RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459724.1

ZFX-207, Transcript of zinc finger protein X-linked, humanhuman

TSL 5

Gene ZFX, Length 673 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFX-207ENST00000459724 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.3■■■■■ 6.76
ZFX-207ENST00000459724 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.11■■■■■ 5.77
ZFX-207ENST00000459724 ABCC9O60706 1549 aa50.71■■■■■ 5.71
ZFX-207ENST00000459724 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.39■■■■■ 5.34
ZFX-207ENST00000459724 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.21■■■■■ 5.31
ZFX-207ENST00000459724 NACADO15069 1562 aa48.17■■■■■ 5.3
ZFX-207ENST00000459724 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
ZFX-207ENST00000459724 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.63■■■■■ 5.22
ZFX-207ENST00000459724 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.37■■■■■ 5.17
ZFX-207ENST00000459724 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.32■■■■■ 5.17
ZFX-207ENST00000459724 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.27■■■■■ 5.16
ZFX-207ENST00000459724 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.04■■■■■ 5.12
ZFX-207ENST00000459724 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.03■■■■■ 5.12
ZFX-207ENST00000459724 SCRIBQ14160 1630 aa46.78■■■■■ 5.08
ZFX-207ENST00000459724 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.28■■■■■ 5
ZFX-207ENST00000459724 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.81■■■■■ 4.92
ZFX-207ENST00000459724 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.78■■■■■ 4.92
ZFX-207ENST00000459724 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.55■■■■■ 4.88
ZFX-207ENST00000459724 SMARCA4P51532 1647 aa44.61■■■■■ 4.73
ZFX-207ENST00000459724 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.48■■■■■ 4.71
ZFX-207ENST00000459724 NCAPD3P42695 1498 aa44.47■■■■■ 4.71
ZFX-207ENST00000459724 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
ZFX-207ENST00000459724 SMARCA2P51531 1590 aa44.34■■■■■ 4.69
ZFX-207ENST00000459724 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.23■■■■■ 4.67
ZFX-207ENST00000459724 HMGXB3Q12766 1538 aa44.22■■■■■ 4.67
ZFX-207ENST00000459724 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
ZFX-207ENST00000459724 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.09■■■■■ 4.65
ZFX-207ENST00000459724 NESP48681 1621 aa43.75■■■■■ 4.59
ZFX-207ENST00000459724 WIZO95785 1651 aa43.75■■■■■ 4.59
ZFX-207ENST00000459724 ERCC6Q03468 1493 aa43.69■■■■■ 4.58
ZFX-207ENST00000459724 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
ZFX-207ENST00000459724 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.38■■■■■ 4.54
ZFX-207ENST00000459724 CUX2O14529 1486 aa43.32■■■■■ 4.53
ZFX-207ENST00000459724 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
ZFX-207ENST00000459724 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.17■■■■■ 4.5
ZFX-207ENST00000459724 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.16■■■■■ 4.5
ZFX-207ENST00000459724 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
ZFX-207ENST00000459724 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.11■■■■■ 4.49
ZFX-207ENST00000459724 CFTRP13569 1480 aa42.81■■■■■ 4.44
ZFX-207ENST00000459724 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.76■■■■■ 4.44
ZFX-207ENST00000459724 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.74■■■■■ 4.43
ZFX-207ENST00000459724 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.71■■■■■ 4.43
ZFX-207ENST00000459724 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.7■■■■■ 4.43
ZFX-207ENST00000459724 WDR62O43379 1518 aa42.64■■■■■ 4.42
ZFX-207ENST00000459724 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.63■■■■■ 4.41
ZFX-207ENST00000459724 PRDM2Q13029 1718 aa42.43■■■■■ 4.38
ZFX-207ENST00000459724 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
ZFX-207ENST00000459724 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
ZFX-207ENST00000459724 TOPBP1Q92547 1522 aa42■■■■■ 4.31
ZFX-207ENST00000459724 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.88■■■■■ 4.29
ZFX-207ENST00000459724 ABCC8Q09428 1581 aa41.8■■■■■ 4.28
ZFX-207ENST00000459724 IFT140Q96RY7 1462 aa41.8■■■■■ 4.28
ZFX-207ENST00000459724 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
ZFX-207ENST00000459724 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
ZFX-207ENST00000459724 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
ZFX-207ENST00000459724 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
ZFX-207ENST00000459724 CUX1P39880 1505 aa41.53■■■■■ 4.24
ZFX-207ENST00000459724 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.51■■■■■ 4.24
ZFX-207ENST00000459724 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.233e-7■■■■■ 36.8
ZFX-207ENST00000459724 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.46■■■■■ 4.23
ZFX-207ENST00000459724 OSCARQ8IYS5 282 aa41.44■■■■■ 4.22
ZFX-207ENST00000459724 SOGA1O94964 1423 aa41.4■■■■■ 4.22
ZFX-207ENST00000459724 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
ZFX-207ENST00000459724 TRIM41Q8WV44 630 aa41.16■■■■■ 4.18
ZFX-207ENST00000459724 CHD1O14646 1710 aa41.14■■■■■ 4.18
ZFX-207ENST00000459724 WDR97A6NE52 1622 aa41.11■■■■■ 4.17
ZFX-207ENST00000459724 FBLN2P98095 1184 aa41.07■■■■■ 4.17
ZFX-207ENST00000459724 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.07■■■■■ 4.16
ZFX-207ENST00000459724 SYNJ1O43426 1573 aa41.01■■■■■ 4.16
ZFX-207ENST00000459724 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.156e-7■■■■■ 33.4
ZFX-207ENST00000459724 GRIN2BQ13224 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
ZFX-207ENST00000459724 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.96■■■■■ 4.15
ZFX-207ENST00000459724 TOP2BQ02880 1626 aa40.96■■■■■ 4.15
ZFX-207ENST00000459724 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.96■■■■■ 4.15
ZFX-207ENST00000459724 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
ZFX-207ENST00000459724 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
ZFX-207ENST00000459724 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.93■■■■■ 4.14
ZFX-207ENST00000459724 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.92■■■■■ 4.14
ZFX-207ENST00000459724 PBRM1Q86U86 1689 aa40.89■■■■■ 4.14
ZFX-207ENST00000459724 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
ZFX-207ENST00000459724 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.89■■■■■ 4.14
ZFX-207ENST00000459724 ARHGEF11O15085 1522 aa40.86■■■■■ 4.13
ZFX-207ENST00000459724 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
ZFX-207ENST00000459724 SYNJ2O15056 1496 aa40.76■■■■■ 4.12
ZFX-207ENST00000459724 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.65■■■■■ 4.1
ZFX-207ENST00000459724 ADAMTS12P58397 1594 aa40.56■■■■■ 4.08
ZFX-207ENST00000459724 ARAP1Q96P48 1450 aa40.52■■■■■ 4.08
ZFX-207ENST00000459724 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.52■■■■■ 4.08
ZFX-207ENST00000459724 GRIN2AQ12879 1464 aa40.46■■■■■ 4.07
ZFX-207ENST00000459724 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.43■■■■■ 4.06
ZFX-207ENST00000459724 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.4■■■■■ 4.06
ZFX-207ENST00000459724 CEP170Q5SW79 1584 aa40.34■■■■■ 4.05
ZFX-207ENST00000459724 NUP160Q12769 1436 aa40.29■■■■■ 4.04
ZFX-207ENST00000459724 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.17■■■■■ 4.02
ZFX-207ENST00000459724 KIF27Q86VH2 1401 aa40.16■■■■■ 4.02
ZFX-207ENST00000459724 IGF1RP08069 1367 aa40.09■■■■■ 4.01
ZFX-207ENST00000459724 SHROOM2Q13796 1616 aa40.04■■■■■ 4
ZFX-207ENST00000459724 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.97■■■■□ 3.99
ZFX-207ENST00000459724 CUL7Q14999 1698 aa39.96■■■■□ 3.99
ZFX-207ENST00000459724 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms