RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455483.5

GGT1-222, Transcript of gamma-glutamyltransferase 1, human

TSL 5

Gene GGT1, Length 579 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGT1-222	ENST00000455483	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.35	■■■■■ 4.21
GGT1-222	ENST00000455483	ABCC9	O60706	1549 aa		37.51	■■■■□ 3.59
GGT1-222	ENST00000455483	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.03	■■■■□ 3.52
GGT1-222	ENST00000455483	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.44	■■■■□ 3.26
GGT1-222	ENST00000455483	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.43	■■■■□ 3.26
GGT1-222	ENST00000455483	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.22	■■■■□ 3.23
GGT1-222	ENST00000455483	NACAD	O15069	1562 aa		35.14	■■■■□ 3.22
GGT1-222	ENST00000455483	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.98	■■■■□ 3.19
GGT1-222	ENST00000455483	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		34.55	■■■■□ 3.12
GGT1-222	ENST00000455483	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.54	■■■■□ 3.12
GGT1-222	ENST00000455483	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.46	■■■■□ 3.11
GGT1-222	ENST00000455483	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.23	■■■■□ 3.07
GGT1-222	ENST00000455483	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.04	■■■■□ 3.04
GGT1-222	ENST00000455483	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.93	■■■■□ 3.02
GGT1-222	ENST00000455483	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GGT1-222	ENST00000455483	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.76	■■■■□ 3
GGT1-222	ENST00000455483	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.76	■■■■□ 3
GGT1-222	ENST00000455483	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
GGT1-222	ENST00000455483	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GGT1-222	ENST00000455483	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GGT1-222	ENST00000455483	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GGT1-222	ENST00000455483	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GGT1-222	ENST00000455483	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GGT1-222	ENST00000455483	CUX2	O14529	1486 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GGT1-222	ENST00000455483	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GGT1-222	ENST00000455483	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GGT1-222	ENST00000455483	NES	P48681	1621 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GGT1-222	ENST00000455483	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
GGT1-222	ENST00000455483	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
GGT1-222	ENST00000455483	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GGT1-222	ENST00000455483	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GGT1-222	ENST00000455483	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
GGT1-222	ENST00000455483	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GGT1-222	ENST00000455483	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GGT1-222	ENST00000455483	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.58	■■■□□ 2.65
GGT1-222	ENST00000455483	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.56	■■■□□ 2.64
GGT1-222	ENST00000455483	WIZ	O95785	1651 aa		31.48	■■■□□ 2.63
GGT1-222	ENST00000455483	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.39	■■■□□ 2.62
GGT1-222	ENST00000455483	WDR62	O43379	1518 aa		31.28	■■■□□ 2.6
GGT1-222	ENST00000455483	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.22	■■■□□ 2.59
GGT1-222	ENST00000455483	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.2	■■■□□ 2.59
GGT1-222	ENST00000455483	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.2	■■■□□ 2.58
GGT1-222	ENST00000455483	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
GGT1-222	ENST00000455483	CFTR	P13569	1480 aa		31.12	■■■□□ 2.57
GGT1-222	ENST00000455483	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
GGT1-222	ENST00000455483	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.96	■■■□□ 2.55
GGT1-222	ENST00000455483	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.86	■■■□□ 2.53
GGT1-222	ENST00000455483	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.77	■■■□□ 2.52
GGT1-222	ENST00000455483	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.65	■■■□□ 2.5
GGT1-222	ENST00000455483	IFT140	Q96RY7	1462 aa		30.6	■■■□□ 2.49
GGT1-222	ENST00000455483	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.57	■■■□□ 2.48
GGT1-222	ENST00000455483	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.56	■■■□□ 2.48
GGT1-222	ENST00000455483	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.4	■■■□□ 2.46
GGT1-222	ENST00000455483	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.4	■■■□□ 2.46
GGT1-222	ENST00000455483	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.4	■■■□□ 2.46
GGT1-222	ENST00000455483	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.4	■■■□□ 2.46
GGT1-222	ENST00000455483	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.39	■■■□□ 2.46
GGT1-222	ENST00000455483	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.37	■■■□□ 2.45
GGT1-222	ENST00000455483	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.37	■■■□□ 2.45
GGT1-222	ENST00000455483	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.33	■■■□□ 2.45
GGT1-222	ENST00000455483	FBLN2	P98095	1184 aa		30.27	■■■□□ 2.44
GGT1-222	ENST00000455483	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.26	■■■□□ 2.44
GGT1-222	ENST00000455483	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.25	■■■□□ 2.43
GGT1-222	ENST00000455483	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.24	■■■□□ 2.43
GGT1-222	ENST00000455483	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.22	■■■□□ 2.43
GGT1-222	ENST00000455483	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.17	■■■□□ 2.42
GGT1-222	ENST00000455483	SOGA1	O94964	1423 aa		30.14	■■■□□ 2.42
GGT1-222	ENST00000455483	CHD1	O14646	1710 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GGT1-222	ENST00000455483	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GGT1-222	ENST00000455483	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GGT1-222	ENST00000455483	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.01	■■■□□ 2.4
GGT1-222	ENST00000455483	CUX1	P39880	1505 aa		29.98	■■■□□ 2.39
GGT1-222	ENST00000455483	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.98	■■■□□ 2.39
GGT1-222	ENST00000455483	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
GGT1-222	ENST00000455483	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GGT1-222	ENST00000455483	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.84	■■■□□ 2.37
GGT1-222	ENST00000455483	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.83	■■■□□ 2.37
GGT1-222	ENST00000455483	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.82	■■■□□ 2.36
GGT1-222	ENST00000455483	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
GGT1-222	ENST00000455483	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.78	■■■□□ 2.36
GGT1-222	ENST00000455483	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.77	■■■□□ 2.36
GGT1-222	ENST00000455483	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GGT1-222	ENST00000455483	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.65	■■■□□ 2.34
GGT1-222	ENST00000455483	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.62	■■■□□ 2.33
GGT1-222	ENST00000455483	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.59	■■■□□ 2.33
GGT1-222	ENST00000455483	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.53	■■■□□ 2.32
GGT1-222	ENST00000455483	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.48	■■■□□ 2.31
GGT1-222	ENST00000455483	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.45	■■■□□ 2.31
GGT1-222	ENST00000455483	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.4	■■■□□ 2.3
GGT1-222	ENST00000455483	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.39	■■■□□ 2.29
GGT1-222	ENST00000455483	NUP160	Q12769	1436 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GGT1-222	ENST00000455483	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GGT1-222	ENST00000455483	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.35	■■■□□ 2.29
GGT1-222	ENST00000455483	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GGT1-222	ENST00000455483	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GGT1-222	ENST00000455483	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
GGT1-222	ENST00000455483	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GGT1-222	ENST00000455483	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
GGT1-222	ENST00000455483	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.15	■■■□□ 2.26
GGT1-222	ENST00000455483	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.99	■■■□□ 2.23

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