RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.14■■■□□ 2.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABCC9O60706 1549 aa31.76■■■□□ 2.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.35■■■□□ 2.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NACADO15069 1562 aa30.22■■■□□ 2.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.68■■■□□ 2.34
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.48■■■□□ 2.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCRIBQ14160 1630 aa29.34■■■□□ 2.29
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.53■■■□□ 2.16
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMARCA4P51532 1647 aa28.01■■■□□ 2.07
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.89■■■□□ 2.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NCAPD3P42695 1498 aa27.88■■■□□ 2.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMARCA2P51531 1590 aa27.8■■■□□ 2.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HMGXB3Q12766 1538 aa27.75■■■□□ 2.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.75■■■□□ 2.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.7■■■□□ 2.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WIZO95785 1651 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NESP48681 1621 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERCC6Q03468 1493 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CUX2O14529 1486 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CFTRP13569 1480 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRDM2Q13029 1718 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR62O43379 1518 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TOPBP1Q92547 1522 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABCC8Q09428 1581 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFT140Q96RY7 1462 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CUX1P39880 1505 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26■■□□□ 1.75
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SOGA1O94964 1423 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OSCARQ8IYS5 282 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHD1O14646 1710 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR97A6NE52 1622 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SYNJ1O43426 1573 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PBRM1Q86U86 1689 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TOP2BQ02880 1626 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRIM41Q8WV44 630 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GRIN2BQ13224 1484 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FBLN2P98095 1184 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARHGEF11O15085 1522 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SYNJ2O15056 1496 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADAMTS12P58397 1594 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARAP1Q96P48 1450 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GRIN2AQ12879 1464 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CEP170Q5SW79 1584 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NUP160Q12769 1436 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SHROOM2Q13796 1616 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIF27Q86VH2 1401 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CUL7Q14999 1698 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGF1RP08069 1367 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
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