RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447825.5

EPB41L1-213, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 1, humanhuman

TSL 3

Gene EPB41L1, Length 896 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L1-213ENST00000447825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.95■■■■■ 6.87
EPB41L1-213ENST00000447825 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.86■■■■■ 5.89
EPB41L1-213ENST00000447825 ABCC9O60706 1549 aa51.41■■■■■ 5.82
EPB41L1-213ENST00000447825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.12■■■■■ 5.45
EPB41L1-213ENST00000447825 NACADO15069 1562 aa48.87■■■■■ 5.41
EPB41L1-213ENST00000447825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.64■■■■■ 5.38
EPB41L1-213ENST00000447825 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.33■■■■■ 5.33
EPB41L1-213ENST00000447825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
EPB41L1-213ENST00000447825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.12■■■■■ 5.29
EPB41L1-213ENST00000447825 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.89■■■■■ 5.26
EPB41L1-213ENST00000447825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.89■■■■■ 5.26
EPB41L1-213ENST00000447825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.81■■■■■ 5.24
EPB41L1-213ENST00000447825 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.72■■■■■ 5.23
EPB41L1-213ENST00000447825 SCRIBQ14160 1630 aa47.3■■■■■ 5.16
EPB41L1-213ENST00000447825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.06■■■■■ 5.12
EPB41L1-213ENST00000447825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
EPB41L1-213ENST00000447825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.48■■■■■ 5.03
EPB41L1-213ENST00000447825 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.25■■■■■ 4.99
EPB41L1-213ENST00000447825 SMARCA4P51532 1647 aa45.15■■■■■ 4.82
EPB41L1-213ENST00000447825 NCAPD3P42695 1498 aa45.09■■■■■ 4.81
EPB41L1-213ENST00000447825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.04■■■■■ 4.8
EPB41L1-213ENST00000447825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
EPB41L1-213ENST00000447825 SMARCA2P51531 1590 aa44.94■■■■■ 4.79
EPB41L1-213ENST00000447825 HMGXB3Q12766 1538 aa44.85■■■■■ 4.77
EPB41L1-213ENST00000447825 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.69■■■■■ 4.74
EPB41L1-213ENST00000447825 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.69■■■■■ 4.74
EPB41L1-213ENST00000447825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
EPB41L1-213ENST00000447825 ERCC6Q03468 1493 aa44.33■■■■■ 4.69
EPB41L1-213ENST00000447825 NESP48681 1621 aa44.31■■■■■ 4.68
EPB41L1-213ENST00000447825 WIZO95785 1651 aa44.19■■■■■ 4.67
EPB41L1-213ENST00000447825 CUX2O14529 1486 aa44.11■■■■■ 4.65
EPB41L1-213ENST00000447825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.05■■■■■ 4.64
EPB41L1-213ENST00000447825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.61
EPB41L1-213ENST00000447825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
EPB41L1-213ENST00000447825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.8■■■■■ 4.6
EPB41L1-213ENST00000447825 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.73■■■■■ 4.59
EPB41L1-213ENST00000447825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.73■■■■■ 4.59
EPB41L1-213ENST00000447825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
EPB41L1-213ENST00000447825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.54■■■■■ 4.56
EPB41L1-213ENST00000447825 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.37■■■■■ 4.53
EPB41L1-213ENST00000447825 CFTRP13569 1480 aa43.35■■■■■ 4.53
EPB41L1-213ENST00000447825 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.29■■■■■ 4.52
EPB41L1-213ENST00000447825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.27■■■■■ 4.52
EPB41L1-213ENST00000447825 WDR62O43379 1518 aa43.27■■■■■ 4.52
EPB41L1-213ENST00000447825 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.12■■■■■ 4.49
EPB41L1-213ENST00000447825 PRDM2Q13029 1718 aa43.06■■■■■ 4.48
EPB41L1-213ENST00000447825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
EPB41L1-213ENST00000447825 TOPBP1Q92547 1522 aa42.51■■■■■ 4.4
EPB41L1-213ENST00000447825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.41■■■■■ 4.38
EPB41L1-213ENST00000447825 ABCC8Q09428 1581 aa42.39■■■■■ 4.38
EPB41L1-213ENST00000447825 IFT140Q96RY7 1462 aa42.39■■■■■ 4.38
EPB41L1-213ENST00000447825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
EPB41L1-213ENST00000447825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
EPB41L1-213ENST00000447825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
EPB41L1-213ENST00000447825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
EPB41L1-213ENST00000447825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
EPB41L1-213ENST00000447825 OSCARQ8IYS5 282 aa42.1■■■■■ 4.33
EPB41L1-213ENST00000447825 CUX1P39880 1505 aa41.96■■■■■ 4.31
EPB41L1-213ENST00000447825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.96■■■■■ 4.31
EPB41L1-213ENST00000447825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.95■■■■■ 4.31
EPB41L1-213ENST00000447825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.92■■■■■ 4.3
EPB41L1-213ENST00000447825 SOGA1O94964 1423 aa41.88■■■■■ 4.3
EPB41L1-213ENST00000447825 TRIM41Q8WV44 630 aa41.84■■■■■ 4.29
EPB41L1-213ENST00000447825 CHD1O14646 1710 aa41.77■■■■■ 4.28
EPB41L1-213ENST00000447825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.27
EPB41L1-213ENST00000447825 WDR97A6NE52 1622 aa41.71■■■■■ 4.27
EPB41L1-213ENST00000447825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.63■■■■■ 4.26
EPB41L1-213ENST00000447825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.63■■■■■ 4.26
EPB41L1-213ENST00000447825 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.63■■■■■ 4.26
EPB41L1-213ENST00000447825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.58■■■■■ 4.25
EPB41L1-213ENST00000447825 FBLN2P98095 1184 aa41.54■■■■■ 4.24
EPB41L1-213ENST00000447825 ARHGEF11O15085 1522 aa41.51■■■■■ 4.24
EPB41L1-213ENST00000447825 GRIN2BQ13224 1484 aa41.49■■■■■ 4.23
EPB41L1-213ENST00000447825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
EPB41L1-213ENST00000447825 PBRM1Q86U86 1689 aa41.45■■■■■ 4.23
EPB41L1-213ENST00000447825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.45■■■■■ 4.23
EPB41L1-213ENST00000447825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.44■■■■■ 4.22
EPB41L1-213ENST00000447825 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
EPB41L1-213ENST00000447825 TOP2BQ02880 1626 aa41.4■■■■■ 4.22
EPB41L1-213ENST00000447825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.4■■■■■ 4.22
EPB41L1-213ENST00000447825 SYNJ1O43426 1573 aa41.39■■■■■ 4.22
EPB41L1-213ENST00000447825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.22
EPB41L1-213ENST00000447825 SYNJ2O15056 1496 aa41.3■■■■■ 4.2
EPB41L1-213ENST00000447825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
EPB41L1-213ENST00000447825 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.26■■■■■ 4.2
EPB41L1-213ENST00000447825 ARAP1Q96P48 1450 aa41.15■■■■■ 4.18
EPB41L1-213ENST00000447825 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.1■■■■■ 4.17
EPB41L1-213ENST00000447825 ADAMTS12P58397 1594 aa41.06■■■■■ 4.16
EPB41L1-213ENST00000447825 GRIN2AQ12879 1464 aa40.98■■■■■ 4.15
EPB41L1-213ENST00000447825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.93■■■■■ 4.14
EPB41L1-213ENST00000447825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.89■■■■■ 4.14
EPB41L1-213ENST00000447825 CEP170Q5SW79 1584 aa40.85■■■■■ 4.13
EPB41L1-213ENST00000447825 NUP160Q12769 1436 aa40.82■■■■■ 4.12
EPB41L1-213ENST00000447825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.67■■■■■ 4.1
EPB41L1-213ENST00000447825 SHROOM2Q13796 1616 aa40.63■■■■■ 4.09
EPB41L1-213ENST00000447825 KIF27Q86VH2 1401 aa40.55■■■■■ 4.08
EPB41L1-213ENST00000447825 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
EPB41L1-213ENST00000447825 IGF1RP08069 1367 aa40.48■■■■■ 4.07
EPB41L1-213ENST00000447825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.47■■■■■ 4.07
EPB41L1-213ENST00000447825 CUL7Q14999 1698 aa40.46■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1250.4 ms