RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456869.5

GGT1-223, Transcript of gamma-glutamyltransferase 1, human

TSL 3

Gene GGT1, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGT1-223	ENST00000456869	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.7	■■■■□ 3.79
GGT1-223	ENST00000456869	ABCC9	O60706	1549 aa		35.16	■■■■□ 3.22
GGT1-223	ENST00000456869	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.85	■■■■□ 3.17
GGT1-223	ENST00000456869	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GGT1-223	ENST00000456869	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.27	■■■□□ 2.92
GGT1-223	ENST00000456869	NACAD	O15069	1562 aa		33.01	■■■□□ 2.88
GGT1-223	ENST00000456869	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GGT1-223	ENST00000456869	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.68	■■■□□ 2.82
GGT1-223	ENST00000456869	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GGT1-223	ENST00000456869	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GGT1-223	ENST00000456869	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GGT1-223	ENST00000456869	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
GGT1-223	ENST00000456869	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.95	■■■□□ 2.7
GGT1-223	ENST00000456869	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.89	■■■□□ 2.7
GGT1-223	ENST00000456869	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GGT1-223	ENST00000456869	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GGT1-223	ENST00000456869	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GGT1-223	ENST00000456869	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
GGT1-223	ENST00000456869	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.74	■■■□□ 2.51
GGT1-223	ENST00000456869	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.5	■■■□□ 2.47
GGT1-223	ENST00000456869	CUX2	O14529	1486 aa		30.42	■■■□□ 2.46
GGT1-223	ENST00000456869	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.36	■■■□□ 2.45
GGT1-223	ENST00000456869	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.35	■■■□□ 2.45
GGT1-223	ENST00000456869	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.25	■■■□□ 2.43
GGT1-223	ENST00000456869	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.24	■■■□□ 2.43
GGT1-223	ENST00000456869	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.24	■■■□□ 2.43
GGT1-223	ENST00000456869	NES	P48681	1621 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GGT1-223	ENST00000456869	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.05	■■■□□ 2.4
GGT1-223	ENST00000456869	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.04	■■■□□ 2.4
GGT1-223	ENST00000456869	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GGT1-223	ENST00000456869	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
GGT1-223	ENST00000456869	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.85	■■■□□ 2.37
GGT1-223	ENST00000456869	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GGT1-223	ENST00000456869	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.72	■■■□□ 2.35
GGT1-223	ENST00000456869	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.68	■■■□□ 2.34
GGT1-223	ENST00000456869	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.54	■■■□□ 2.32
GGT1-223	ENST00000456869	WIZ	O95785	1651 aa		29.45	■■■□□ 2.31
GGT1-223	ENST00000456869	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.45	■■■□□ 2.31
GGT1-223	ENST00000456869	WDR62	O43379	1518 aa		29.4	■■■□□ 2.3
GGT1-223	ENST00000456869	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GGT1-223	ENST00000456869	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.26	■■■□□ 2.27
GGT1-223	ENST00000456869	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GGT1-223	ENST00000456869	CFTR	P13569	1480 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GGT1-223	ENST00000456869	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
GGT1-223	ENST00000456869	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GGT1-223	ENST00000456869	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
GGT1-223	ENST00000456869	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GGT1-223	ENST00000456869	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GGT1-223	ENST00000456869	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GGT1-223	ENST00000456869	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.19
GGT1-223	ENST00000456869	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GGT1-223	ENST00000456869	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GGT1-223	ENST00000456869	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GGT1-223	ENST00000456869	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GGT1-223	ENST00000456869	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.64	■■■□□ 2.17
GGT1-223	ENST00000456869	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GGT1-223	ENST00000456869	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GGT1-223	ENST00000456869	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
GGT1-223	ENST00000456869	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GGT1-223	ENST00000456869	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
GGT1-223	ENST00000456869	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.4	■■■□□ 2.14
GGT1-223	ENST00000456869	CHD1	O14646	1710 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GGT1-223	ENST00000456869	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
GGT1-223	ENST00000456869	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GGT1-223	ENST00000456869	FBLN2	P98095	1184 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GGT1-223	ENST00000456869	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GGT1-223	ENST00000456869	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GGT1-223	ENST00000456869	SOGA1	O94964	1423 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GGT1-223	ENST00000456869	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
GGT1-223	ENST00000456869	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GGT1-223	ENST00000456869	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GGT1-223	ENST00000456869	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GGT1-223	ENST00000456869	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
GGT1-223	ENST00000456869	CUX1	P39880	1505 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GGT1-223	ENST00000456869	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GGT1-223	ENST00000456869	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
GGT1-223	ENST00000456869	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GGT1-223	ENST00000456869	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GGT1-223	ENST00000456869	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GGT1-223	ENST00000456869	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GGT1-223	ENST00000456869	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GGT1-223	ENST00000456869	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GGT1-223	ENST00000456869	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GGT1-223	ENST00000456869	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GGT1-223	ENST00000456869	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GGT1-223	ENST00000456869	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GGT1-223	ENST00000456869	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2
GGT1-223	ENST00000456869	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.57	■■■□□ 2
GGT1-223	ENST00000456869	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
GGT1-223	ENST00000456869	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.55	■■■□□ 2
GGT1-223	ENST00000456869	NUP160	Q12769	1436 aa		27.54	■■■□□ 2
GGT1-223	ENST00000456869	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GGT1-223	ENST00000456869	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GGT1-223	ENST00000456869	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GGT1-223	ENST00000456869	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GGT1-223	ENST00000456869	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.45	■■□□□ 1.99
GGT1-223	ENST00000456869	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GGT1-223	ENST00000456869	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.29	■■□□□ 1.96
GGT1-223	ENST00000456869	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.25	■■□□□ 1.95
GGT1-223	ENST00000456869	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.24	■■□□□ 1.95

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