RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455762.5

NELFA-210, Transcript of negative elongation factor complex member A, humanhuman

TSL 5

Gene NELFA, Length 1,022 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFA-210ENST00000455762 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.58■■■■■ 5.05
NELFA-210ENST00000455762 ABCC9O60706 1549 aa42.28■■■■■ 4.36
NELFA-210ENST00000455762 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.95■■■■■ 4.31
NELFA-210ENST00000455762 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.12■■■■■ 4.01
NELFA-210ENST00000455762 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.86■■■■□ 3.97
NELFA-210ENST00000455762 NACADO15069 1562 aa39.75■■■■□ 3.95
NELFA-210ENST00000455762 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.54■■■■□ 3.92
NELFA-210ENST00000455762 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.32■■■■□ 3.89
NELFA-210ENST00000455762 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.11■■■■□ 3.85
NELFA-210ENST00000455762 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.08■■■■□ 3.85
NELFA-210ENST00000455762 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.88■■■■□ 3.81
NELFA-210ENST00000455762 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
NELFA-210ENST00000455762 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.46■■■■□ 3.75
NELFA-210ENST00000455762 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.41■■■■□ 3.74
NELFA-210ENST00000455762 SCRIBQ14160 1630 aa38.23■■■■□ 3.71
NELFA-210ENST00000455762 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.16■■■■□ 3.7
NELFA-210ENST00000455762 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.13■■■■□ 3.69
NELFA-210ENST00000455762 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
NELFA-210ENST00000455762 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.89■■■■□ 3.5
NELFA-210ENST00000455762 NCAPD3P42695 1498 aa36.68■■■■□ 3.46
NELFA-210ENST00000455762 CUX2O14529 1486 aa36.59■■■■□ 3.45
NELFA-210ENST00000455762 ERCC6Q03468 1493 aa36.59■■■■□ 3.45
NELFA-210ENST00000455762 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.53■■■■□ 3.44
NELFA-210ENST00000455762 SMARCA2P51531 1590 aa36.44■■■■□ 3.42
NELFA-210ENST00000455762 SMARCA4P51532 1647 aa36.41■■■■□ 3.42
NELFA-210ENST00000455762 HMGXB3Q12766 1538 aa36.39■■■■□ 3.42
NELFA-210ENST00000455762 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
NELFA-210ENST00000455762 NESP48681 1621 aa36.2■■■■□ 3.39
NELFA-210ENST00000455762 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
NELFA-210ENST00000455762 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.04■■■■□ 3.36
NELFA-210ENST00000455762 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.93■■■■□ 3.34
NELFA-210ENST00000455762 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
NELFA-210ENST00000455762 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.88■■■■□ 3.33
NELFA-210ENST00000455762 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.77■■■■□ 3.32
NELFA-210ENST00000455762 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.72■■■■□ 3.31
NELFA-210ENST00000455762 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.57■■■■□ 3.28
NELFA-210ENST00000455762 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.46■■■■□ 3.27
NELFA-210ENST00000455762 WIZO95785 1651 aa35.43■■■■□ 3.26
NELFA-210ENST00000455762 WDR62O43379 1518 aa35.35■■■■□ 3.25
NELFA-210ENST00000455762 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.27■■■■□ 3.24
NELFA-210ENST00000455762 TRIM41Q8WV44 630 aa35.22■■■■□ 3.23
NELFA-210ENST00000455762 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.18■■■■□ 3.22
NELFA-210ENST00000455762 CFTRP13569 1480 aa35.09■■■■□ 3.21
NELFA-210ENST00000455762 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
NELFA-210ENST00000455762 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
NELFA-210ENST00000455762 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
NELFA-210ENST00000455762 OSCARQ8IYS5 282 aa34.88■■■■□ 3.17
NELFA-210ENST00000455762 PRDM2Q13029 1718 aa34.68■■■■□ 3.14
NELFA-210ENST00000455762 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.58■■■■□ 3.13
NELFA-210ENST00000455762 IFT140Q96RY7 1462 aa34.57■■■■□ 3.12
NELFA-210ENST00000455762 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
NELFA-210ENST00000455762 TOPBP1Q92547 1522 aa34.46■■■■□ 3.11
NELFA-210ENST00000455762 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.42■■■■□ 3.1
NELFA-210ENST00000455762 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.42■■■■□ 3.1
NELFA-210ENST00000455762 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.42■■■■□ 3.1
NELFA-210ENST00000455762 ABCC8Q09428 1581 aa34.4■■■■□ 3.1
NELFA-210ENST00000455762 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
NELFA-210ENST00000455762 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.32■■■■□ 3.08
NELFA-210ENST00000455762 ARHGEF11O15085 1522 aa34.29■■■■□ 3.08
NELFA-210ENST00000455762 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.16■■■■□ 3.062e-7■■■□□ 18.7
NELFA-210ENST00000455762 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
NELFA-210ENST00000455762 CHD1O14646 1710 aa34.1■■■■□ 3.05
NELFA-210ENST00000455762 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
NELFA-210ENST00000455762 FBLN2P98095 1184 aa34.08■■■■□ 3.05
NELFA-210ENST00000455762 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.08■■■■□ 3.05
NELFA-210ENST00000455762 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.96■■■■□ 3.03
NELFA-210ENST00000455762 SOGA1O94964 1423 aa33.95■■■■□ 3.02
NELFA-210ENST00000455762 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
NELFA-210ENST00000455762 ARAP1Q96P48 1450 aa33.92■■■■□ 3.02
NELFA-210ENST00000455762 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
NELFA-210ENST00000455762 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.84■■■■□ 3.01
NELFA-210ENST00000455762 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.83■■■■□ 3.01
NELFA-210ENST00000455762 WDR97A6NE52 1622 aa33.83■■■■□ 3.01
NELFA-210ENST00000455762 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
NELFA-210ENST00000455762 CUX1P39880 1505 aa33.74■■■□□ 2.99
NELFA-210ENST00000455762 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
NELFA-210ENST00000455762 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.71■■■□□ 2.99
NELFA-210ENST00000455762 SYNJ1O43426 1573 aa33.71■■■□□ 2.99
NELFA-210ENST00000455762 GRIN2BQ13224 1484 aa33.7■■■□□ 2.99
NELFA-210ENST00000455762 SYNJ2O15056 1496 aa33.63■■■□□ 2.97
NELFA-210ENST00000455762 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.53■■■□□ 2.96
NELFA-210ENST00000455762 PBRM1Q86U86 1689 aa33.52■■■□□ 2.96
NELFA-210ENST00000455762 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.43■■■□□ 2.94
NELFA-210ENST00000455762 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.39■■■□□ 2.94
NELFA-210ENST00000455762 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
NELFA-210ENST00000455762 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.28■■■□□ 2.92
NELFA-210ENST00000455762 GRIN2AQ12879 1464 aa33.25■■■□□ 2.91
NELFA-210ENST00000455762 ADAMTS12P58397 1594 aa33.19■■■□□ 2.9
NELFA-210ENST00000455762 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
NELFA-210ENST00000455762 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.13■■■□□ 2.89
NELFA-210ENST00000455762 NUP160Q12769 1436 aa33.13■■■□□ 2.89
NELFA-210ENST00000455762 CEP170Q5SW79 1584 aa33.13■■■□□ 2.89
NELFA-210ENST00000455762 TOP2BQ02880 1626 aa33.12■■■□□ 2.89
NELFA-210ENST00000455762 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.11■■■□□ 2.89
NELFA-210ENST00000455762 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.11■■■□□ 2.89
NELFA-210ENST00000455762 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.02■■■□□ 2.88
NELFA-210ENST00000455762 SHROOM2Q13796 1616 aa33■■■□□ 2.87
NELFA-210ENST00000455762 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
NELFA-210ENST00000455762 JPH4Q96JJ6 628 aa32.82■■■□□ 2.84
NELFA-210ENST00000455762 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.72■■■□□ 2.83
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