RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446699.1

EIF2AK1-204, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene EIF2AK1, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF2AK1-204ENST00000446699 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.7■■■■■ 7.79
EIF2AK1-204ENST00000446699 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.66■■■■■ 6.66
EIF2AK1-204ENST00000446699 ABCC9O60706 1549 aa55.82■■■■■ 6.53
EIF2AK1-204ENST00000446699 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.56■■■■■ 6.16
EIF2AK1-204ENST00000446699 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.51■■■■■ 6.16
EIF2AK1-204ENST00000446699 NACADO15069 1562 aa53.44■■■■■ 6.15
EIF2AK1-204ENST00000446699 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.05■■■■■ 6.08
EIF2AK1-204ENST00000446699 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.97■■■■■ 6.07
EIF2AK1-204ENST00000446699 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.7■■■■■ 6.03
EIF2AK1-204ENST00000446699 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.17■■■■■ 5.94
EIF2AK1-204ENST00000446699 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.11■■■■■ 5.93
EIF2AK1-204ENST00000446699 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.86■■■■■ 5.89
EIF2AK1-204ENST00000446699 SCRIBQ14160 1630 aa51.69■■■■■ 5.87
EIF2AK1-204ENST00000446699 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.5■■■■■ 5.83
EIF2AK1-204ENST00000446699 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.41■■■■■ 5.82
EIF2AK1-204ENST00000446699 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.57■■■■■ 5.69
EIF2AK1-204ENST00000446699 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.42■■■■■ 5.66
EIF2AK1-204ENST00000446699 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.21■■■■■ 5.63
EIF2AK1-204ENST00000446699 SMARCA4P51532 1647 aa49.42■■■■■ 5.5
EIF2AK1-204ENST00000446699 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.4■■■■■ 5.5
EIF2AK1-204ENST00000446699 NCAPD3P42695 1498 aa49.36■■■■■ 5.49
EIF2AK1-204ENST00000446699 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.31■■■■■ 5.48
EIF2AK1-204ENST00000446699 SMARCA2P51531 1590 aa49.24■■■■■ 5.47
EIF2AK1-204ENST00000446699 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.05■■■■■ 5.44
EIF2AK1-204ENST00000446699 HMGXB3Q12766 1538 aa49.02■■■■■ 5.44
EIF2AK1-204ENST00000446699 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.97■■■■■ 5.43
EIF2AK1-204ENST00000446699 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
EIF2AK1-204ENST00000446699 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
EIF2AK1-204ENST00000446699 WIZO95785 1651 aa48.44■■■■■ 5.35
EIF2AK1-204ENST00000446699 ERCC6Q03468 1493 aa48.19■■■■■ 5.31
EIF2AK1-204ENST00000446699 NESP48681 1621 aa48.17■■■■■ 5.3
EIF2AK1-204ENST00000446699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.05■■■■■ 5.28
EIF2AK1-204ENST00000446699 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
EIF2AK1-204ENST00000446699 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.94■■■■■ 5.26
EIF2AK1-204ENST00000446699 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.84■■■■■ 5.25
EIF2AK1-204ENST00000446699 CUX2O14529 1486 aa47.76■■■■■ 5.24
EIF2AK1-204ENST00000446699 CFTRP13569 1480 aa47.54■■■■■ 5.2
EIF2AK1-204ENST00000446699 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.49■■■■■ 5.19
EIF2AK1-204ENST00000446699 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.46■■■■■ 5.19
EIF2AK1-204ENST00000446699 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
EIF2AK1-204ENST00000446699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.33■■■■■ 5.17
EIF2AK1-204ENST00000446699 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.31■■■■■ 5.16
EIF2AK1-204ENST00000446699 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.29■■■■■ 5.16
EIF2AK1-204ENST00000446699 WDR62O43379 1518 aa47.1■■■■■ 5.13
EIF2AK1-204ENST00000446699 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
EIF2AK1-204ENST00000446699 PRDM2Q13029 1718 aa46.94■■■■■ 5.11
EIF2AK1-204ENST00000446699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.82■■■■■ 5.09
EIF2AK1-204ENST00000446699 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.69■■■■■ 5.06
EIF2AK1-204ENST00000446699 ABCC8Q09428 1581 aa46.6■■■■■ 5.05
EIF2AK1-204ENST00000446699 TOPBP1Q92547 1522 aa46.52■■■■■ 5.04
EIF2AK1-204ENST00000446699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.43■■■■■ 5.02
EIF2AK1-204ENST00000446699 IFT140Q96RY7 1462 aa46.35■■■■■ 5.01
EIF2AK1-204ENST00000446699 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
EIF2AK1-204ENST00000446699 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
EIF2AK1-204ENST00000446699 CUX1P39880 1505 aa46.03■■■■■ 4.96
EIF2AK1-204ENST00000446699 SOGA1O94964 1423 aa45.99■■■■■ 4.95
EIF2AK1-204ENST00000446699 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
EIF2AK1-204ENST00000446699 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.95■■■■■ 4.95
EIF2AK1-204ENST00000446699 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.92■■■■■ 4.94
EIF2AK1-204ENST00000446699 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.85■■■■■ 4.936e-9■■■■■ 31.3
EIF2AK1-204ENST00000446699 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
EIF2AK1-204ENST00000446699 OSCARQ8IYS5 282 aa45.84■■■■■ 4.93
EIF2AK1-204ENST00000446699 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
EIF2AK1-204ENST00000446699 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
EIF2AK1-204ENST00000446699 WDR97A6NE52 1622 aa45.65■■■■■ 4.9
EIF2AK1-204ENST00000446699 TOP2BQ02880 1626 aa45.55■■■■■ 4.88
EIF2AK1-204ENST00000446699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.52■■■■■ 4.88
EIF2AK1-204ENST00000446699 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.51■■■■■ 4.88
EIF2AK1-204ENST00000446699 SYNJ1O43426 1573 aa45.5■■■■■ 4.87
EIF2AK1-204ENST00000446699 FBLN2P98095 1184 aa45.46■■■■■ 4.87
EIF2AK1-204ENST00000446699 GRIN2BQ13224 1484 aa45.46■■■■■ 4.87
EIF2AK1-204ENST00000446699 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.42■■■■■ 4.86
EIF2AK1-204ENST00000446699 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.39■■■■■ 4.86
EIF2AK1-204ENST00000446699 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
EIF2AK1-204ENST00000446699 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
EIF2AK1-204ENST00000446699 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.26■■■■■ 4.84
EIF2AK1-204ENST00000446699 CHD1O14646 1710 aa45.26■■■■■ 4.84
EIF2AK1-204ENST00000446699 SYNJ2O15056 1496 aa45.19■■■■■ 4.82
EIF2AK1-204ENST00000446699 PBRM1Q86U86 1689 aa45.17■■■■■ 4.82
EIF2AK1-204ENST00000446699 TRIM41Q8WV44 630 aa45.05■■■■■ 4.8
EIF2AK1-204ENST00000446699 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.96■■■■■ 4.79
EIF2AK1-204ENST00000446699 ARHGEF11O15085 1522 aa44.95■■■■■ 4.79
EIF2AK1-204ENST00000446699 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.92■■■■■ 4.78
EIF2AK1-204ENST00000446699 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.92■■■■■ 4.78
EIF2AK1-204ENST00000446699 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.92■■■■■ 4.78
EIF2AK1-204ENST00000446699 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.91■■■■■ 4.78
EIF2AK1-204ENST00000446699 ADAMTS12P58397 1594 aa44.87■■■■■ 4.77
EIF2AK1-204ENST00000446699 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.85■■■■■ 4.77
EIF2AK1-204ENST00000446699 GRIN2AQ12879 1464 aa44.84■■■■■ 4.77
EIF2AK1-204ENST00000446699 KIF27Q86VH2 1401 aa44.83■■■■■ 4.77
EIF2AK1-204ENST00000446699 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.68■■■■■ 4.74
EIF2AK1-204ENST00000446699 IGF1RP08069 1367 aa44.67■■■■■ 4.74
EIF2AK1-204ENST00000446699 NUP160Q12769 1436 aa44.67■■■■■ 4.74
EIF2AK1-204ENST00000446699 CEP170Q5SW79 1584 aa44.56■■■■■ 4.72
EIF2AK1-204ENST00000446699 ARAP1Q96P48 1450 aa44.55■■■■■ 4.72
EIF2AK1-204ENST00000446699 CUL7Q14999 1698 aa44.44■■■■■ 4.7
EIF2AK1-204ENST00000446699 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.41■■■■■ 4.7
EIF2AK1-204ENST00000446699 JPH4Q96JJ6 628 aa44.31■■■■■ 4.68
EIF2AK1-204ENST00000446699 SHROOM2Q13796 1616 aa44.25■■■■■ 4.67
EIF2AK1-204ENST00000446699 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.21■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.4 ms