RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.12■□□□□ 0.97
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SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-204ENST00000459646 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-204ENST00000459646 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-204ENST00000459646 NACADO15069 1562 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.84■□□□□ 0.45
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SH3BP1-204ENST00000459646 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-204ENST00000459646 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.54■□□□□ 0.4
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SH3BP1-204ENST00000459646 SCRIBQ14160 1630 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-204ENST00000459646 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP1-204ENST00000459646 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-204ENST00000459646 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1-204ENST00000459646 SMARCA4P51532 1647 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-204ENST00000459646 NCAPD3P42695 1498 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-204ENST00000459646 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-204ENST00000459646 SMARCA2P51531 1590 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-204ENST00000459646 ERCC6Q03468 1493 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-204ENST00000459646 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
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SH3BP1-204ENST00000459646 HMGXB3Q12766 1538 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP1-204ENST00000459646 NESP48681 1621 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-204ENST00000459646 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-204ENST00000459646 CUX2O14529 1486 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-204ENST00000459646 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-204ENST00000459646 WIZO95785 1651 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-204ENST00000459646 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-204ENST00000459646 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1-204ENST00000459646 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SH3BP1-204ENST00000459646 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1-204ENST00000459646 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-204ENST00000459646 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BP1-204ENST00000459646 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SH3BP1-204ENST00000459646 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.87■□□□□ 0.13
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR62O43379 1518 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-204ENST00000459646 CFTRP13569 1480 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-204ENST00000459646 PRDM2Q13029 1718 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM41Q8WV44 630 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-204ENST00000459646 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-204ENST00000459646 OSCARQ8IYS5 282 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1-204ENST00000459646 TOPBP1Q92547 1522 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP1-204ENST00000459646 IFT140Q96RY7 1462 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCC8Q09428 1581 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1-204ENST00000459646 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-204ENST00000459646 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP1-204ENST00000459646 FBLN2P98095 1184 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
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SH3BP1-204ENST00000459646 CHD1O14646 1710 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-204ENST00000459646 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-204ENST00000459646 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP1-204ENST00000459646 SOGA1O94964 1423 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-204ENST00000459646 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-204ENST00000459646 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-204ENST00000459646 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP1-204ENST00000459646 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP1-204ENST00000459646 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.33■□□□□ 0.05
SH3BP1-204ENST00000459646 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.32■□□□□ 0.04
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGEF11O15085 1522 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP1-204ENST00000459646 CUX1P39880 1505 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-204ENST00000459646 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-204ENST00000459646 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.25■□□□□ 0.03
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SH3BP1-204ENST00000459646 WDR97A6NE52 1622 aa15.21■□□□□ 0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 GRIN2BQ13224 1484 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 SYNJ1O43426 1573 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 SYNJ2O15056 1496 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-204ENST00000459646 ARAP1Q96P48 1450 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP1-204ENST00000459646 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP1-204ENST00000459646 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.1■□□□□ 0.01
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SH3BP1-204ENST00000459646 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP1-204ENST00000459646 GRIN2AQ12879 1464 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAMTS12P58397 1594 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP1-204ENST00000459646 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP170Q5SW79 1584 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 NUP160Q12769 1436 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP1-204ENST00000459646 JPH4Q96JJ6 628 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-204ENST00000459646 SHROOM2Q13796 1616 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP1-204ENST00000459646 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP1-204ENST00000459646 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF27Q86VH2 1401 aa14.82□□□□□ -0.04
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