RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452023.1

ALKAL2-206, Transcript of ALK and LTK ligand 2, humanhuman

TSL 3

Gene ALKAL2, Length 809 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL2-206ENST00000452023 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.94■■■■■ 9.11
ALKAL2-206ENST00000452023 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.83■■■■■ 7.81
ALKAL2-206ENST00000452023 ABCC9O60706 1549 aa62.4■■■■■ 7.58
ALKAL2-206ENST00000452023 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.19■■■■■ 7.23
ALKAL2-206ENST00000452023 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.03■■■■■ 7.2
ALKAL2-206ENST00000452023 NACADO15069 1562 aa59.99■■■■■ 7.19
ALKAL2-206ENST00000452023 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.92■■■■■ 7.18
ALKAL2-206ENST00000452023 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.64■■■■■ 7.14
ALKAL2-206ENST00000452023 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.47■■■■■ 7.11
ALKAL2-206ENST00000452023 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.75■■■■■ 7
ALKAL2-206ENST00000452023 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.4■■■■■ 6.94
ALKAL2-206ENST00000452023 SCRIBQ14160 1630 aa58.33■■■■■ 6.93
ALKAL2-206ENST00000452023 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.25■■■■■ 6.91
ALKAL2-206ENST00000452023 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.51■■■■■ 6.8
ALKAL2-206ENST00000452023 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.22■■■■■ 6.75
ALKAL2-206ENST00000452023 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.67■■■■■ 6.66
ALKAL2-206ENST00000452023 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.44■■■■■ 6.63
ALKAL2-206ENST00000452023 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.08■■■■■ 6.57
ALKAL2-206ENST00000452023 SMARCA4P51532 1647 aa55.78■■■■■ 6.52
ALKAL2-206ENST00000452023 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.72■■■■■ 6.51
ALKAL2-206ENST00000452023 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.48■■■■■ 6.47
ALKAL2-206ENST00000452023 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.44■■■■■ 6.47
ALKAL2-206ENST00000452023 NCAPD3P42695 1498 aa55.37■■■■■ 6.45
ALKAL2-206ENST00000452023 SMARCA2P51531 1590 aa55.35■■■■■ 6.45
ALKAL2-206ENST00000452023 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.19■■■■■ 6.43
ALKAL2-206ENST00000452023 HMGXB3Q12766 1538 aa55.07■■■■■ 6.41
ALKAL2-206ENST00000452023 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.98■■■■■ 6.39
ALKAL2-206ENST00000452023 WIZO95785 1651 aa54.91■■■■■ 6.38
ALKAL2-206ENST00000452023 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.89■■■■■ 6.38
ALKAL2-206ENST00000452023 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.26■■■■■ 6.28
ALKAL2-206ENST00000452023 NESP48681 1621 aa54.06■■■■■ 6.24
ALKAL2-206ENST00000452023 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.87■■■■■ 6.21
ALKAL2-206ENST00000452023 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.79■■■■■ 6.2
ALKAL2-206ENST00000452023 ERCC6Q03468 1493 aa53.73■■■■■ 6.19
ALKAL2-206ENST00000452023 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.73■■■■■ 6.19
ALKAL2-206ENST00000452023 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.69■■■■■ 6.19
ALKAL2-206ENST00000452023 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.52■■■■■ 6.16
ALKAL2-206ENST00000452023 CFTRP13569 1480 aa53.48■■■■■ 6.15
ALKAL2-206ENST00000452023 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.41■■■■■ 6.14
ALKAL2-206ENST00000452023 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.17■■■■■ 6.1
ALKAL2-206ENST00000452023 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.14■■■■■ 6.1
ALKAL2-206ENST00000452023 PRDM2Q13029 1718 aa53.1■■■■■ 6.09
ALKAL2-206ENST00000452023 CUX2O14529 1486 aa53.07■■■■■ 6.09
ALKAL2-206ENST00000452023 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.07■■■■■ 6.09
ALKAL2-206ENST00000452023 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.95■■■■■ 6.07
ALKAL2-206ENST00000452023 WDR62O43379 1518 aa52.76■■■■■ 6.04
ALKAL2-206ENST00000452023 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.64■■■■■ 6.02
ALKAL2-206ENST00000452023 TOPBP1Q92547 1522 aa52.35■■■■■ 5.97
ALKAL2-206ENST00000452023 ABCC8Q09428 1581 aa52.32■■■■■ 5.97
ALKAL2-206ENST00000452023 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.27■■■■■ 5.96
ALKAL2-206ENST00000452023 CUX1P39880 1505 aa52.01■■■■■ 5.92
ALKAL2-206ENST00000452023 IFT140Q96RY7 1462 aa51.95■■■■■ 5.91
ALKAL2-206ENST00000452023 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.9■■■■■ 5.9
ALKAL2-206ENST00000452023 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.81■■■■■ 5.88
ALKAL2-206ENST00000452023 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.75■■■■■ 5.88
ALKAL2-206ENST00000452023 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.75■■■■■ 5.88
ALKAL2-206ENST00000452023 SOGA1O94964 1423 aa51.73■■■■■ 5.87
ALKAL2-206ENST00000452023 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.73■■■■■ 5.87
ALKAL2-206ENST00000452023 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.73■■■■■ 5.87
ALKAL2-206ENST00000452023 SYNJ1O43426 1573 aa51.61■■■■■ 5.85
ALKAL2-206ENST00000452023 TOP2BQ02880 1626 aa51.59■■■■■ 5.85
ALKAL2-206ENST00000452023 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.59■■■■■ 5.85
ALKAL2-206ENST00000452023 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.51■■■■■ 5.84
ALKAL2-206ENST00000452023 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.5■■■■■ 5.84
ALKAL2-206ENST00000452023 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.45■■■■■ 5.83
ALKAL2-206ENST00000452023 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.36■■■■■ 5.81
ALKAL2-206ENST00000452023 WDR97A6NE52 1622 aa51.35■■■■■ 5.81
ALKAL2-206ENST00000452023 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.29■■■■■ 5.8
ALKAL2-206ENST00000452023 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.1■■■■■ 5.77
ALKAL2-206ENST00000452023 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.07■■■■■ 5.77
ALKAL2-206ENST00000452023 GRIN2BQ13224 1484 aa51.06■■■■■ 5.76
ALKAL2-206ENST00000452023 OSCARQ8IYS5 282 aa51■■■■■ 5.75
ALKAL2-206ENST00000452023 PBRM1Q86U86 1689 aa50.99■■■■■ 5.75
ALKAL2-206ENST00000452023 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.98■■■■■ 5.75
ALKAL2-206ENST00000452023 FBLN2P98095 1184 aa50.89■■■■■ 5.74
ALKAL2-206ENST00000452023 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.89■■■■■ 5.74
ALKAL2-206ENST00000452023 CHD1O14646 1710 aa50.87■■■■■ 5.73
ALKAL2-206ENST00000452023 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.75■■■■■ 5.71
ALKAL2-206ENST00000452023 SYNJ2O15056 1496 aa50.71■■■■■ 5.71
ALKAL2-206ENST00000452023 TRIM41Q8WV44 630 aa50.7■■■■■ 5.71
ALKAL2-206ENST00000452023 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.67■■■■■ 5.7
ALKAL2-206ENST00000452023 KIF27Q86VH2 1401 aa50.63■■■■■ 5.7
ALKAL2-206ENST00000452023 ADAMTS12P58397 1594 aa50.56■■■■■ 5.68
ALKAL2-206ENST00000452023 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.51■■■■■ 5.68
ALKAL2-206ENST00000452023 IGF1RP08069 1367 aa50.46■■■■■ 5.67
ALKAL2-206ENST00000452023 GRIN2AQ12879 1464 aa50.4■■■■■ 5.66
ALKAL2-206ENST00000452023 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.32■■■■■ 5.65
ALKAL2-206ENST00000452023 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.28■■■■■ 5.64
ALKAL2-206ENST00000452023 CUL7Q14999 1698 aa50.25■■■■■ 5.63
ALKAL2-206ENST00000452023 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.22■■■■■ 5.63
ALKAL2-206ENST00000452023 CEP170Q5SW79 1584 aa50.17■■■■■ 5.62
ALKAL2-206ENST00000452023 NUP160Q12769 1436 aa50.16■■■■■ 5.62
ALKAL2-206ENST00000452023 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.16■■■■■ 5.62
ALKAL2-206ENST00000452023 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.13■■■■■ 5.62
ALKAL2-206ENST00000452023 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.13■■■■■ 5.62
ALKAL2-206ENST00000452023 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.13■■■■■ 5.62
ALKAL2-206ENST00000452023 ARHGEF11O15085 1522 aa50.11■■■■■ 5.61
ALKAL2-206ENST00000452023 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.85■■■■■ 5.57
ALKAL2-206ENST00000452023 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.77■■■■■ 5.56
ALKAL2-206ENST00000452023 SHROOM2Q13796 1616 aa49.77■■■■■ 5.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms