RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457633.1

PRKRA-205, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, humanhuman

TSL 3

Gene PRKRA, Length 942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRA-205ENST00000457633 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.81■■■■■ 6.2
PRKRA-205ENST00000457633 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.85■■■■■ 5.25
PRKRA-205ENST00000457633 ABCC9O60706 1549 aa47■■■■■ 5.11
PRKRA-205ENST00000457633 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.1■■■■■ 4.81
PRKRA-205ENST00000457633 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.08■■■■■ 4.81
PRKRA-205ENST00000457633 NACADO15069 1562 aa44.99■■■■■ 4.79
PRKRA-205ENST00000457633 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
PRKRA-205ENST00000457633 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.61■■■■■ 4.73
PRKRA-205ENST00000457633 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.43■■■■■ 4.7
PRKRA-205ENST00000457633 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.2■■■■■ 4.67
PRKRA-205ENST00000457633 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.94■■■■■ 4.62
PRKRA-205ENST00000457633 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.79■■■■■ 4.6
PRKRA-205ENST00000457633 SCRIBQ14160 1630 aa43.77■■■■■ 4.6
PRKRA-205ENST00000457633 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.25■■■■■ 4.51
PRKRA-205ENST00000457633 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.13■■■■■ 4.5
PRKRA-205ENST00000457633 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
PRKRA-205ENST00000457633 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.49■■■■■ 4.39
PRKRA-205ENST00000457633 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.18■■■■■ 4.34
PRKRA-205ENST00000457633 SMARCA4P51532 1647 aa41.8■■■■■ 4.28
PRKRA-205ENST00000457633 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
PRKRA-205ENST00000457633 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.56■■■■■ 4.24
PRKRA-205ENST00000457633 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.53■■■■■ 4.24
PRKRA-205ENST00000457633 NCAPD3P42695 1498 aa41.51■■■■■ 4.24
PRKRA-205ENST00000457633 SMARCA2P51531 1590 aa41.47■■■■■ 4.23
PRKRA-205ENST00000457633 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.32■■■■■ 4.2
PRKRA-205ENST00000457633 HMGXB3Q12766 1538 aa41.29■■■■■ 4.2
PRKRA-205ENST00000457633 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
PRKRA-205ENST00000457633 WIZO95785 1651 aa41.11■■■■■ 4.17
PRKRA-205ENST00000457633 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PRKRA-205ENST00000457633 NESP48681 1621 aa40.67■■■■■ 4.1
PRKRA-205ENST00000457633 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
PRKRA-205ENST00000457633 ERCC6Q03468 1493 aa40.46■■■■■ 4.07
PRKRA-205ENST00000457633 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.44■■■■■ 4.06
PRKRA-205ENST00000457633 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.32■■■■■ 4.04
PRKRA-205ENST00000457633 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.19■■■■■ 4.02
PRKRA-205ENST00000457633 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.16■■■■■ 4.02
PRKRA-205ENST00000457633 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.13■■■■■ 4.02
PRKRA-205ENST00000457633 CFTRP13569 1480 aa40.06■■■■■ 4
PRKRA-205ENST00000457633 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
PRKRA-205ENST00000457633 CUX2O14529 1486 aa40■■■■□ 3.99
PRKRA-205ENST00000457633 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
PRKRA-205ENST00000457633 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.88■■■■□ 3.98
PRKRA-205ENST00000457633 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.83■■■■□ 3.97
PRKRA-205ENST00000457633 PRDM2Q13029 1718 aa39.81■■■■□ 3.96
PRKRA-205ENST00000457633 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.79■■■■□ 3.96
PRKRA-205ENST00000457633 WDR62O43379 1518 aa39.65■■■■□ 3.94
PRKRA-205ENST00000457633 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
PRKRA-205ENST00000457633 TOPBP1Q92547 1522 aa39.24■■■■□ 3.87
PRKRA-205ENST00000457633 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.18■■■■□ 3.86
PRKRA-205ENST00000457633 ABCC8Q09428 1581 aa39.14■■■■□ 3.86
PRKRA-205ENST00000457633 IFT140Q96RY7 1462 aa38.98■■■■□ 3.83
PRKRA-205ENST00000457633 CUX1P39880 1505 aa38.95■■■■□ 3.83
PRKRA-205ENST00000457633 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.92■■■■□ 3.82
PRKRA-205ENST00000457633 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
PRKRA-205ENST00000457633 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
PRKRA-205ENST00000457633 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
PRKRA-205ENST00000457633 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.81■■■■□ 3.8
PRKRA-205ENST00000457633 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.79■■■■□ 3.8
PRKRA-205ENST00000457633 SOGA1O94964 1423 aa38.74■■■■□ 3.79
PRKRA-205ENST00000457633 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
PRKRA-205ENST00000457633 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.66■■■■□ 3.783e-6■■■■□ 24.7
PRKRA-205ENST00000457633 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.63■■■■□ 3.77
PRKRA-205ENST00000457633 SYNJ1O43426 1573 aa38.61■■■■□ 3.77
PRKRA-205ENST00000457633 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.77
PRKRA-205ENST00000457633 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.57■■■■□ 3.77
PRKRA-205ENST00000457633 TOP2BQ02880 1626 aa38.56■■■■□ 3.76
PRKRA-205ENST00000457633 WDR97A6NE52 1622 aa38.51■■■■□ 3.76
PRKRA-205ENST00000457633 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.38■■■■□ 3.74
PRKRA-205ENST00000457633 OSCARQ8IYS5 282 aa38.37■■■■□ 3.73
PRKRA-205ENST00000457633 CHD1O14646 1710 aa38.3■■■■□ 3.72
PRKRA-205ENST00000457633 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.29■■■■□ 3.72
PRKRA-205ENST00000457633 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.28■■■■□ 3.72
PRKRA-205ENST00000457633 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.28■■■■□ 3.72
PRKRA-205ENST00000457633 GRIN2BQ13224 1484 aa38.28■■■■□ 3.72
PRKRA-205ENST00000457633 PBRM1Q86U86 1689 aa38.27■■■■□ 3.72
PRKRA-205ENST00000457633 FBLN2P98095 1184 aa38.23■■■■□ 3.71
PRKRA-205ENST00000457633 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
PRKRA-205ENST00000457633 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
PRKRA-205ENST00000457633 SYNJ2O15056 1496 aa38.03■■■■□ 3.68
PRKRA-205ENST00000457633 ADAMTS12P58397 1594 aa37.93■■■■□ 3.66
PRKRA-205ENST00000457633 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.92■■■■□ 3.66
PRKRA-205ENST00000457633 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.83■■■■□ 3.65
PRKRA-205ENST00000457633 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.83■■■■□ 3.65
PRKRA-205ENST00000457633 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.83■■■■□ 3.65
PRKRA-205ENST00000457633 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.81■■■■□ 3.64
PRKRA-205ENST00000457633 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.81■■■■□ 3.64
PRKRA-205ENST00000457633 KIF27Q86VH2 1401 aa37.8■■■■□ 3.64
PRKRA-205ENST00000457633 GRIN2AQ12879 1464 aa37.8■■■■□ 3.64
PRKRA-205ENST00000457633 ARHGEF11O15085 1522 aa37.78■■■■□ 3.64
PRKRA-205ENST00000457633 TRIM41Q8WV44 630 aa37.71■■■■□ 3.63
PRKRA-205ENST00000457633 IGF1RP08069 1367 aa37.69■■■■□ 3.62
PRKRA-205ENST00000457633 CEP170Q5SW79 1584 aa37.67■■■■□ 3.62
PRKRA-205ENST00000457633 NUP160Q12769 1436 aa37.61■■■■□ 3.61
PRKRA-205ENST00000457633 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.57■■■■□ 3.61
PRKRA-205ENST00000457633 CUL7Q14999 1698 aa37.57■■■■□ 3.61
PRKRA-205ENST00000457633 ARAP1Q96P48 1450 aa37.48■■■■□ 3.59
PRKRA-205ENST00000457633 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.47■■■■□ 3.59
PRKRA-205ENST00000457633 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.46■■■■□ 3.59
PRKRA-205ENST00000457633 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.37■■■■□ 3.57
PRKRA-205ENST00000457633 SHROOM2Q13796 1616 aa37.36■■■■□ 3.57
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