RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449938.6

USP36-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,647 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-202ENST00000449938 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.57■■■□□ 2.32
USP36-202ENST00000449938 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.66■■□□□ 1.7
USP36-202ENST00000449938 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
USP36-202ENST00000449938 ABCC9O60706 1549 aa24.55■■□□□ 1.52
USP36-202ENST00000449938 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.49■■□□□ 1.51
USP36-202ENST00000449938 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.26■■□□□ 1.47
USP36-202ENST00000449938 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.25■■□□□ 1.47
USP36-202ENST00000449938 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
USP36-202ENST00000449938 NACADO15069 1562 aa23.84■■□□□ 1.41
USP36-202ENST00000449938 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.74■■□□□ 1.39
USP36-202ENST00000449938 SCRIBQ14160 1630 aa23.58■■□□□ 1.37
USP36-202ENST00000449938 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
USP36-202ENST00000449938 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.36■■□□□ 1.33
USP36-202ENST00000449938 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.09■■□□□ 1.29
USP36-202ENST00000449938 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
USP36-202ENST00000449938 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
USP36-202ENST00000449938 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.9■■□□□ 1.26
USP36-202ENST00000449938 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
USP36-202ENST00000449938 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.82■■□□□ 1.24
USP36-202ENST00000449938 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.68■■□□□ 1.22
USP36-202ENST00000449938 SMARCA4P51532 1647 aa22.65■■□□□ 1.22
USP36-202ENST00000449938 WIZO95785 1651 aa22.63■■□□□ 1.21
USP36-202ENST00000449938 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP36-202ENST00000449938 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP36-202ENST00000449938 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.4■■□□□ 1.18
USP36-202ENST00000449938 SMARCA2P51531 1590 aa22.24■■□□□ 1.15
USP36-202ENST00000449938 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.23■■□□□ 1.15
USP36-202ENST00000449938 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.22■■□□□ 1.15
USP36-202ENST00000449938 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.21■■□□□ 1.15
USP36-202ENST00000449938 TRIM41Q8WV44 630 aa22.13■■□□□ 1.13
USP36-202ENST00000449938 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.12■■□□□ 1.13
USP36-202ENST00000449938 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP36-202ENST00000449938 HMGXB3Q12766 1538 aa22■■□□□ 1.11
USP36-202ENST00000449938 NCAPD3P42695 1498 aa21.99■■□□□ 1.11
USP36-202ENST00000449938 ABCC8Q09428 1581 aa21.8■■□□□ 1.08
USP36-202ENST00000449938 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.77■■□□□ 1.08
USP36-202ENST00000449938 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
USP36-202ENST00000449938 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP36-202ENST00000449938 EEA1Q15075 1411 aa21.6■■□□□ 1.05
USP36-202ENST00000449938 CFTRP13569 1480 aa21.58■■□□□ 1.05
USP36-202ENST00000449938 SYNJ1O43426 1573 aa21.55■■□□□ 1.04
USP36-202ENST00000449938 TOP2BQ02880 1626 aa21.48■■□□□ 1.03
USP36-202ENST00000449938 SOGA1O94964 1423 aa21.47■■□□□ 1.03
USP36-202ENST00000449938 PRDM2Q13029 1718 aa21.47■■□□□ 1.03
USP36-202ENST00000449938 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.45■■□□□ 1.02
USP36-202ENST00000449938 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.45■■□□□ 1.02
USP36-202ENST00000449938 NESP48681 1621 aa21.4■■□□□ 1.02
USP36-202ENST00000449938 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.4■■□□□ 1.02
USP36-202ENST00000449938 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.35■■□□□ 1.01
USP36-202ENST00000449938 CUX1P39880 1505 aa21.33■■□□□ 1.01
USP36-202ENST00000449938 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.33■■□□□ 1
USP36-202ENST00000449938 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.29■■□□□ 1
USP36-202ENST00000449938 GOLGA3Q08378 1498 aa21.28■■□□□ 1
USP36-202ENST00000449938 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.27■□□□□ 0.99
USP36-202ENST00000449938 KIF21BO75037 1637 aa21.26■□□□□ 0.99
USP36-202ENST00000449938 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.26■□□□□ 0.99
USP36-202ENST00000449938 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.2■□□□□ 0.98
USP36-202ENST00000449938 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.2■□□□□ 0.98
USP36-202ENST00000449938 CEP162Q5TB80 1403 aa21.15■□□□□ 0.98
USP36-202ENST00000449938 KIF27Q86VH2 1401 aa21.14■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.12■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.11■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.08■□□□□ 0.97
USP36-202ENST00000449938 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.08■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 ERCC6Q03468 1493 aa21.07■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.06■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 PRXQ9BXM0 1461 aa21.05■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.04■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.02■□□□□ 0.96
USP36-202ENST00000449938 TOPBP1Q92547 1522 aa21■□□□□ 0.95
USP36-202ENST00000449938 CUX2O14529 1486 aa20.98■□□□□ 0.95
USP36-202ENST00000449938 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
USP36-202ENST00000449938 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.94■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 CLIP1P30622 1438 aa20.93■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.91■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 IGF1RP08069 1367 aa20.9■□□□□ 0.94
USP36-202ENST00000449938 WDR62O43379 1518 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-202ENST00000449938 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.82■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.8■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 HRCP23327 699 aa20.8■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.79■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 WDR97A6NE52 1622 aa20.77■□□□□ 0.92
USP36-202ENST00000449938 CUL7Q14999 1698 aa20.73■□□□□ 0.91
USP36-202ENST00000449938 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
USP36-202ENST00000449938 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.68■□□□□ 0.9
USP36-202ENST00000449938 ARAP1Q96P48 1450 aa20.67■□□□□ 0.9
USP36-202ENST00000449938 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
USP36-202ENST00000449938 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.64■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 APLP2Q06481 763 aa20.63■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.6■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
USP36-202ENST00000449938 IFT140Q96RY7 1462 aa20.57■□□□□ 0.88
USP36-202ENST00000449938 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP36-202ENST00000449938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.51■□□□□ 0.87
USP36-202ENST00000449938 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms