RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448887.1

FREM2-AS1-201, FREM2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene FREM2-AS1, Length 465 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM2-AS1-201ENST00000448887 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.78■□□□□ 0.44
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.8■□□□□ 0.12
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ABCC9O60706 1549 aa15.57■□□□□ 0.08
FREM2-AS1-201ENST00000448887 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.93□□□□□ -0.02
FREM2-AS1-201ENST00000448887 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.93□□□□□ -0.02
FREM2-AS1-201ENST00000448887 NACADO15069 1562 aa14.89□□□□□ -0.03
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
FREM2-AS1-201ENST00000448887 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.78□□□□□ -0.04
FREM2-AS1-201ENST00000448887 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.7□□□□□ -0.06
FREM2-AS1-201ENST00000448887 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.56□□□□□ -0.08
FREM2-AS1-201ENST00000448887 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
FREM2-AS1-201ENST00000448887 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.47□□□□□ -0.09
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SCRIBQ14160 1630 aa14.45□□□□□ -0.1
FREM2-AS1-201ENST00000448887 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.35□□□□□ -0.11
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.31□□□□□ -0.12
FREM2-AS1-201ENST00000448887 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.06□□□□□ -0.16
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.99□□□□□ -0.17
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SMARCA4P51532 1647 aa13.81□□□□□ -0.2
FREM2-AS1-201ENST00000448887 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
FREM2-AS1-201ENST00000448887 NCAPD3P42695 1498 aa13.75□□□□□ -0.21
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.75□□□□□ -0.21
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SMARCA2P51531 1590 aa13.73□□□□□ -0.21
FREM2-AS1-201ENST00000448887 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.71□□□□□ -0.21
FREM2-AS1-201ENST00000448887 HMGXB3Q12766 1538 aa13.67□□□□□ -0.22
FREM2-AS1-201ENST00000448887 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.66□□□□□ -0.22
FREM2-AS1-201ENST00000448887 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
FREM2-AS1-201ENST00000448887 WIZO95785 1651 aa13.55□□□□□ -0.24
FREM2-AS1-201ENST00000448887 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
FREM2-AS1-201ENST00000448887 NESP48681 1621 aa13.46□□□□□ -0.26
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ERCC6Q03468 1493 aa13.43□□□□□ -0.26
FREM2-AS1-201ENST00000448887 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
FREM2-AS1-201ENST00000448887 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.39□□□□□ -0.27
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.36□□□□□ -0.27
FREM2-AS1-201ENST00000448887 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.32□□□□□ -0.28
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CUX2O14529 1486 aa13.29□□□□□ -0.28
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CFTRP13569 1480 aa13.27□□□□□ -0.29
FREM2-AS1-201ENST00000448887 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.27□□□□□ -0.29
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.26□□□□□ -0.29
FREM2-AS1-201ENST00000448887 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
FREM2-AS1-201ENST00000448887 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.21□□□□□ -0.3
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.19□□□□□ -0.3
FREM2-AS1-201ENST00000448887 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.18□□□□□ -0.3
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
FREM2-AS1-201ENST00000448887 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.14□□□□□ -0.31
FREM2-AS1-201ENST00000448887 WDR62O43379 1518 aa13.13□□□□□ -0.31
FREM2-AS1-201ENST00000448887 PRDM2Q13029 1718 aa13.1□□□□□ -0.31
FREM2-AS1-201ENST00000448887 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
FREM2-AS1-201ENST00000448887 TOPBP1Q92547 1522 aa12.98□□□□□ -0.33
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ABCC8Q09428 1581 aa12.96□□□□□ -0.33
FREM2-AS1-201ENST00000448887 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.95□□□□□ -0.34
FREM2-AS1-201ENST00000448887 IFT140Q96RY7 1462 aa12.91□□□□□ -0.34
FREM2-AS1-201ENST00000448887 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CUX1P39880 1505 aa12.86□□□□□ -0.35
FREM2-AS1-201ENST00000448887 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FREM2-AS1-201ENST00000448887 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.83□□□□□ -0.36
FREM2-AS1-201ENST00000448887 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.83□□□□□ -0.36
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SOGA1O94964 1423 aa12.82□□□□□ -0.36
FREM2-AS1-201ENST00000448887 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
FREM2-AS1-201ENST00000448887 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.36
FREM2-AS1-201ENST00000448887 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
FREM2-AS1-201ENST00000448887 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.37
FREM2-AS1-201ENST00000448887 OSCARQ8IYS5 282 aa12.75□□□□□ -0.37
FREM2-AS1-201ENST00000448887 TOP2BQ02880 1626 aa12.73□□□□□ -0.37
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SYNJ1O43426 1573 aa12.73□□□□□ -0.37
FREM2-AS1-201ENST00000448887 WDR97A6NE52 1622 aa12.72□□□□□ -0.37
FREM2-AS1-201ENST00000448887 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.71□□□□□ -0.37
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.7□□□□□ -0.38
FREM2-AS1-201ENST00000448887 GRIN2BQ13224 1484 aa12.68□□□□□ -0.38
FREM2-AS1-201ENST00000448887 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.67□□□□□ -0.38
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.67□□□□□ -0.38
FREM2-AS1-201ENST00000448887 FBLN2P98095 1184 aa12.67□□□□□ -0.38
FREM2-AS1-201ENST00000448887 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.64□□□□□ -0.39
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CHD1O14646 1710 aa12.64□□□□□ -0.39
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
FREM2-AS1-201ENST00000448887 PBRM1Q86U86 1689 aa12.61□□□□□ -0.39
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SYNJ2O15056 1496 aa12.6□□□□□ -0.39
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.54□□□□□ -0.4
FREM2-AS1-201ENST00000448887 TRIM41Q8WV44 630 aa12.54□□□□□ -0.4
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ARHGEF11O15085 1522 aa12.53□□□□□ -0.4
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ADAMTS12P58397 1594 aa12.53□□□□□ -0.4
FREM2-AS1-201ENST00000448887 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.53□□□□□ -0.4
FREM2-AS1-201ENST00000448887 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.52□□□□□ -0.4
FREM2-AS1-201ENST00000448887 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.52□□□□□ -0.4
FREM2-AS1-201ENST00000448887 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.52□□□□□ -0.4
FREM2-AS1-201ENST00000448887 GRIN2AQ12879 1464 aa12.52□□□□□ -0.41
FREM2-AS1-201ENST00000448887 KIF27Q86VH2 1401 aa12.51□□□□□ -0.41
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.51□□□□□ -0.41
FREM2-AS1-201ENST00000448887 IGF1RP08069 1367 aa12.46□□□□□ -0.41
FREM2-AS1-201ENST00000448887 NUP160Q12769 1436 aa12.45□□□□□ -0.42
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CEP170Q5SW79 1584 aa12.45□□□□□ -0.42
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.44□□□□□ -0.42
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ARAP1Q96P48 1450 aa12.43□□□□□ -0.42
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CUL7Q14999 1698 aa12.41□□□□□ -0.42
FREM2-AS1-201ENST00000448887 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.39□□□□□ -0.43
FREM2-AS1-201ENST00000448887 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.37□□□□□ -0.43
FREM2-AS1-201ENST00000448887 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.35□□□□□ -0.43
FREM2-AS1-201ENST00000448887 SHROOM2Q13796 1616 aa12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms