RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448778.1

C10orf10-202, humanhuman

TSL 3

Gene C10orf10, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf10-202ENST00000448778 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.13■■■■□ 3.21
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C10orf10-202ENST00000448778 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.48■■■□□ 2.47
C10orf10-202ENST00000448778 NACADO15069 1562 aa30.14■■■□□ 2.42
C10orf10-202ENST00000448778 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
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C10orf10-202ENST00000448778 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.85■■■□□ 2.37
C10orf10-202ENST00000448778 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.66■■■□□ 2.34
C10orf10-202ENST00000448778 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.52■■■□□ 2.32
C10orf10-202ENST00000448778 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.16■■■□□ 2.26
C10orf10-202ENST00000448778 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.16■■■□□ 2.26
C10orf10-202ENST00000448778 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.12■■■□□ 2.25
C10orf10-202ENST00000448778 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
C10orf10-202ENST00000448778 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
C10orf10-202ENST00000448778 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.95■■■□□ 2.23
C10orf10-202ENST00000448778 SCRIBQ14160 1630 aa28.94■■■□□ 2.22
C10orf10-202ENST00000448778 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.66■■■□□ 2.18
C10orf10-202ENST00000448778 CUX2O14529 1486 aa28.03■■■□□ 2.08
C10orf10-202ENST00000448778 ERCC6Q03468 1493 aa27.91■■■□□ 2.06
C10orf10-202ENST00000448778 NCAPD3P42695 1498 aa27.84■■■□□ 2.05
C10orf10-202ENST00000448778 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.7■■■□□ 2.02
C10orf10-202ENST00000448778 NESP48681 1621 aa27.63■■■□□ 2.01
C10orf10-202ENST00000448778 HMGXB3Q12766 1538 aa27.57■■■□□ 2
C10orf10-202ENST00000448778 SMARCA2P51531 1590 aa27.56■■■□□ 2
C10orf10-202ENST00000448778 SMARCA4P51532 1647 aa27.52■■■□□ 2
C10orf10-202ENST00000448778 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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C10orf10-202ENST00000448778 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
C10orf10-202ENST00000448778 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.29■■□□□ 1.96
C10orf10-202ENST00000448778 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.25■■□□□ 1.95
C10orf10-202ENST00000448778 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.24■■□□□ 1.95
C10orf10-202ENST00000448778 TRIM41Q8WV44 630 aa27.2■■□□□ 1.94
C10orf10-202ENST00000448778 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.15■■□□□ 1.94
C10orf10-202ENST00000448778 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.09■■□□□ 1.93
C10orf10-202ENST00000448778 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.97■■□□□ 1.91
C10orf10-202ENST00000448778 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.96■■□□□ 1.91
C10orf10-202ENST00000448778 WDR62O43379 1518 aa26.92■■□□□ 1.9
C10orf10-202ENST00000448778 WIZO95785 1651 aa26.75■■□□□ 1.87
C10orf10-202ENST00000448778 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.74■■□□□ 1.87
C10orf10-202ENST00000448778 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.68■■□□□ 1.86
C10orf10-202ENST00000448778 OSCARQ8IYS5 282 aa26.67■■□□□ 1.86
C10orf10-202ENST00000448778 CFTRP13569 1480 aa26.55■■□□□ 1.84
C10orf10-202ENST00000448778 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
C10orf10-202ENST00000448778 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.42■■□□□ 1.82
C10orf10-202ENST00000448778 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.42■■□□□ 1.82
C10orf10-202ENST00000448778 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.42■■□□□ 1.82
C10orf10-202ENST00000448778 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
C10orf10-202ENST00000448778 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
C10orf10-202ENST00000448778 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
C10orf10-202ENST00000448778 ARHGEF11O15085 1522 aa26.26■■□□□ 1.79
C10orf10-202ENST00000448778 PRDM2Q13029 1718 aa26.24■■□□□ 1.79
C10orf10-202ENST00000448778 IFT140Q96RY7 1462 aa26.23■■□□□ 1.79
C10orf10-202ENST00000448778 TOPBP1Q92547 1522 aa26.11■■□□□ 1.77
C10orf10-202ENST00000448778 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.11■■□□□ 1.77
C10orf10-202ENST00000448778 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
C10orf10-202ENST00000448778 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.06■■□□□ 1.76
C10orf10-202ENST00000448778 CHD1O14646 1710 aa26.01■■□□□ 1.75
C10orf10-202ENST00000448778 ARAP1Q96P48 1450 aa25.98■■□□□ 1.75
C10orf10-202ENST00000448778 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
C10orf10-202ENST00000448778 ABCC8Q09428 1581 aa25.98■■□□□ 1.75
C10orf10-202ENST00000448778 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.753e-7■■■■■ 38.8
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C10orf10-202ENST00000448778 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
C10orf10-202ENST00000448778 FBLN2P98095 1184 aa25.89■■□□□ 1.74
C10orf10-202ENST00000448778 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
C10orf10-202ENST00000448778 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.75■■□□□ 1.71
C10orf10-202ENST00000448778 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
C10orf10-202ENST00000448778 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.69■■□□□ 1.7
C10orf10-202ENST00000448778 SOGA1O94964 1423 aa25.68■■□□□ 1.7
C10orf10-202ENST00000448778 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.67■■□□□ 1.7
C10orf10-202ENST00000448778 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
C10orf10-202ENST00000448778 SYNJ1O43426 1573 aa25.6■■□□□ 1.69
C10orf10-202ENST00000448778 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
C10orf10-202ENST00000448778 WDR97A6NE52 1622 aa25.58■■□□□ 1.69
C10orf10-202ENST00000448778 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.58■■□□□ 1.69
C10orf10-202ENST00000448778 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
C10orf10-202ENST00000448778 GRIN2BQ13224 1484 aa25.5■■□□□ 1.67
C10orf10-202ENST00000448778 SYNJ2O15056 1496 aa25.49■■□□□ 1.67
C10orf10-202ENST00000448778 CUX1P39880 1505 aa25.47■■□□□ 1.67
C10orf10-202ENST00000448778 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.44■■□□□ 1.66
C10orf10-202ENST00000448778 PBRM1Q86U86 1689 aa25.39■■□□□ 1.66
C10orf10-202ENST00000448778 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.29■■□□□ 1.64
C10orf10-202ENST00000448778 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.26■■□□□ 1.63
C10orf10-202ENST00000448778 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.24■■□□□ 1.63
C10orf10-202ENST00000448778 GRIN2AQ12879 1464 aa25.19■■□□□ 1.62
C10orf10-202ENST00000448778 CEP170Q5SW79 1584 aa25.17■■□□□ 1.62
C10orf10-202ENST00000448778 NUP160Q12769 1436 aa25.12■■□□□ 1.61
C10orf10-202ENST00000448778 ADAMTS12P58397 1594 aa25.12■■□□□ 1.61
C10orf10-202ENST00000448778 SHROOM2Q13796 1616 aa25.08■■□□□ 1.61
C10orf10-202ENST00000448778 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.07■■□□□ 1.6
C10orf10-202ENST00000448778 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
C10orf10-202ENST00000448778 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25■■□□□ 1.59
C10orf10-202ENST00000448778 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
C10orf10-202ENST00000448778 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.91■■□□□ 1.58
C10orf10-202ENST00000448778 TOP2BQ02880 1626 aa24.9■■□□□ 1.58
C10orf10-202ENST00000448778 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.9■■□□□ 1.58
C10orf10-202ENST00000448778 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.86■■□□□ 1.57
C10orf10-202ENST00000448778 JPH4Q96JJ6 628 aa24.86■■□□□ 1.57
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