RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455904.5

HDAC11-215, Transcript of histone deacetylase 11, human

TSL 2

Gene HDAC11, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC11-215	ENST00000455904	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.42	■■■■■ 4.86
HDAC11-215	ENST00000455904	ABCC9	O60706	1549 aa		41.13	■■■■■ 4.17
HDAC11-215	ENST00000455904	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		41.04	■■■■■ 4.16
HDAC11-215	ENST00000455904	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		39.1	■■■■□ 3.85
HDAC11-215	ENST00000455904	NACAD	O15069	1562 aa		38.76	■■■■□ 3.8
HDAC11-215	ENST00000455904	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38.73	■■■■□ 3.79
HDAC11-215	ENST00000455904	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		38.39	■■■■□ 3.74
HDAC11-215	ENST00000455904	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.21	■■■■□ 3.71
HDAC11-215	ENST00000455904	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		38.14	■■■■□ 3.7
HDAC11-215	ENST00000455904	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	38.12	■■■■□ 3.69
HDAC11-215	ENST00000455904	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		38	■■■■□ 3.67
HDAC11-215	ENST00000455904	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.62	■■■■□ 3.61
HDAC11-215	ENST00000455904	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.54	■■■■□ 3.6
HDAC11-215	ENST00000455904	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.47	■■■■□ 3.59
HDAC11-215	ENST00000455904	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.28	■■■■□ 3.56
HDAC11-215	ENST00000455904	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		37.22	■■■■□ 3.55
HDAC11-215	ENST00000455904	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		37.08	■■■■□ 3.53
HDAC11-215	ENST00000455904	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	37.07	■■■■□ 3.52
HDAC11-215	ENST00000455904	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		35.79	■■■■□ 3.32
HDAC11-215	ENST00000455904	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.72	■■■■□ 3.31
HDAC11-215	ENST00000455904	CUX2	O14529	1486 aa		35.61	■■■■□ 3.29
HDAC11-215	ENST00000455904	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.57	■■■■□ 3.28
HDAC11-215	ENST00000455904	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.56	■■■■□ 3.28
HDAC11-215	ENST00000455904	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.53	■■■■□ 3.28
HDAC11-215	ENST00000455904	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.52	■■■■□ 3.28
HDAC11-215	ENST00000455904	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.51	■■■■□ 3.28
HDAC11-215	ENST00000455904	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.3	■■■■□ 3.24
HDAC11-215	ENST00000455904	NES	P48681	1621 aa		35.26	■■■■□ 3.24
HDAC11-215	ENST00000455904	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.23	■■■■□ 3.23
HDAC11-215	ENST00000455904	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.22	■■■■□ 3.23
HDAC11-215	ENST00000455904	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	35.09	■■■■□ 3.21
HDAC11-215	ENST00000455904	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		35.04	■■■■□ 3.2
HDAC11-215	ENST00000455904	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.99	■■■■□ 3.19
HDAC11-215	ENST00000455904	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.95	■■■■□ 3.18
HDAC11-215	ENST00000455904	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.74	■■■■□ 3.15
HDAC11-215	ENST00000455904	WIZ	O95785	1651 aa		34.6	■■■■□ 3.13
HDAC11-215	ENST00000455904	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.57	■■■■□ 3.12
HDAC11-215	ENST00000455904	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		34.52	■■■■□ 3.12
HDAC11-215	ENST00000455904	WDR62	O43379	1518 aa		34.5	■■■■□ 3.11
HDAC11-215	ENST00000455904	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		34.32	■■■■□ 3.08
HDAC11-215	ENST00000455904	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		34.23	■■■■□ 3.07
HDAC11-215	ENST00000455904	CFTR	P13569	1480 aa		34.17	■■■■□ 3.06
HDAC11-215	ENST00000455904	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.14	■■■■□ 3.06
HDAC11-215	ENST00000455904	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.1	■■■■□ 3.05
HDAC11-215	ENST00000455904	PRDM2	Q13029	1718 aa		34.07	■■■■□ 3.05
HDAC11-215	ENST00000455904	TRIM41	Q8WV44	630 aa		34.05	■■■■□ 3.04
HDAC11-215	ENST00000455904	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.99	■■■■□ 3.03
HDAC11-215	ENST00000455904	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.78	■■■■□ 3
HDAC11-215	ENST00000455904	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.68	■■■□□ 2.98
HDAC11-215	ENST00000455904	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.63	■■■□□ 2.97
HDAC11-215	ENST00000455904	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
HDAC11-215	ENST00000455904	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.58	■■■□□ 2.97
HDAC11-215	ENST00000455904	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33.58	■■■□□ 2.97
HDAC11-215	ENST00000455904	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33.58	■■■□□ 2.97
HDAC11-215	ENST00000455904	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33.58	■■■□□ 2.97
HDAC11-215	ENST00000455904	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.96
HDAC11-215	ENST00000455904	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.47	■■■□□ 2.95
HDAC11-215	ENST00000455904	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.47	■■■□□ 2.95
HDAC11-215	ENST00000455904	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.4	■■■□□ 2.94
HDAC11-215	ENST00000455904	CHD1	O14646	1710 aa		33.37	■■■□□ 2.93
HDAC11-215	ENST00000455904	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
HDAC11-215	ENST00000455904	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.21	■■■□□ 2.91	1e-6	■■■■■ 29
HDAC11-215	ENST00000455904	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
HDAC11-215	ENST00000455904	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.05	■■■□□ 2.88
HDAC11-215	ENST00000455904	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		33.05	■■■□□ 2.88
HDAC11-215	ENST00000455904	WDR97	A6NE52	1622 aa		33.04	■■■□□ 2.88
HDAC11-215	ENST00000455904	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33	■■■□□ 2.87
HDAC11-215	ENST00000455904	SOGA1	O94964	1423 aa		32.97	■■■□□ 2.87
HDAC11-215	ENST00000455904	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.96	■■■□□ 2.87
HDAC11-215	ENST00000455904	FBLN2	P98095	1184 aa		32.95	■■■□□ 2.87
HDAC11-215	ENST00000455904	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
HDAC11-215	ENST00000455904	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.93	■■■□□ 2.86
HDAC11-215	ENST00000455904	CUX1	P39880	1505 aa		32.91	■■■□□ 2.86
HDAC11-215	ENST00000455904	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.91	■■■□□ 2.86
HDAC11-215	ENST00000455904	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
HDAC11-215	ENST00000455904	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.83	■■■□□ 2.85
HDAC11-215	ENST00000455904	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.81	■■■□□ 2.84
HDAC11-215	ENST00000455904	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.78	■■■□□ 2.84
HDAC11-215	ENST00000455904	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.73	■■■□□ 2.83
HDAC11-215	ENST00000455904	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
HDAC11-215	ENST00000455904	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
HDAC11-215	ENST00000455904	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.66	■■■□□ 2.82
HDAC11-215	ENST00000455904	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.61	■■■□□ 2.81
HDAC11-215	ENST00000455904	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.58	■■■□□ 2.81
HDAC11-215	ENST00000455904	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.41	■■■□□ 2.78
HDAC11-215	ENST00000455904	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.4	■■■□□ 2.78
HDAC11-215	ENST00000455904	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.38	■■■□□ 2.77
HDAC11-215	ENST00000455904	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.34	■■■□□ 2.77
HDAC11-215	ENST00000455904	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.34	■■■□□ 2.77
HDAC11-215	ENST00000455904	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.33	■■■□□ 2.77
HDAC11-215	ENST00000455904	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.33	■■■□□ 2.77	5e-6	■■■■■ 29.2
HDAC11-215	ENST00000455904	NUP160	Q12769	1436 aa		32.28	■■■□□ 2.76
HDAC11-215	ENST00000455904	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.27	■■■□□ 2.76
HDAC11-215	ENST00000455904	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
HDAC11-215	ENST00000455904	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.19	■■■□□ 2.74
HDAC11-215	ENST00000455904	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.18	■■■□□ 2.74
HDAC11-215	ENST00000455904	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.05	■■■□□ 2.72
HDAC11-215	ENST00000455904	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.98	■■■□□ 2.71
HDAC11-215	ENST00000455904	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
HDAC11-215	ENST00000455904	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7

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