00000460473 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.13■■■■■ 7.86
MXRA8-204ENST00000460473 ABCC9O60706 1549 aa57.92■■■■■ 6.86
MXRA8-204ENST00000460473 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.75■■■■■ 6.83
MXRA8-204ENST00000460473 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.1■■■■■ 6.41
MXRA8-204ENST00000460473 NACADO15069 1562 aa54.63■■■■■ 6.34
MXRA8-204ENST00000460473 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.42■■■■■ 6.3
MXRA8-204ENST00000460473 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.26■■■■■ 6.28
MXRA8-204ENST00000460473 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.84■■■■■ 6.21
MXRA8-204ENST00000460473 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.8■■■■■ 6.2
MXRA8-204ENST00000460473 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.78■■■■■ 6.2
MXRA8-204ENST00000460473 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.39■■■■■ 6.14
MXRA8-204ENST00000460473 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.1■■■■■ 6.09
MXRA8-204ENST00000460473 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.98■■■■■ 6.07
MXRA8-204ENST00000460473 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.78■■■■■ 6.04
MXRA8-204ENST00000460473 SCRIBQ14160 1630 aa52.57■■■■■ 6.01
MXRA8-204ENST00000460473 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.33■■■■■ 5.97
MXRA8-204ENST00000460473 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.24■■■■■ 5.95
MXRA8-204ENST00000460473 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.17■■■■■ 5.94
MXRA8-204ENST00000460473 NCAPD3P42695 1498 aa50.38■■■■■ 5.66
MXRA8-204ENST00000460473 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.27■■■■■ 5.64
MXRA8-204ENST00000460473 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.19■■■■■ 5.62
MXRA8-204ENST00000460473 ERCC6Q03468 1493 aa50.13■■■■■ 5.62
MXRA8-204ENST00000460473 SMARCA2P51531 1590 aa50.12■■■■■ 5.61
MXRA8-204ENST00000460473 SMARCA4P51532 1647 aa50.11■■■■■ 5.61
MXRA8-204ENST00000460473 CUX2O14529 1486 aa50.1■■■■■ 5.61
MXRA8-204ENST00000460473 HMGXB3Q12766 1538 aa50.05■■■■■ 5.6
MXRA8-204ENST00000460473 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.85■■■■■ 5.57
MXRA8-204ENST00000460473 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.76■■■■■ 5.56
MXRA8-204ENST00000460473 NESP48681 1621 aa49.64■■■■■ 5.54
MXRA8-204ENST00000460473 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.62■■■■■ 5.53
MXRA8-204ENST00000460473 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.37■■■■■ 5.49
MXRA8-204ENST00000460473 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.36■■■■■ 5.49
MXRA8-204ENST00000460473 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
MXRA8-204ENST00000460473 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.09■■■■■ 5.45
MXRA8-204ENST00000460473 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.08■■■■■ 5.45
MXRA8-204ENST00000460473 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.85■■■■■ 5.41
MXRA8-204ENST00000460473 WIZO95785 1651 aa48.8■■■■■ 5.4
MXRA8-204ENST00000460473 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.66■■■■■ 5.38
MXRA8-204ENST00000460473 WDR62O43379 1518 aa48.54■■■■■ 5.36
MXRA8-204ENST00000460473 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.43■■■■■ 5.34
MXRA8-204ENST00000460473 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.32■■■■■ 5.33
MXRA8-204ENST00000460473 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.24■■■■■ 5.31
MXRA8-204ENST00000460473 CFTRP13569 1480 aa48.23■■■■■ 5.31
MXRA8-204ENST00000460473 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
MXRA8-204ENST00000460473 TRIM41Q8WV44 630 aa48.02■■■■■ 5.28
MXRA8-204ENST00000460473 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
MXRA8-204ENST00000460473 PRDM2Q13029 1718 aa47.84■■■■■ 5.25
MXRA8-204ENST00000460473 OSCARQ8IYS5 282 aa47.72■■■■■ 5.23
MXRA8-204ENST00000460473 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.6■■■■■ 5.21
MXRA8-204ENST00000460473 IFT140Q96RY7 1462 aa47.46■■■■■ 5.19
MXRA8-204ENST00000460473 TOPBP1Q92547 1522 aa47.36■■■■■ 5.17
MXRA8-204ENST00000460473 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.34■■■■■ 5.17
MXRA8-204ENST00000460473 ABCC8Q09428 1581 aa47.31■■■■■ 5.16
MXRA8-204ENST00000460473 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.2■■■■■ 5.15
MXRA8-204ENST00000460473 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.15■■■■■ 5.14
MXRA8-204ENST00000460473 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.15■■■■■ 5.14
MXRA8-204ENST00000460473 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.15■■■■■ 5.14
MXRA8-204ENST00000460473 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
MXRA8-204ENST00000460473 ARHGEF11O15085 1522 aa46.97■■■■■ 5.11
MXRA8-204ENST00000460473 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
MXRA8-204ENST00000460473 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.89■■■■■ 5.1
MXRA8-204ENST00000460473 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
MXRA8-204ENST00000460473 CHD1O14646 1710 aa46.85■■■■■ 5.09
MXRA8-204ENST00000460473 FBLN2P98095 1184 aa46.69■■■■■ 5.06
MXRA8-204ENST00000460473 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.66■■■■■ 5.06
MXRA8-204ENST00000460473 SOGA1O94964 1423 aa46.64■■■■■ 5.06
MXRA8-204ENST00000460473 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.61■■■■■ 5.05
MXRA8-204ENST00000460473 WDR97A6NE52 1622 aa46.56■■■■■ 5.04
MXRA8-204ENST00000460473 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
MXRA8-204ENST00000460473 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.54■■■■■ 5.04
MXRA8-204ENST00000460473 ARAP1Q96P48 1450 aa46.45■■■■■ 5.03
MXRA8-204ENST00000460473 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.44■■■■■ 5.03
MXRA8-204ENST00000460473 CUX1P39880 1505 aa46.43■■■■■ 5.02
MXRA8-204ENST00000460473 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.35■■■■■ 5.01
MXRA8-204ENST00000460473 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
MXRA8-204ENST00000460473 GRIN2BQ13224 1484 aa46.3■■■■■ 5
MXRA8-204ENST00000460473 SYNJ1O43426 1573 aa46.3■■■■■ 5
MXRA8-204ENST00000460473 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.26■■■■■ 5
MXRA8-204ENST00000460473 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.24■■■■■ 4.99
MXRA8-204ENST00000460473 SYNJ2O15056 1496 aa46.19■■■■■ 4.98
MXRA8-204ENST00000460473 PBRM1Q86U86 1689 aa46.14■■■■■ 4.98
MXRA8-204ENST00000460473 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.1■■■■■ 4.97
MXRA8-204ENST00000460473 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46■■■■■ 4.95
MXRA8-204ENST00000460473 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.96■■■■■ 4.95
MXRA8-204ENST00000460473 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
MXRA8-204ENST00000460473 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.78■■■■■ 4.92
MXRA8-204ENST00000460473 GRIN2AQ12879 1464 aa45.7■■■■■ 4.91
MXRA8-204ENST00000460473 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.67■■■■■ 4.9
MXRA8-204ENST00000460473 ADAMTS12P58397 1594 aa45.66■■■■■ 4.9
MXRA8-204ENST00000460473 TOP2BQ02880 1626 aa45.66■■■■■ 4.9
MXRA8-204ENST00000460473 NUP160Q12769 1436 aa45.52■■■■■ 4.88
MXRA8-204ENST00000460473 CEP170Q5SW79 1584 aa45.52■■■■■ 4.88
MXRA8-204ENST00000460473 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.5■■■■■ 4.87
MXRA8-204ENST00000460473 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.47■■■■■ 4.87
MXRA8-204ENST00000460473 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.45■■■■■ 4.87
MXRA8-204ENST00000460473 SHROOM2Q13796 1616 aa45.37■■■■■ 4.85
MXRA8-204ENST00000460473 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
MXRA8-204ENST00000460473 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
MXRA8-204ENST00000460473 JPH4Q96JJ6 628 aa45.04■■■■■ 4.8
MXRA8-204ENST00000460473 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.01■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms