RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457837.5

BCAP29-208, Transcript of B cell receptor associated protein 29, human

TSL 5

Gene BCAP29, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCAP29-208	ENST00000457837	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.41	■■■■■ 6.46
BCAP29-208	ENST00000457837	ABCC9	O60706	1549 aa		49.97	■■■■■ 5.59
BCAP29-208	ENST00000457837	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.85	■■■■■ 5.57
BCAP29-208	ENST00000457837	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.5	■■■■■ 5.19
BCAP29-208	ENST00000457837	NACAD	O15069	1562 aa		47.14	■■■■■ 5.14
BCAP29-208	ENST00000457837	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		47.05	■■■■■ 5.12
BCAP29-208	ENST00000457837	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.76	■■■■■ 5.08
BCAP29-208	ENST00000457837	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.51	■■■■■ 5.04
BCAP29-208	ENST00000457837	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.47	■■■■■ 5.03
BCAP29-208	ENST00000457837	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.44	■■■■■ 5.02
BCAP29-208	ENST00000457837	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.17	■■■■■ 4.98
BCAP29-208	ENST00000457837	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	45.89	■■■■■ 4.94
BCAP29-208	ENST00000457837	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		45.77	■■■■■ 4.92
BCAP29-208	ENST00000457837	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.49	■■■■■ 4.87
BCAP29-208	ENST00000457837	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.37	■■■■■ 4.85
BCAP29-208	ENST00000457837	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.17	■■■■■ 4.82
BCAP29-208	ENST00000457837	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.04	■■■■■ 4.8
BCAP29-208	ENST00000457837	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.03	■■■■■ 4.8
BCAP29-208	ENST00000457837	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.51	■■■■■ 4.56
BCAP29-208	ENST00000457837	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.35	■■■■■ 4.53
BCAP29-208	ENST00000457837	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.33	■■■■■ 4.53
BCAP29-208	ENST00000457837	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.29	■■■■■ 4.52
BCAP29-208	ENST00000457837	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.23	■■■■■ 4.51
BCAP29-208	ENST00000457837	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.18	■■■■■ 4.5
BCAP29-208	ENST00000457837	CUX2	O14529	1486 aa		43.16	■■■■■ 4.5
BCAP29-208	ENST00000457837	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.14	■■■■■ 4.5
BCAP29-208	ENST00000457837	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
BCAP29-208	ENST00000457837	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
BCAP29-208	ENST00000457837	NES	P48681	1621 aa		42.89	■■■■■ 4.46
BCAP29-208	ENST00000457837	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.88	■■■■■ 4.45
BCAP29-208	ENST00000457837	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		42.7	■■■■■ 4.43
BCAP29-208	ENST00000457837	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.58	■■■■■ 4.41
BCAP29-208	ENST00000457837	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
BCAP29-208	ENST00000457837	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.38	■■■■■ 4.37
BCAP29-208	ENST00000457837	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.3	■■■■■ 4.36
BCAP29-208	ENST00000457837	WIZ	O95785	1651 aa		42.19	■■■■■ 4.34
BCAP29-208	ENST00000457837	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.16	■■■■■ 4.34
BCAP29-208	ENST00000457837	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.96	■■■■■ 4.31
BCAP29-208	ENST00000457837	WDR62	O43379	1518 aa		41.89	■■■■■ 4.3
BCAP29-208	ENST00000457837	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.76	■■■■■ 4.28
BCAP29-208	ENST00000457837	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	41.73	■■■■■ 4.27
BCAP29-208	ENST00000457837	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.69	■■■■■ 4.26
BCAP29-208	ENST00000457837	CFTR	P13569	1480 aa		41.66	■■■■■ 4.26
BCAP29-208	ENST00000457837	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	41.64	■■■■■ 4.26
BCAP29-208	ENST00000457837	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.39	■■■■■ 4.22
BCAP29-208	ENST00000457837	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.32	■■■■■ 4.21
BCAP29-208	ENST00000457837	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.3	■■■■■ 4.2
BCAP29-208	ENST00000457837	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.15	■■■■■ 4.18
BCAP29-208	ENST00000457837	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.11	■■■■■ 4.17
BCAP29-208	ENST00000457837	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.92	■■■■■ 4.14
BCAP29-208	ENST00000457837	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.89	■■■■■ 4.14
BCAP29-208	ENST00000457837	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
BCAP29-208	ENST00000457837	ABCC8	Q09428	1581 aa		40.78	■■■■■ 4.12
BCAP29-208	ENST00000457837	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.74	■■■■■ 4.11
BCAP29-208	ENST00000457837	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
BCAP29-208	ENST00000457837	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.67	■■■■■ 4.1
BCAP29-208	ENST00000457837	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.67	■■■■■ 4.1
BCAP29-208	ENST00000457837	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.67	■■■■■ 4.1
BCAP29-208	ENST00000457837	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
BCAP29-208	ENST00000457837	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.51	■■■■■ 4.08
BCAP29-208	ENST00000457837	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.48	■■■■■ 4.07
BCAP29-208	ENST00000457837	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
BCAP29-208	ENST00000457837	CHD1	O14646	1710 aa		40.44	■■■■■ 4.06
BCAP29-208	ENST00000457837	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.32	■■■■■ 4.04
BCAP29-208	ENST00000457837	SOGA1	O94964	1423 aa		40.25	■■■■■ 4.03
BCAP29-208	ENST00000457837	FBLN2	P98095	1184 aa		40.21	■■■■■ 4.03
BCAP29-208	ENST00000457837	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
BCAP29-208	ENST00000457837	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.18	■■■■■ 4.02
BCAP29-208	ENST00000457837	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.17	■■■■■ 4.02
BCAP29-208	ENST00000457837	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.15	■■■■■ 4.02
BCAP29-208	ENST00000457837	CUX1	P39880	1505 aa		40.13	■■■■■ 4.01
BCAP29-208	ENST00000457837	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.09	■■■■■ 4.01
BCAP29-208	ENST00000457837	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.07	■■■■■ 4.01
BCAP29-208	ENST00000457837	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	39.96	■■■■□ 3.99
BCAP29-208	ENST00000457837	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.96	■■■■□ 3.99
BCAP29-208	ENST00000457837	GRIN2B	Q13224	1484 aa		39.94	■■■■□ 3.98
BCAP29-208	ENST00000457837	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.89	■■■■□ 3.98
BCAP29-208	ENST00000457837	SYNJ1	O43426	1573 aa		39.89	■■■■□ 3.98
BCAP29-208	ENST00000457837	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.83	■■■■□ 3.97
BCAP29-208	ENST00000457837	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.83	■■■■□ 3.97
BCAP29-208	ENST00000457837	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.77	■■■■□ 3.96
BCAP29-208	ENST00000457837	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.77	■■■■□ 3.96
BCAP29-208	ENST00000457837	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.71	■■■■□ 3.95
BCAP29-208	ENST00000457837	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.71	■■■■□ 3.95
BCAP29-208	ENST00000457837	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	39.68	■■■■□ 3.94
BCAP29-208	ENST00000457837	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	39.49	■■■■□ 3.91
BCAP29-208	ENST00000457837	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		39.47	■■■■□ 3.91
BCAP29-208	ENST00000457837	TOP2B	Q02880	1626 aa		39.44	■■■■□ 3.9
BCAP29-208	ENST00000457837	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.43	■■■■□ 3.9
BCAP29-208	ENST00000457837	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.42	■■■■□ 3.9
BCAP29-208	ENST00000457837	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.33	■■■■□ 3.89
BCAP29-208	ENST00000457837	NUP160	Q12769	1436 aa		39.31	■■■■□ 3.88
BCAP29-208	ENST00000457837	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.31	■■■■□ 3.88
BCAP29-208	ENST00000457837	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.25	■■■■□ 3.87
BCAP29-208	ENST00000457837	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.22	■■■■□ 3.87
BCAP29-208	ENST00000457837	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.2	■■■■□ 3.87
BCAP29-208	ENST00000457837	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	38.93	■■■■□ 3.82
BCAP29-208	ENST00000457837	JPH4	Q96JJ6	628 aa		38.87	■■■■□ 3.81
BCAP29-208	ENST00000457837	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		38.87	■■■■□ 3.81
BCAP29-208	ENST00000457837	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		38.79	■■■■□ 3.8

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