RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448332.1

CXorf40A-210, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXorf40A, Length 364 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-210ENST00000448332 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.98■■■■■ 4.79
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CXorf40A-210ENST00000448332 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.11■■■■□ 3.53
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CXorf40A-210ENST00000448332 SCRIBQ14160 1630 aa36.7■■■■□ 3.47
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CXorf40A-210ENST00000448332 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.47■■■■□ 3.43
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CXorf40A-210ENST00000448332 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.83■■■■□ 3.33
CXorf40A-210ENST00000448332 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.66■■■■□ 3.3
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CXorf40A-210ENST00000448332 SMARCA2P51531 1590 aa34.89■■■■□ 3.18
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CXorf40A-210ENST00000448332 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.85■■■■□ 3.17
CXorf40A-210ENST00000448332 HMGXB3Q12766 1538 aa34.76■■■■□ 3.15
CXorf40A-210ENST00000448332 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.65■■■■□ 3.14
CXorf40A-210ENST00000448332 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
CXorf40A-210ENST00000448332 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.64■■■■□ 3.14
CXorf40A-210ENST00000448332 WIZO95785 1651 aa34.3■■■■□ 3.08
CXorf40A-210ENST00000448332 ERCC6Q03468 1493 aa34.29■■■■□ 3.08
CXorf40A-210ENST00000448332 NESP48681 1621 aa34.15■■■■□ 3.06
CXorf40A-210ENST00000448332 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CXorf40A-210ENST00000448332 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.11■■■■□ 3.05
CXorf40A-210ENST00000448332 CUX2O14529 1486 aa33.97■■■■□ 3.03
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CXorf40A-210ENST00000448332 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.87■■■■□ 3.01
CXorf40A-210ENST00000448332 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.85■■■■□ 3.01
CXorf40A-210ENST00000448332 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.82■■■■□ 3
CXorf40A-210ENST00000448332 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
CXorf40A-210ENST00000448332 CFTRP13569 1480 aa33.58■■■□□ 2.97
CXorf40A-210ENST00000448332 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.56■■■□□ 2.96
CXorf40A-210ENST00000448332 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.55■■■□□ 2.96
CXorf40A-210ENST00000448332 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.52■■■□□ 2.96
CXorf40A-210ENST00000448332 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.48■■■□□ 2.95
CXorf40A-210ENST00000448332 PRDM2Q13029 1718 aa33.44■■■□□ 2.94
CXorf40A-210ENST00000448332 WDR62O43379 1518 aa33.43■■■□□ 2.94
CXorf40A-210ENST00000448332 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.18■■■□□ 2.9
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CXorf40A-210ENST00000448332 ABCC8Q09428 1581 aa32.95■■■□□ 2.86
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CXorf40A-210ENST00000448332 IFT140Q96RY7 1462 aa32.84■■■□□ 2.85
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CXorf40A-210ENST00000448332 CUX1P39880 1505 aa32.54■■■□□ 2.8
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CXorf40A-210ENST00000448332 SOGA1O94964 1423 aa32.48■■■□□ 2.79
CXorf40A-210ENST00000448332 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.47■■■□□ 2.79
CXorf40A-210ENST00000448332 OSCARQ8IYS5 282 aa32.45■■■□□ 2.79
CXorf40A-210ENST00000448332 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.43■■■□□ 2.78
CXorf40A-210ENST00000448332 WDR97A6NE52 1622 aa32.39■■■□□ 2.78
CXorf40A-210ENST00000448332 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.77
CXorf40A-210ENST00000448332 CHD1O14646 1710 aa32.26■■■□□ 2.76
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CXorf40A-210ENST00000448332 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.23■■■□□ 2.75
CXorf40A-210ENST00000448332 TOP2BQ02880 1626 aa32.22■■■□□ 2.75
CXorf40A-210ENST00000448332 FBLN2P98095 1184 aa32.2■■■□□ 2.75
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CXorf40A-210ENST00000448332 SYNJ1O43426 1573 aa32.19■■■□□ 2.74
CXorf40A-210ENST00000448332 GRIN2BQ13224 1484 aa32.18■■■□□ 2.74
CXorf40A-210ENST00000448332 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.17■■■□□ 2.74
CXorf40A-210ENST00000448332 PBRM1Q86U86 1689 aa32.15■■■□□ 2.74
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CXorf40A-210ENST00000448332 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.1■■■□□ 2.73
CXorf40A-210ENST00000448332 TRIM41Q8WV44 630 aa32.09■■■□□ 2.73
CXorf40A-210ENST00000448332 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
CXorf40A-210ENST00000448332 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.02■■■□□ 2.72
CXorf40A-210ENST00000448332 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.02■■■□□ 2.72
CXorf40A-210ENST00000448332 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.02■■■□□ 2.72
CXorf40A-210ENST00000448332 SYNJ2O15056 1496 aa32.01■■■□□ 2.71
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CXorf40A-210ENST00000448332 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.85■■■□□ 2.69
CXorf40A-210ENST00000448332 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.81■■■□□ 2.68
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CXorf40A-210ENST00000448332 KIF27Q86VH2 1401 aa31.63■■■□□ 2.65
CXorf40A-210ENST00000448332 CEP170Q5SW79 1584 aa31.6■■■□□ 2.65
CXorf40A-210ENST00000448332 NUP160Q12769 1436 aa31.58■■■□□ 2.65
CXorf40A-210ENST00000448332 CUL7Q14999 1698 aa31.53■■■□□ 2.64
CXorf40A-210ENST00000448332 SHROOM2Q13796 1616 aa31.41■■■□□ 2.62
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CXorf40A-210ENST00000448332 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.39■■■□□ 2.62
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CXorf40A-210ENST00000448332 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.29■■■□□ 2.6
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