RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455706.6

TCP11-211, Transcript of t-complex 11, human

TSL 1 (best)

Gene TCP11, Length 1,962 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCP11-211	ENST00000455706	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.79	■■■■■ 4.6
TCP11-211	ENST00000455706	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.49	■■■■□ 3.75
TCP11-211	ENST00000455706	ABCC9	O60706	1549 aa		36.7	■■■■□ 3.47
TCP11-211	ENST00000455706	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.67	■■■■□ 3.46
TCP11-211	ENST00000455706	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.29	■■■■□ 3.4
TCP11-211	ENST00000455706	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.27	■■■■□ 3.4
TCP11-211	ENST00000455706	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.08	■■■■□ 3.37
TCP11-211	ENST00000455706	NACAD	O15069	1562 aa		35.97	■■■■□ 3.35
TCP11-211	ENST00000455706	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.76	■■■■□ 3.32
TCP11-211	ENST00000455706	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.22	■■■■□ 3.23
TCP11-211	ENST00000455706	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.19	■■■■□ 3.22
TCP11-211	ENST00000455706	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		34.92	■■■■□ 3.18
TCP11-211	ENST00000455706	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.59	■■■■□ 3.13
TCP11-211	ENST00000455706	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.49	■■■■□ 3.11
TCP11-211	ENST00000455706	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.98	■■■■□ 3.03
TCP11-211	ENST00000455706	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.89	■■■■□ 3.02
TCP11-211	ENST00000455706	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.76	■■■□□ 2.99
TCP11-211	ENST00000455706	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
TCP11-211	ENST00000455706	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.75	■■■□□ 2.99
TCP11-211	ENST00000455706	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
TCP11-211	ENST00000455706	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
TCP11-211	ENST00000455706	WIZ	O95785	1651 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TCP11-211	ENST00000455706	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TCP11-211	ENST00000455706	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.36	■■■□□ 2.93
TCP11-211	ENST00000455706	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TCP11-211	ENST00000455706	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TCP11-211	ENST00000455706	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TCP11-211	ENST00000455706	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
TCP11-211	ENST00000455706	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TCP11-211	ENST00000455706	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TCP11-211	ENST00000455706	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TCP11-211	ENST00000455706	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TCP11-211	ENST00000455706	CFTR	P13569	1480 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TCP11-211	ENST00000455706	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TCP11-211	ENST00000455706	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TCP11-211	ENST00000455706	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TCP11-211	ENST00000455706	NES	P48681	1621 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TCP11-211	ENST00000455706	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TCP11-211	ENST00000455706	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TCP11-211	ENST00000455706	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TCP11-211	ENST00000455706	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TCP11-211	ENST00000455706	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.82	■■■□□ 2.68
TCP11-211	ENST00000455706	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TCP11-211	ENST00000455706	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.76	■■■□□ 2.68
TCP11-211	ENST00000455706	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TCP11-211	ENST00000455706	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.64	■■■□□ 2.66
TCP11-211	ENST00000455706	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TCP11-211	ENST00000455706	CUX1	P39880	1505 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TCP11-211	ENST00000455706	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.6	■■■□□ 2.65
TCP11-211	ENST00000455706	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.59	■■■□□ 2.65
TCP11-211	ENST00000455706	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.53	■■■□□ 2.64
TCP11-211	ENST00000455706	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.5	■■■□□ 2.63
TCP11-211	ENST00000455706	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.48	■■■□□ 2.63
TCP11-211	ENST00000455706	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
TCP11-211	ENST00000455706	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TCP11-211	ENST00000455706	WDR62	O43379	1518 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TCP11-211	ENST00000455706	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.61
TCP11-211	ENST00000455706	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
TCP11-211	ENST00000455706	SOGA1	O94964	1423 aa		31.2	■■■□□ 2.59
TCP11-211	ENST00000455706	EEA1	Q15075	1411 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TCP11-211	ENST00000455706	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.13	■■■□□ 2.57
TCP11-211	ENST00000455706	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.11	■■■□□ 2.57
TCP11-211	ENST00000455706	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
TCP11-211	ENST00000455706	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TCP11-211	ENST00000455706	CUX2	O14529	1486 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TCP11-211	ENST00000455706	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TCP11-211	ENST00000455706	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.05	■■■□□ 2.56
TCP11-211	ENST00000455706	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
TCP11-211	ENST00000455706	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.01	■■■□□ 2.56
TCP11-211	ENST00000455706	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TCP11-211	ENST00000455706	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.89	■■■□□ 2.54
TCP11-211	ENST00000455706	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.87	■■■□□ 2.53
TCP11-211	ENST00000455706	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.85	■■■□□ 2.53
TCP11-211	ENST00000455706	IGF1R	P08069	1367 aa		30.82	■■■□□ 2.52
TCP11-211	ENST00000455706	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.79	■■■□□ 2.52
TCP11-211	ENST00000455706	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.78	■■■□□ 2.52
TCP11-211	ENST00000455706	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.77	■■■□□ 2.52
TCP11-211	ENST00000455706	KIF21B	O75037	1637 aa		30.73	■■■□□ 2.51
TCP11-211	ENST00000455706	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.72	■■■□□ 2.51
TCP11-211	ENST00000455706	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		30.72	■■■□□ 2.51
TCP11-211	ENST00000455706	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.71	■■■□□ 2.51
TCP11-211	ENST00000455706	PRX	Q9BXM0	1461 aa		30.71	■■■□□ 2.51
TCP11-211	ENST00000455706	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.69	■■■□□ 2.5
TCP11-211	ENST00000455706	CUL7	Q14999	1698 aa		30.68	■■■□□ 2.5
TCP11-211	ENST00000455706	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		30.67	■■■□□ 2.5
TCP11-211	ENST00000455706	GOLGA3	Q08378	1498 aa		30.66	■■■□□ 2.5
TCP11-211	ENST00000455706	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		30.61	■■■□□ 2.49
TCP11-211	ENST00000455706	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		30.6	■■■□□ 2.49
TCP11-211	ENST00000455706	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.54	■■■□□ 2.48
TCP11-211	ENST00000455706	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	30.54	■■■□□ 2.48
TCP11-211	ENST00000455706	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.52	■■■□□ 2.48
TCP11-211	ENST00000455706	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.51	■■■□□ 2.47
TCP11-211	ENST00000455706	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.5	■■■□□ 2.47
TCP11-211	ENST00000455706	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		30.47	■■■□□ 2.47
TCP11-211	ENST00000455706	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.39	■■■□□ 2.46
TCP11-211	ENST00000455706	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.35	■■■□□ 2.45
TCP11-211	ENST00000455706	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.31	■■■□□ 2.44
TCP11-211	ENST00000455706	FBLN2	P98095	1184 aa		30.27	■■■□□ 2.44
TCP11-211	ENST00000455706	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		30.23	■■■□□ 2.43
TCP11-211	ENST00000455706	CEP162	Q5TB80	1403 aa		30.23	■■■□□ 2.43

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