RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449358.2

SYT15-204, Transcript of synaptotagmin 15, humanhuman

TSL 4

Gene SYT15, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT15-204ENST00000449358 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.68■■■□□ 2.02
SYT15-204ENST00000449358 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.61■■□□□ 1.53
SYT15-204ENST00000449358 ABCC9O60706 1549 aa24.48■■□□□ 1.51
SYT15-204ENST00000449358 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.69■■□□□ 1.38
SYT15-204ENST00000449358 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.41■■□□□ 1.34
SYT15-204ENST00000449358 NACADO15069 1562 aa23.3■■□□□ 1.32
SYT15-204ENST00000449358 MYO15BQ96JP2 1530 aa23■■□□□ 1.27
SYT15-204ENST00000449358 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
SYT15-204ENST00000449358 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SYT15-204ENST00000449358 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.82■■□□□ 1.24
SYT15-204ENST00000449358 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.65■■□□□ 1.22
SYT15-204ENST00000449358 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT15-204ENST00000449358 SCRIBQ14160 1630 aa22.55■■□□□ 1.2
SYT15-204ENST00000449358 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.52■■□□□ 1.2
SYT15-204ENST00000449358 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.36■■□□□ 1.17
SYT15-204ENST00000449358 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYT15-204ENST00000449358 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.03■■□□□ 1.12
SYT15-204ENST00000449358 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.02■■□□□ 1.12
SYT15-204ENST00000449358 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYT15-204ENST00000449358 NCAPD3P42695 1498 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT15-204ENST00000449358 SMARCA2P51531 1590 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT15-204ENST00000449358 SMARCA4P51532 1647 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT15-204ENST00000449358 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT15-204ENST00000449358 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SYT15-204ENST00000449358 HMGXB3Q12766 1538 aa21.31■■□□□ 1
SYT15-204ENST00000449358 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.31■■□□□ 1
SYT15-204ENST00000449358 ERCC6Q03468 1493 aa21.23■□□□□ 0.99
SYT15-204ENST00000449358 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.21■□□□□ 0.99
SYT15-204ENST00000449358 WIZO95785 1651 aa21.07■□□□□ 0.96
SYT15-204ENST00000449358 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
SYT15-204ENST00000449358 NESP48681 1621 aa21.04■□□□□ 0.96
SYT15-204ENST00000449358 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.98■□□□□ 0.95
SYT15-204ENST00000449358 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.97■□□□□ 0.95
SYT15-204ENST00000449358 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.96■□□□□ 0.95
SYT15-204ENST00000449358 CUX2O14529 1486 aa20.93■□□□□ 0.94
SYT15-204ENST00000449358 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SYT15-204ENST00000449358 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.71■□□□□ 0.91
SYT15-204ENST00000449358 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.69■□□□□ 0.9
SYT15-204ENST00000449358 CFTRP13569 1480 aa20.69■□□□□ 0.9
SYT15-204ENST00000449358 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.69■□□□□ 0.9
SYT15-204ENST00000449358 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SYT15-204ENST00000449358 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.67■□□□□ 0.9
SYT15-204ENST00000449358 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.66■□□□□ 0.9
SYT15-204ENST00000449358 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.64■□□□□ 0.89
SYT15-204ENST00000449358 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SYT15-204ENST00000449358 WDR62O43379 1518 aa20.5■□□□□ 0.87
SYT15-204ENST00000449358 PRDM2Q13029 1718 aa20.39■□□□□ 0.86
SYT15-204ENST00000449358 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SYT15-204ENST00000449358 ABCC8Q09428 1581 aa20.38■□□□□ 0.85
SYT15-204ENST00000449358 TOPBP1Q92547 1522 aa20.27■□□□□ 0.84
SYT15-204ENST00000449358 IFT140Q96RY7 1462 aa20.26■□□□□ 0.83
SYT15-204ENST00000449358 OSCARQ8IYS5 282 aa20.25■□□□□ 0.83
SYT15-204ENST00000449358 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.22■□□□□ 0.83
SYT15-204ENST00000449358 SOGA1O94964 1423 aa20.14■□□□□ 0.81
SYT15-204ENST00000449358 FBLN2P98095 1184 aa20.14■□□□□ 0.81
SYT15-204ENST00000449358 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYT15-204ENST00000449358 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYT15-204ENST00000449358 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
SYT15-204ENST00000449358 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.05■□□□□ 0.8
SYT15-204ENST00000449358 TRIM41Q8WV44 630 aa20.04■□□□□ 0.8
SYT15-204ENST00000449358 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SYT15-204ENST00000449358 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.03■□□□□ 0.8
SYT15-204ENST00000449358 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SYT15-204ENST00000449358 CUX1P39880 1505 aa20■□□□□ 0.79
SYT15-204ENST00000449358 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SYT15-204ENST00000449358 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SYT15-204ENST00000449358 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.78
SYT15-204ENST00000449358 GRIN2BQ13224 1484 aa19.87■□□□□ 0.77
SYT15-204ENST00000449358 WDR97A6NE52 1622 aa19.86■□□□□ 0.77
SYT15-204ENST00000449358 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.86■□□□□ 0.77
SYT15-204ENST00000449358 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.84■□□□□ 0.77
SYT15-204ENST00000449358 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
SYT15-204ENST00000449358 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.8■□□□□ 0.76
SYT15-204ENST00000449358 TOP2BQ02880 1626 aa19.78■□□□□ 0.76
SYT15-204ENST00000449358 CHD1O14646 1710 aa19.76■□□□□ 0.75
SYT15-204ENST00000449358 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.76■□□□□ 0.75
SYT15-204ENST00000449358 SYNJ2O15056 1496 aa19.73■□□□□ 0.75
SYT15-204ENST00000449358 SYNJ1O43426 1573 aa19.73■□□□□ 0.75
SYT15-204ENST00000449358 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.73■□□□□ 0.75
SYT15-204ENST00000449358 ARHGEF11O15085 1522 aa19.67■□□□□ 0.74
SYT15-204ENST00000449358 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.67■□□□□ 0.74
SYT15-204ENST00000449358 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.67■□□□□ 0.74
SYT15-204ENST00000449358 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.67■□□□□ 0.74
SYT15-204ENST00000449358 PBRM1Q86U86 1689 aa19.67■□□□□ 0.74
SYT15-204ENST00000449358 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.64■□□□□ 0.73
SYT15-204ENST00000449358 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.62■□□□□ 0.73
SYT15-204ENST00000449358 KIF27Q86VH2 1401 aa19.59■□□□□ 0.73
SYT15-204ENST00000449358 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.57■□□□□ 0.72
SYT15-204ENST00000449358 GRIN2AQ12879 1464 aa19.56■□□□□ 0.72
SYT15-204ENST00000449358 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
SYT15-204ENST00000449358 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.51■□□□□ 0.71
SYT15-204ENST00000449358 ADAMTS12P58397 1594 aa19.5■□□□□ 0.71
SYT15-204ENST00000449358 JPH4Q96JJ6 628 aa19.47■□□□□ 0.71
SYT15-204ENST00000449358 ARAP1Q96P48 1450 aa19.47■□□□□ 0.71
SYT15-204ENST00000449358 IGF1RP08069 1367 aa19.46■□□□□ 0.71
SYT15-204ENST00000449358 NUP160Q12769 1436 aa19.43■□□□□ 0.7
SYT15-204ENST00000449358 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.42■□□□□ 0.7
SYT15-204ENST00000449358 CEP170Q5SW79 1584 aa19.39■□□□□ 0.69
SYT15-204ENST00000449358 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.37■□□□□ 0.69
SYT15-204ENST00000449358 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms