RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455811.2

LMCD1-AS1-206, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LMCD1-AS1, Length 524 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.9■■■■■ 4.14
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ABCC9O60706 1549 aa37.34■■■■□ 3.57
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.01■■■■□ 3.52
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.44■■■■□ 3.26
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.35■■■■□ 3.25
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NACADO15069 1562 aa35.08■■■■□ 3.21
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.61■■■■□ 3.13
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.58■■■■□ 3.13
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.55■■■■□ 3.12
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.49■■■■□ 3.11
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.35■■■■□ 3.09
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.02■■■■□ 3.04
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.84■■■■□ 3.01
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.75■■■□□ 2.99
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.74■■■□□ 2.99
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SCRIBQ14160 1630 aa33.58■■■□□ 2.97
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.94■■■□□ 2.86
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CUX2O14529 1486 aa32.52■■■□□ 2.8
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NCAPD3P42695 1498 aa32.35■■■□□ 2.77
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ERCC6Q03468 1493 aa32.35■■■□□ 2.77
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.16■■■□□ 2.74
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 HMGXB3Q12766 1538 aa32.12■■■□□ 2.73
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SMARCA2P51531 1590 aa32.11■■■□□ 2.73
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SMARCA4P51532 1647 aa32.02■■■□□ 2.72
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NESP48681 1621 aa31.91■■■□□ 2.7
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.77■■■□□ 2.68
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.75■■■□□ 2.67
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.57■■■□□ 2.64
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.54■■■□□ 2.64
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.46■■■□□ 2.63
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.32■■■□□ 2.6
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.31■■■□□ 2.6
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 WDR62O43379 1518 aa31.26■■■□□ 2.59
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TRIM41Q8WV44 630 aa31.23■■■□□ 2.59
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.09■■■□□ 2.57
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 WIZO95785 1651 aa31.05■■■□□ 2.56
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.98■■■□□ 2.55
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CFTRP13569 1480 aa30.89■■■□□ 2.53
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 OSCARQ8IYS5 282 aa30.84■■■□□ 2.53
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PRDM2Q13029 1718 aa30.59■■■□□ 2.49
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.52■■■□□ 2.48
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.52■■■□□ 2.48
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.52■■■□□ 2.48
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 IFT140Q96RY7 1462 aa30.49■■■□□ 2.47
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ARHGEF11O15085 1522 aa30.39■■■□□ 2.46
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TOPBP1Q92547 1522 aa30.33■■■□□ 2.45
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ABCC8Q09428 1581 aa30.32■■■□□ 2.44
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.29■■■□□ 2.44
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.21■■■□□ 2.43
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CHD1O14646 1710 aa30.12■■■□□ 2.41
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.1■■■□□ 2.41
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ARAP1Q96P48 1450 aa30.04■■■□□ 2.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 FBLN2P98095 1184 aa29.93■■■□□ 2.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 WDR97A6NE52 1622 aa29.9■■■□□ 2.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.82■■■□□ 2.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SOGA1O94964 1423 aa29.82■■■□□ 2.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.81■■■□□ 2.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.8■■■□□ 2.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SYNJ1O43426 1573 aa29.77■■■□□ 2.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.72■■■□□ 2.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 GRIN2BQ13224 1484 aa29.68■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SYNJ2O15056 1496 aa29.64■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CUX1P39880 1505 aa29.61■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PBRM1Q86U86 1689 aa29.52■■■□□ 2.32
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.48■■■□□ 2.31
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.4■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.4■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 GRIN2AQ12879 1464 aa29.28■■■□□ 2.28
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ADAMTS12P58397 1594 aa29.22■■■□□ 2.27
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.21■■■□□ 2.27
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NUP160Q12769 1436 aa29.2■■■□□ 2.27
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CEP170Q5SW79 1584 aa29.19■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SHROOM2Q13796 1616 aa29.15■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.11■■■□□ 2.25
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.05■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TOP2BQ02880 1626 aa29.04■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.98■■■□□ 2.23
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 JPH4Q96JJ6 628 aa28.83■■■□□ 2.21
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.83■■■□□ 2.21
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