RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.42■■□□□ 1.98
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCRIBQ14160 1630 aa22.09■■□□□ 1.13
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMARCA2P51531 1590 aa21.11■□□□□ 0.97
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.32■□□□□ 0.68
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PBRM1Q86U86 1689 aa19.32■□□□□ 0.68
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C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM41Q8WV44 630 aa19.16■□□□□ 0.66
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGEF11O15085 1522 aa19.12■□□□□ 0.65
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CUL7Q14999 1698 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.09■□□□□ 0.65
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP170Q5SW79 1584 aa19.08■□□□□ 0.65
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