RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.45■■■■■ 7.75
CITED1-210ENST00000454225 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.57■■■■■ 6.65
CITED1-210ENST00000454225 ABCC9O60706 1549 aa55.85■■■■■ 6.53
CITED1-210ENST00000454225 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.48■■■■■ 6.15
CITED1-210ENST00000454225 NACADO15069 1562 aa53.3■■■■■ 6.12
CITED1-210ENST00000454225 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.27■■■■■ 6.12
CITED1-210ENST00000454225 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.8■■■■■ 6.04
CITED1-210ENST00000454225 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.77■■■■■ 6.04
CITED1-210ENST00000454225 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.43■■■■■ 5.98
CITED1-210ENST00000454225 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.29■■■■■ 5.96
CITED1-210ENST00000454225 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.14■■■■■ 5.94
CITED1-210ENST00000454225 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.89■■■■■ 5.9
CITED1-210ENST00000454225 SCRIBQ14160 1630 aa51.67■■■■■ 5.86
CITED1-210ENST00000454225 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.64■■■■■ 5.86
CITED1-210ENST00000454225 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.24■■■■■ 5.79
CITED1-210ENST00000454225 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.56■■■■■ 5.68
CITED1-210ENST00000454225 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.47■■■■■ 5.67
CITED1-210ENST00000454225 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.2■■■■■ 5.63
CITED1-210ENST00000454225 SMARCA4P51532 1647 aa49.34■■■■■ 5.49
CITED1-210ENST00000454225 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.2■■■■■ 5.47
CITED1-210ENST00000454225 NCAPD3P42695 1498 aa49.18■■■■■ 5.46
CITED1-210ENST00000454225 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.18■■■■■ 5.46
CITED1-210ENST00000454225 SMARCA2P51531 1590 aa49.08■■■■■ 5.45
CITED1-210ENST00000454225 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.92■■■■■ 5.42
CITED1-210ENST00000454225 HMGXB3Q12766 1538 aa48.91■■■■■ 5.42
CITED1-210ENST00000454225 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.81■■■■■ 5.4
CITED1-210ENST00000454225 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.76■■■■■ 5.4
CITED1-210ENST00000454225 WIZO95785 1651 aa48.38■■■■■ 5.34
CITED1-210ENST00000454225 NESP48681 1621 aa48.21■■■■■ 5.31
CITED1-210ENST00000454225 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.2■■■■■ 5.31
CITED1-210ENST00000454225 ERCC6Q03468 1493 aa48.17■■■■■ 5.3
CITED1-210ENST00000454225 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.96■■■■■ 5.27
CITED1-210ENST00000454225 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
CITED1-210ENST00000454225 CUX2O14529 1486 aa47.76■■■■■ 5.24
CITED1-210ENST00000454225 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.75■■■■■ 5.23
CITED1-210ENST00000454225 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.66■■■■■ 5.22
CITED1-210ENST00000454225 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.61■■■■■ 5.21
CITED1-210ENST00000454225 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
CITED1-210ENST00000454225 CFTRP13569 1480 aa47.37■■■■■ 5.17
CITED1-210ENST00000454225 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.27■■■■■ 5.16
CITED1-210ENST00000454225 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.22■■■■■ 5.15
CITED1-210ENST00000454225 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.22■■■■■ 5.15
CITED1-210ENST00000454225 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.21■■■■■ 5.15
CITED1-210ENST00000454225 WDR62O43379 1518 aa47.07■■■■■ 5.13
CITED1-210ENST00000454225 PRDM2Q13029 1718 aa46.97■■■■■ 5.11
CITED1-210ENST00000454225 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.8■■■■■ 5.08
CITED1-210ENST00000454225 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
CITED1-210ENST00000454225 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
CITED1-210ENST00000454225 TOPBP1Q92547 1522 aa46.42■■■■■ 5.02
CITED1-210ENST00000454225 ABCC8Q09428 1581 aa46.34■■■■■ 5.01
CITED1-210ENST00000454225 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.32■■■■■ 5.01
CITED1-210ENST00000454225 IFT140Q96RY7 1462 aa46.22■■■■■ 4.99
CITED1-210ENST00000454225 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
CITED1-210ENST00000454225 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
CITED1-210ENST00000454225 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
CITED1-210ENST00000454225 CUX1P39880 1505 aa45.93■■■■■ 4.94
CITED1-210ENST00000454225 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
CITED1-210ENST00000454225 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.84■■■■■ 4.93
CITED1-210ENST00000454225 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.83■■■■■ 4.93
CITED1-210ENST00000454225 SOGA1O94964 1423 aa45.8■■■■■ 4.92
CITED1-210ENST00000454225 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.76■■■■■ 4.92
CITED1-210ENST00000454225 OSCARQ8IYS5 282 aa45.72■■■■■ 4.91
CITED1-210ENST00000454225 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
CITED1-210ENST00000454225 WDR97A6NE52 1622 aa45.5■■■■■ 4.87
CITED1-210ENST00000454225 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.46■■■■■ 4.87
CITED1-210ENST00000454225 CHD1O14646 1710 aa45.38■■■■■ 4.86
CITED1-210ENST00000454225 TOP2BQ02880 1626 aa45.38■■■■■ 4.86
CITED1-210ENST00000454225 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.38■■■■■ 4.86
CITED1-210ENST00000454225 SYNJ1O43426 1573 aa45.38■■■■■ 4.86
CITED1-210ENST00000454225 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.34■■■■■ 4.85
CITED1-210ENST00000454225 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.34■■■■■ 4.85
CITED1-210ENST00000454225 FBLN2P98095 1184 aa45.33■■■■■ 4.85
CITED1-210ENST00000454225 GRIN2BQ13224 1484 aa45.31■■■■■ 4.84
CITED1-210ENST00000454225 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.27■■■■■ 4.84
CITED1-210ENST00000454225 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
CITED1-210ENST00000454225 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.21■■■■■ 4.83
CITED1-210ENST00000454225 PBRM1Q86U86 1689 aa45.2■■■■■ 4.83
CITED1-210ENST00000454225 TRIM41Q8WV44 630 aa45.17■■■■■ 4.82
CITED1-210ENST00000454225 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
CITED1-210ENST00000454225 SYNJ2O15056 1496 aa45.06■■■■■ 4.8
CITED1-210ENST00000454225 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.06■■■■■ 4.8
CITED1-210ENST00000454225 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.06■■■■■ 4.8
CITED1-210ENST00000454225 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.06■■■■■ 4.8
CITED1-210ENST00000454225 ARHGEF11O15085 1522 aa45■■■■■ 4.79
CITED1-210ENST00000454225 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.85■■■■■ 4.77
CITED1-210ENST00000454225 ADAMTS12P58397 1594 aa44.82■■■■■ 4.77
CITED1-210ENST00000454225 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.78■■■■■ 4.76
CITED1-210ENST00000454225 GRIN2AQ12879 1464 aa44.73■■■■■ 4.75
CITED1-210ENST00000454225 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.72■■■■■ 4.75
CITED1-210ENST00000454225 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.63■■■■■ 4.74
CITED1-210ENST00000454225 ARAP1Q96P48 1450 aa44.62■■■■■ 4.73
CITED1-210ENST00000454225 CEP170Q5SW79 1584 aa44.55■■■■■ 4.72
CITED1-210ENST00000454225 NUP160Q12769 1436 aa44.54■■■■■ 4.72
CITED1-210ENST00000454225 KIF27Q86VH2 1401 aa44.54■■■■■ 4.72
CITED1-210ENST00000454225 IGF1RP08069 1367 aa44.41■■■■■ 4.7
CITED1-210ENST00000454225 CUL7Q14999 1698 aa44.3■■■■■ 4.68
CITED1-210ENST00000454225 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.25■■■■■ 4.67
CITED1-210ENST00000454225 SHROOM2Q13796 1616 aa44.24■■■■■ 4.67
CITED1-210ENST00000454225 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.17■■■■■ 4.66
CITED1-210ENST00000454225 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.15■■■■■ 4.66
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