RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457387.1

CCDC18-AS1-223, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 806 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.13■■■□□ 2.89
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ABCC9O60706 1549 aa30.47■■■□□ 2.47
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.96■■■□□ 2.39
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.05■■■□□ 2.24
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.75■■■□□ 2.19
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NACADO15069 1562 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.15■■■□□ 2.1
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.08■■■□□ 2.09
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 BICRAQ9NZM4 1560 aa28■■■□□ 2.07
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.51■■□□□ 1.99
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.5■■□□□ 1.99
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.49■■□□□ 1.99
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.32■■□□□ 1.96
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SCRIBQ14160 1630 aa27.3■■□□□ 1.96
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.98■■□□□ 1.91
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CUX2O14529 1486 aa26.44■■□□□ 1.82
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ERCC6Q03468 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NCAPD3P42695 1498 aa26.25■■□□□ 1.79
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.12■■□□□ 1.77
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NESP48681 1621 aa26.06■■□□□ 1.76
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 HMGXB3Q12766 1538 aa26.03■■□□□ 1.76
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SMARCA2P51531 1590 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SMARCA4P51532 1647 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.74■■□□□ 1.71
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.73■■□□□ 1.71
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.69■■□□□ 1.7
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TRIM41Q8WV44 630 aa25.59■■□□□ 1.69
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.57■■□□□ 1.68
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.56■■□□□ 1.68
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.43■■□□□ 1.66
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 WDR62O43379 1518 aa25.42■■□□□ 1.66
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 WIZO95785 1651 aa25.22■■□□□ 1.63
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.15■■□□□ 1.62
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 OSCARQ8IYS5 282 aa25.07■■□□□ 1.6
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CFTRP13569 1480 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ARHGEF11O15085 1522 aa24.79■■□□□ 1.56
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PRDM2Q13029 1718 aa24.75■■□□□ 1.55
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 IFT140Q96RY7 1462 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TOPBP1Q92547 1522 aa24.63■■□□□ 1.53
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.57■■□□□ 1.52
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.55■■□□□ 1.52
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CHD1O14646 1710 aa24.52■■□□□ 1.52
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ARAP1Q96P48 1450 aa24.52■■□□□ 1.52
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ABCC8Q09428 1581 aa24.46■■□□□ 1.51
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 FBLN2P98095 1184 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.27■■□□□ 1.48
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.25■■□□□ 1.47
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.22■■□□□ 1.47
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SOGA1O94964 1423 aa24.18■■□□□ 1.46
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SYNJ1O43426 1573 aa24.14■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 WDR97A6NE52 1622 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 GRIN2BQ13224 1484 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CUX1P39880 1505 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SYNJ2O15056 1496 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.99■■□□□ 1.43
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PBRM1Q86U86 1689 aa23.95■■□□□ 1.43
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.87■■□□□ 1.41
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.86■■□□□ 1.41
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.81■■□□□ 1.4
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 GRIN2AQ12879 1464 aa23.76■■□□□ 1.39
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 CEP170Q5SW79 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ADAMTS12P58397 1594 aa23.73■■□□□ 1.39
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 NUP160Q12769 1436 aa23.71■■□□□ 1.39
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 SHROOM2Q13796 1616 aa23.67■■□□□ 1.38
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.63■■□□□ 1.37
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 TOP2BQ02880 1626 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC18-AS1-223ENST00000457387 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms