RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447556.1

KCTD18-203, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 18, humanhuman

TSL 4

Gene KCTD18, Length 566 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18-203ENST00000447556 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.84■■■■■ 5.89
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KCTD18-203ENST00000447556 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.4■■■■■ 4.7
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KCTD18-203ENST00000447556 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.44■■■■■ 4.54
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KCTD18-203ENST00000447556 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.12■■■■■ 4.33
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KCTD18-203ENST00000447556 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.98■■■■■ 4.31
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KCTD18-203ENST00000447556 SMARCA2P51531 1590 aa40.46■■■■■ 4.07
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KCTD18-203ENST00000447556 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
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KCTD18-203ENST00000447556 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.2■■■■□ 3.87
KCTD18-203ENST00000447556 WDR62O43379 1518 aa39.11■■■■□ 3.85
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KCTD18-203ENST00000447556 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.05■■■■□ 3.84
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KCTD18-203ENST00000447556 OSCARQ8IYS5 282 aa38.3■■■■□ 3.72
KCTD18-203ENST00000447556 IFT140Q96RY7 1462 aa38.26■■■■□ 3.72
KCTD18-203ENST00000447556 TOPBP1Q92547 1522 aa38.22■■■■□ 3.71
KCTD18-203ENST00000447556 ABCC8Q09428 1581 aa38.19■■■■□ 3.7
KCTD18-203ENST00000447556 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
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KCTD18-203ENST00000447556 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.89■■■■□ 3.66
KCTD18-203ENST00000447556 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
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KCTD18-203ENST00000447556 ARHGEF11O15085 1522 aa37.75■■■■□ 3.63
KCTD18-203ENST00000447556 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.64■■■■□ 3.62
KCTD18-203ENST00000447556 SOGA1O94964 1423 aa37.63■■■■□ 3.61
KCTD18-203ENST00000447556 WDR97A6NE52 1622 aa37.6■■■■□ 3.61
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KCTD18-203ENST00000447556 FBLN2P98095 1184 aa37.55■■■■□ 3.6
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KCTD18-203ENST00000447556 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
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KCTD18-203ENST00000447556 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.39■■■■□ 3.58
KCTD18-203ENST00000447556 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
KCTD18-203ENST00000447556 GRIN2BQ13224 1484 aa37.36■■■■□ 3.57
KCTD18-203ENST00000447556 ARAP1Q96P48 1450 aa37.35■■■■□ 3.57
KCTD18-203ENST00000447556 SYNJ1O43426 1573 aa37.31■■■■□ 3.56
KCTD18-203ENST00000447556 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.28■■■■□ 3.56
KCTD18-203ENST00000447556 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
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KCTD18-203ENST00000447556 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.2■■■■□ 3.55
KCTD18-203ENST00000447556 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.16■■■■□ 3.54
KCTD18-203ENST00000447556 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.15■■■■□ 3.54
KCTD18-203ENST00000447556 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
KCTD18-203ENST00000447556 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37■■■■□ 3.51
KCTD18-203ENST00000447556 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.99■■■■□ 3.51
KCTD18-203ENST00000447556 TOP2BQ02880 1626 aa36.96■■■■□ 3.51
KCTD18-203ENST00000447556 ADAMTS12P58397 1594 aa36.88■■■■□ 3.49
KCTD18-203ENST00000447556 GRIN2AQ12879 1464 aa36.87■■■■□ 3.49
KCTD18-203ENST00000447556 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.74■■■■□ 3.47
KCTD18-203ENST00000447556 CEP170Q5SW79 1584 aa36.74■■■■□ 3.47
KCTD18-203ENST00000447556 NUP160Q12769 1436 aa36.73■■■■□ 3.47
KCTD18-203ENST00000447556 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.73■■■■□ 3.47
KCTD18-203ENST00000447556 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.65■■■■□ 3.46
KCTD18-203ENST00000447556 SHROOM2Q13796 1616 aa36.61■■■■□ 3.45
KCTD18-203ENST00000447556 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.37■■■■□ 3.41
KCTD18-203ENST00000447556 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
KCTD18-203ENST00000447556 JPH4Q96JJ6 628 aa36.3■■■■□ 3.4
KCTD18-203ENST00000447556 CUL7Q14999 1698 aa36.23■■■■□ 3.39
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