RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446332.1

SOX9-AS1-207, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 443 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.71■■■■□ 3.15
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.11■■■□□ 2.57
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCC9O60706 1549 aa30.65■■■□□ 2.5
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.44■■■□□ 2.3
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NACADO15069 1562 aa29.35■■■□□ 2.29
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.12■■■□□ 2.25
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.04■■■□□ 2.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.81■■■□□ 2.2
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SOX9-AS1-207ENST00000446332 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.77■■■□□ 2.2
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
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SOX9-AS1-207ENST00000446332 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.53■■■□□ 2.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.34■■■□□ 2.13
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SCRIBQ14160 1630 aa28.17■■■□□ 2.1
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.78■■■□□ 2.04
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.65■■■□□ 2.02
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NCAPD3P42695 1498 aa27.08■■□□□ 1.93
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SMARCA4P51532 1647 aa27.01■■□□□ 1.91
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.97■■□□□ 1.91
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SMARCA2P51531 1590 aa26.97■■□□□ 1.91
SOX9-AS1-207ENST00000446332 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HMGXB3Q12766 1538 aa26.89■■□□□ 1.89
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.84■■□□□ 1.89
SOX9-AS1-207ENST00000446332 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.67■■□□□ 1.86
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ERCC6Q03468 1493 aa26.49■■□□□ 1.83
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CUX2O14529 1486 aa26.46■■□□□ 1.83
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.42■■□□□ 1.82
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NESP48681 1621 aa26.4■■□□□ 1.82
SOX9-AS1-207ENST00000446332 WIZO95785 1651 aa26.38■■□□□ 1.81
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.25■■□□□ 1.79
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.24■■□□□ 1.79
SOX9-AS1-207ENST00000446332 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.14■■□□□ 1.78
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.13■■□□□ 1.77
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CFTRP13569 1480 aa26■■□□□ 1.75
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.95■■□□□ 1.74
SOX9-AS1-207ENST00000446332 WDR62O43379 1518 aa25.9■■□□□ 1.74
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.89■■□□□ 1.73
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.88■■□□□ 1.73
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PRDM2Q13029 1718 aa25.82■■□□□ 1.72
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.79■■□□□ 1.72
SOX9-AS1-207ENST00000446332 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCC8Q09428 1581 aa25.53■■□□□ 1.68
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TOPBP1Q92547 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
SOX9-AS1-207ENST00000446332 IFT140Q96RY7 1462 aa25.4■■□□□ 1.66
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.38■■□□□ 1.65
SOX9-AS1-207ENST00000446332 OSCARQ8IYS5 282 aa25.29■■□□□ 1.64
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SOX9-AS1-207ENST00000446332 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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SOX9-AS1-207ENST00000446332 WDR97A6NE52 1622 aa25.09■■□□□ 1.61
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SOGA1O94964 1423 aa25.09■■□□□ 1.61
SOX9-AS1-207ENST00000446332 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CUX1P39880 1505 aa25.06■■□□□ 1.6
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.03■■□□□ 1.6
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.02■■□□□ 1.6
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CHD1O14646 1710 aa24.93■■□□□ 1.58
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TRIM41Q8WV44 630 aa24.91■■□□□ 1.58
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GRIN2BQ13224 1484 aa24.85■■□□□ 1.57
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.85■■□□□ 1.57
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.85■■□□□ 1.57
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.85■■□□□ 1.57
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.84■■□□□ 1.57
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ARHGEF11O15085 1522 aa24.81■■□□□ 1.56
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FBLN2P98095 1184 aa24.81■■□□□ 1.56
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.8■■□□□ 1.56
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TOP2BQ02880 1626 aa24.79■■□□□ 1.56
SOX9-AS1-207ENST00000446332 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.79■■□□□ 1.56
SOX9-AS1-207ENST00000446332 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.79■■□□□ 1.56
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PBRM1Q86U86 1689 aa24.75■■□□□ 1.55
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SYNJ2O15056 1496 aa24.75■■□□□ 1.55
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.75■■□□□ 1.55
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SYNJ1O43426 1573 aa24.7■■□□□ 1.54
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.67■■□□□ 1.54
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.59■■□□□ 1.53
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.56■■□□□ 1.52
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ARAP1Q96P48 1450 aa24.56■■□□□ 1.52
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GRIN2AQ12879 1464 aa24.51■■□□□ 1.51
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ADAMTS12P58397 1594 aa24.51■■□□□ 1.51
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.51■■□□□ 1.51
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NUP160Q12769 1436 aa24.45■■□□□ 1.51
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CEP170Q5SW79 1584 aa24.37■■□□□ 1.49
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SHROOM2Q13796 1616 aa24.34■■□□□ 1.49
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIF27Q86VH2 1401 aa24.31■■□□□ 1.48
SOX9-AS1-207ENST00000446332 IGF1RP08069 1367 aa24.28■■□□□ 1.48
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CUL7Q14999 1698 aa24.24■■□□□ 1.47
SOX9-AS1-207ENST00000446332 JPH4Q96JJ6 628 aa24.21■■□□□ 1.47
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SOX9-AS1-207ENST00000446332 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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