RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448992.5

RHBDD1-209, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-209ENST00000448992 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.74■■■■□ 3.63
RHBDD1-209ENST00000448992 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.93■■■■□ 3.02
RHBDD1-209ENST00000448992 ABCC9O60706 1549 aa33.91■■■■□ 3.02
RHBDD1-209ENST00000448992 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.32■■■□□ 2.76
RHBDD1-209ENST00000448992 NACADO15069 1562 aa32.07■■■□□ 2.72
RHBDD1-209ENST00000448992 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.92■■■□□ 2.7
RHBDD1-209ENST00000448992 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.7■■■□□ 2.67
RHBDD1-209ENST00000448992 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.6■■■□□ 2.65
RHBDD1-209ENST00000448992 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.54■■■□□ 2.64
RHBDD1-209ENST00000448992 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.51■■■□□ 2.63
RHBDD1-209ENST00000448992 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
RHBDD1-209ENST00000448992 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.26■■■□□ 2.6
RHBDD1-209ENST00000448992 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.19■■■□□ 2.58
RHBDD1-209ENST00000448992 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.96■■■□□ 2.55
RHBDD1-209ENST00000448992 SCRIBQ14160 1630 aa30.91■■■□□ 2.54
RHBDD1-209ENST00000448992 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.63■■■□□ 2.49
RHBDD1-209ENST00000448992 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
RHBDD1-209ENST00000448992 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.57■■■□□ 2.48
RHBDD1-209ENST00000448992 NCAPD3P42695 1498 aa29.56■■■□□ 2.32
RHBDD1-209ENST00000448992 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.48■■■□□ 2.31
RHBDD1-209ENST00000448992 SMARCA4P51532 1647 aa29.46■■■□□ 2.31
RHBDD1-209ENST00000448992 SMARCA2P51531 1590 aa29.45■■■□□ 2.31
RHBDD1-209ENST00000448992 HMGXB3Q12766 1538 aa29.38■■■□□ 2.29
RHBDD1-209ENST00000448992 ERCC6Q03468 1493 aa29.36■■■□□ 2.29
RHBDD1-209ENST00000448992 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
RHBDD1-209ENST00000448992 CUX2O14529 1486 aa29.26■■■□□ 2.27
RHBDD1-209ENST00000448992 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
RHBDD1-209ENST00000448992 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.2■■■□□ 2.26
RHBDD1-209ENST00000448992 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.17■■■□□ 2.26
RHBDD1-209ENST00000448992 NESP48681 1621 aa29.09■■■□□ 2.25
RHBDD1-209ENST00000448992 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.06■■■□□ 2.24
RHBDD1-209ENST00000448992 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.95■■■□□ 2.22
RHBDD1-209ENST00000448992 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
RHBDD1-209ENST00000448992 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.8■■■□□ 2.2
RHBDD1-209ENST00000448992 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.75■■■□□ 2.19
RHBDD1-209ENST00000448992 WIZO95785 1651 aa28.73■■■□□ 2.19
RHBDD1-209ENST00000448992 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.68■■■□□ 2.18
RHBDD1-209ENST00000448992 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.53■■■□□ 2.16
RHBDD1-209ENST00000448992 WDR62O43379 1518 aa28.45■■■□□ 2.15
RHBDD1-209ENST00000448992 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
RHBDD1-209ENST00000448992 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.44■■■□□ 2.14
RHBDD1-209ENST00000448992 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
RHBDD1-209ENST00000448992 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.37■■■□□ 2.13
RHBDD1-209ENST00000448992 CFTRP13569 1480 aa28.34■■■□□ 2.13
RHBDD1-209ENST00000448992 PRDM2Q13029 1718 aa28.11■■■□□ 2.09
RHBDD1-209ENST00000448992 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
RHBDD1-209ENST00000448992 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.04■■■□□ 2.08
RHBDD1-209ENST00000448992 TRIM41Q8WV44 630 aa27.98■■■□□ 2.07
RHBDD1-209ENST00000448992 OSCARQ8IYS5 282 aa27.92■■■□□ 2.06
RHBDD1-209ENST00000448992 IFT140Q96RY7 1462 aa27.86■■■□□ 2.05
RHBDD1-209ENST00000448992 TOPBP1Q92547 1522 aa27.82■■■□□ 2.04
RHBDD1-209ENST00000448992 ABCC8Q09428 1581 aa27.82■■■□□ 2.04
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
RHBDD1-209ENST00000448992 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.74■■■□□ 2.03
RHBDD1-209ENST00000448992 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
RHBDD1-209ENST00000448992 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
RHBDD1-209ENST00000448992 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.54■■■□□ 2
RHBDD1-209ENST00000448992 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.54■■■□□ 2
RHBDD1-209ENST00000448992 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.54■■■□□ 2
RHBDD1-209ENST00000448992 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
RHBDD1-209ENST00000448992 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.51■■■□□ 2
RHBDD1-209ENST00000448992 ARHGEF11O15085 1522 aa27.45■■□□□ 1.98
RHBDD1-209ENST00000448992 CHD1O14646 1710 aa27.44■■□□□ 1.98
RHBDD1-209ENST00000448992 SOGA1O94964 1423 aa27.42■■□□□ 1.98
RHBDD1-209ENST00000448992 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.41■■□□□ 1.98
RHBDD1-209ENST00000448992 FBLN2P98095 1184 aa27.41■■□□□ 1.98
RHBDD1-209ENST00000448992 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.37■■□□□ 1.97
RHBDD1-209ENST00000448992 WDR97A6NE52 1622 aa27.35■■□□□ 1.97
RHBDD1-209ENST00000448992 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
RHBDD1-209ENST00000448992 CUX1P39880 1505 aa27.31■■□□□ 1.96
RHBDD1-209ENST00000448992 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.27■■□□□ 1.96
RHBDD1-209ENST00000448992 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.26■■□□□ 1.95
RHBDD1-209ENST00000448992 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
RHBDD1-209ENST00000448992 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
RHBDD1-209ENST00000448992 GRIN2BQ13224 1484 aa27.2■■□□□ 1.95
RHBDD1-209ENST00000448992 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
RHBDD1-209ENST00000448992 ARAP1Q96P48 1450 aa27.16■■□□□ 1.94
RHBDD1-209ENST00000448992 SYNJ1O43426 1573 aa27.16■■□□□ 1.94
RHBDD1-209ENST00000448992 SYNJ2O15056 1496 aa27.12■■□□□ 1.93
RHBDD1-209ENST00000448992 PBRM1Q86U86 1689 aa27.11■■□□□ 1.93
RHBDD1-209ENST00000448992 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.11■■□□□ 1.93
RHBDD1-209ENST00000448992 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.09■■□□□ 1.93
RHBDD1-209ENST00000448992 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.06■■□□□ 1.92
RHBDD1-209ENST00000448992 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.02■■□□□ 1.92
RHBDD1-209ENST00000448992 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
RHBDD1-209ENST00000448992 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
RHBDD1-209ENST00000448992 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.91■■□□□ 1.9
RHBDD1-209ENST00000448992 TOP2BQ02880 1626 aa26.9■■□□□ 1.9
RHBDD1-209ENST00000448992 GRIN2AQ12879 1464 aa26.84■■□□□ 1.89
RHBDD1-209ENST00000448992 ADAMTS12P58397 1594 aa26.83■■□□□ 1.89
RHBDD1-209ENST00000448992 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.76■■□□□ 1.87
RHBDD1-209ENST00000448992 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.74■■□□□ 1.87
RHBDD1-209ENST00000448992 CEP170Q5SW79 1584 aa26.73■■□□□ 1.87
RHBDD1-209ENST00000448992 NUP160Q12769 1436 aa26.73■■□□□ 1.87
RHBDD1-209ENST00000448992 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.65■■□□□ 1.86
RHBDD1-209ENST00000448992 SHROOM2Q13796 1616 aa26.61■■□□□ 1.85
RHBDD1-209ENST00000448992 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
RHBDD1-209ENST00000448992 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.46■■□□□ 1.83
RHBDD1-209ENST00000448992 JPH4Q96JJ6 628 aa26.46■■□□□ 1.83
RHBDD1-209ENST00000448992 KIF27Q86VH2 1401 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms