RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447934.1

TMEM250-202, Transcript of transmembrane protein 250, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM250, Length 648 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM250-202ENST00000447934 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.3■■■■■ 6.76
TMEM250-202ENST00000447934 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.38■■■■■ 5.82
TMEM250-202ENST00000447934 ABCC9O60706 1549 aa51.24■■■■■ 5.79
TMEM250-202ENST00000447934 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.82■■■■■ 5.41
TMEM250-202ENST00000447934 NACADO15069 1562 aa48.51■■■■■ 5.36
TMEM250-202ENST00000447934 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.26■■■■■ 5.32
TMEM250-202ENST00000447934 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.96■■■■■ 5.27
TMEM250-202ENST00000447934 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.89■■■■■ 5.26
TMEM250-202ENST00000447934 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.78■■■■■ 5.24
TMEM250-202ENST00000447934 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.72■■■■■ 5.23
TMEM250-202ENST00000447934 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
TMEM250-202ENST00000447934 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.44■■■■■ 5.18
TMEM250-202ENST00000447934 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.33■■■■■ 5.17
TMEM250-202ENST00000447934 SCRIBQ14160 1630 aa46.83■■■■■ 5.09
TMEM250-202ENST00000447934 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.76■■■■■ 5.08
TMEM250-202ENST00000447934 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.31■■■■■ 5
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TMEM250-202ENST00000447934 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.13■■■■■ 4.98
TMEM250-202ENST00000447934 NCAPD3P42695 1498 aa44.78■■■■■ 4.76
TMEM250-202ENST00000447934 SMARCA4P51532 1647 aa44.69■■■■■ 4.74
TMEM250-202ENST00000447934 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.68■■■■■ 4.74
TMEM250-202ENST00000447934 SMARCA2P51531 1590 aa44.56■■■■■ 4.72
TMEM250-202ENST00000447934 HMGXB3Q12766 1538 aa44.48■■■■■ 4.71
TMEM250-202ENST00000447934 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
TMEM250-202ENST00000447934 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
TMEM250-202ENST00000447934 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.25■■■■■ 4.67
TMEM250-202ENST00000447934 ERCC6Q03468 1493 aa44.21■■■■■ 4.67
TMEM250-202ENST00000447934 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.18■■■■■ 4.66
TMEM250-202ENST00000447934 CUX2O14529 1486 aa44.08■■■■■ 4.65
TMEM250-202ENST00000447934 NESP48681 1621 aa44.07■■■■■ 4.65
TMEM250-202ENST00000447934 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.9■■■■■ 4.62
TMEM250-202ENST00000447934 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.76■■■■■ 4.6
TMEM250-202ENST00000447934 WIZO95785 1651 aa43.66■■■■■ 4.58
TMEM250-202ENST00000447934 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
TMEM250-202ENST00000447934 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.53■■■■■ 4.56
TMEM250-202ENST00000447934 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.48■■■■■ 4.55
TMEM250-202ENST00000447934 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.42■■■■■ 4.54
TMEM250-202ENST00000447934 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
TMEM250-202ENST00000447934 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.13■■■■■ 4.49
TMEM250-202ENST00000447934 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
TMEM250-202ENST00000447934 WDR62O43379 1518 aa43.03■■■■■ 4.48
TMEM250-202ENST00000447934 CFTRP13569 1480 aa42.98■■■■■ 4.47
TMEM250-202ENST00000447934 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.98■■■■■ 4.47
TMEM250-202ENST00000447934 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.95■■■■■ 4.47
TMEM250-202ENST00000447934 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.61■■■■■ 4.41
TMEM250-202ENST00000447934 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
TMEM250-202ENST00000447934 PRDM2Q13029 1718 aa42.6■■■■■ 4.41
TMEM250-202ENST00000447934 TOPBP1Q92547 1522 aa42.16■■■■■ 4.34
TMEM250-202ENST00000447934 IFT140Q96RY7 1462 aa42.11■■■■■ 4.33
TMEM250-202ENST00000447934 OSCARQ8IYS5 282 aa42.07■■■■■ 4.33
TMEM250-202ENST00000447934 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
TMEM250-202ENST00000447934 TRIM41Q8WV44 630 aa42.04■■■■■ 4.32
TMEM250-202ENST00000447934 ABCC8Q09428 1581 aa42.04■■■■■ 4.32
TMEM250-202ENST00000447934 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.01■■■■■ 4.32
TMEM250-202ENST00000447934 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
TMEM250-202ENST00000447934 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
TMEM250-202ENST00000447934 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
TMEM250-202ENST00000447934 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.68■■■■■ 4.26
TMEM250-202ENST00000447934 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.59■■■■■ 4.25
TMEM250-202ENST00000447934 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
TMEM250-202ENST00000447934 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
TMEM250-202ENST00000447934 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
TMEM250-202ENST00000447934 SOGA1O94964 1423 aa41.52■■■■■ 4.24
TMEM250-202ENST00000447934 CHD1O14646 1710 aa41.52■■■■■ 4.24
TMEM250-202ENST00000447934 CUX1P39880 1505 aa41.5■■■■■ 4.23
TMEM250-202ENST00000447934 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.5■■■■■ 4.23
TMEM250-202ENST00000447934 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
TMEM250-202ENST00000447934 ARHGEF11O15085 1522 aa41.44■■■■■ 4.23
TMEM250-202ENST00000447934 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
TMEM250-202ENST00000447934 FBLN2P98095 1184 aa41.35■■■■■ 4.21
TMEM250-202ENST00000447934 WDR97A6NE52 1622 aa41.35■■■■■ 4.21
TMEM250-202ENST00000447934 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.27■■■■■ 4.2
TMEM250-202ENST00000447934 GRIN2BQ13224 1484 aa41.15■■■■■ 4.18
TMEM250-202ENST00000447934 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
TMEM250-202ENST00000447934 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.1■■■■■ 4.17
TMEM250-202ENST00000447934 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
TMEM250-202ENST00000447934 ARAP1Q96P48 1450 aa41.05■■■■■ 4.16
TMEM250-202ENST00000447934 PBRM1Q86U86 1689 aa41.04■■■■■ 4.16
TMEM250-202ENST00000447934 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.03■■■■■ 4.16
TMEM250-202ENST00000447934 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.03■■■■■ 4.16
TMEM250-202ENST00000447934 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.03■■■■■ 4.16
TMEM250-202ENST00000447934 SYNJ2O15056 1496 aa41.01■■■■■ 4.16
TMEM250-202ENST00000447934 SYNJ1O43426 1573 aa40.99■■■■■ 4.15
TMEM250-202ENST00000447934 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.98■■■■■ 4.15
TMEM250-202ENST00000447934 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
TMEM250-202ENST00000447934 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.87■■■■■ 4.13
TMEM250-202ENST00000447934 TOP2BQ02880 1626 aa40.85■■■■■ 4.13
TMEM250-202ENST00000447934 ADAMTS12P58397 1594 aa40.66■■■■■ 4.1
TMEM250-202ENST00000447934 GRIN2AQ12879 1464 aa40.64■■■■■ 4.1
TMEM250-202ENST00000447934 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
TMEM250-202ENST00000447934 CEP170Q5SW79 1584 aa40.52■■■■■ 4.08
TMEM250-202ENST00000447934 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.52■■■■■ 4.08
TMEM250-202ENST00000447934 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.51■■■■■ 4.08
TMEM250-202ENST00000447934 NUP160Q12769 1436 aa40.5■■■■■ 4.07
TMEM250-202ENST00000447934 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.42■■■■■ 4.06
TMEM250-202ENST00000447934 SHROOM2Q13796 1616 aa40.33■■■■■ 4.05
TMEM250-202ENST00000447934 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
TMEM250-202ENST00000447934 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.09■■■■■ 4.01
TMEM250-202ENST00000447934 JPH4Q96JJ6 628 aa40.06■■■■■ 4
TMEM250-202ENST00000447934 KIF27Q86VH2 1401 aa40.03■■■■■ 4
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