RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445402.5

PQLC3-205, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene PQLC3, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-205ENST00000445402 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.05■■■■■ 6.72
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PQLC3-205ENST00000445402 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.96■■■■■ 5.27
PQLC3-205ENST00000445402 NACADO15069 1562 aa47.83■■■■■ 5.25
PQLC3-205ENST00000445402 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.81■■■■■ 5.24
PQLC3-205ENST00000445402 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
PQLC3-205ENST00000445402 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.46■■■■■ 5.19
PQLC3-205ENST00000445402 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.16■■■■■ 5.14
PQLC3-205ENST00000445402 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.83■■■■■ 5.09
PQLC3-205ENST00000445402 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.75■■■■■ 5.07
PQLC3-205ENST00000445402 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.56■■■■■ 5.04
PQLC3-205ENST00000445402 SCRIBQ14160 1630 aa46.38■■■■■ 5.01
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PQLC3-205ENST00000445402 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46■■■■■ 4.95
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PQLC3-205ENST00000445402 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.22■■■■■ 4.83
PQLC3-205ENST00000445402 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.99■■■■■ 4.79
PQLC3-205ENST00000445402 SMARCA4P51532 1647 aa44.32■■■■■ 4.68
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PQLC3-205ENST00000445402 NCAPD3P42695 1498 aa44.18■■■■■ 4.66
PQLC3-205ENST00000445402 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.17■■■■■ 4.66
PQLC3-205ENST00000445402 SMARCA2P51531 1590 aa44.07■■■■■ 4.65
PQLC3-205ENST00000445402 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.99■■■■■ 4.63
PQLC3-205ENST00000445402 HMGXB3Q12766 1538 aa43.91■■■■■ 4.62
PQLC3-205ENST00000445402 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.88■■■■■ 4.61
PQLC3-205ENST00000445402 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
PQLC3-205ENST00000445402 WIZO95785 1651 aa43.46■■■■■ 4.55
PQLC3-205ENST00000445402 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
PQLC3-205ENST00000445402 NESP48681 1621 aa43.24■■■■■ 4.51
PQLC3-205ENST00000445402 ERCC6Q03468 1493 aa43.14■■■■■ 4.5
PQLC3-205ENST00000445402 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.03■■■■■ 4.48
PQLC3-205ENST00000445402 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
PQLC3-205ENST00000445402 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.88■■■■■ 4.45
PQLC3-205ENST00000445402 CUX2O14529 1486 aa42.76■■■■■ 4.44
PQLC3-205ENST00000445402 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.76■■■■■ 4.44
PQLC3-205ENST00000445402 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.65■■■■■ 4.42
PQLC3-205ENST00000445402 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
PQLC3-205ENST00000445402 CFTRP13569 1480 aa42.57■■■■■ 4.41
PQLC3-205ENST00000445402 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.51■■■■■ 4.4
PQLC3-205ENST00000445402 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.4■■■■■ 4.38
PQLC3-205ENST00000445402 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.36■■■■■ 4.37
PQLC3-205ENST00000445402 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.36■■■■■ 4.37
PQLC3-205ENST00000445402 WDR62O43379 1518 aa42.22■■■■■ 4.35
PQLC3-205ENST00000445402 PRDM2Q13029 1718 aa42.12■■■■■ 4.33
PQLC3-205ENST00000445402 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
PQLC3-205ENST00000445402 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
PQLC3-205ENST00000445402 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.81■■■■■ 4.28
PQLC3-205ENST00000445402 TOPBP1Q92547 1522 aa41.69■■■■■ 4.26
PQLC3-205ENST00000445402 ABCC8Q09428 1581 aa41.62■■■■■ 4.25
PQLC3-205ENST00000445402 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.59■■■■■ 4.25
PQLC3-205ENST00000445402 IFT140Q96RY7 1462 aa41.48■■■■■ 4.23
PQLC3-205ENST00000445402 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
PQLC3-205ENST00000445402 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
PQLC3-205ENST00000445402 CUX1P39880 1505 aa41.28■■■■■ 4.2
PQLC3-205ENST00000445402 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
PQLC3-205ENST00000445402 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.18■■■■■ 4.18
PQLC3-205ENST00000445402 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.15■■■■■ 4.18
PQLC3-205ENST00000445402 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
PQLC3-205ENST00000445402 SOGA1O94964 1423 aa41.14■■■■■ 4.18
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PQLC3-205ENST00000445402 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
PQLC3-205ENST00000445402 OSCARQ8IYS5 282 aa40.96■■■■■ 4.15
PQLC3-205ENST00000445402 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
PQLC3-205ENST00000445402 WDR97A6NE52 1622 aa40.84■■■■■ 4.13
PQLC3-205ENST00000445402 SYNJ1O43426 1573 aa40.82■■■■■ 4.13
PQLC3-205ENST00000445402 TOP2BQ02880 1626 aa40.82■■■■■ 4.12
PQLC3-205ENST00000445402 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.8■■■■■ 4.12
PQLC3-205ENST00000445402 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.75■■■■■ 4.11
PQLC3-205ENST00000445402 GRIN2BQ13224 1484 aa40.69■■■■■ 4.1
PQLC3-205ENST00000445402 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.69■■■■■ 4.1
PQLC3-205ENST00000445402 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.65■■■■■ 4.1
PQLC3-205ENST00000445402 CHD1O14646 1710 aa40.64■■■■■ 4.1
PQLC3-205ENST00000445402 FBLN2P98095 1184 aa40.64■■■■■ 4.1
PQLC3-205ENST00000445402 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.6■■■■■ 4.09
PQLC3-205ENST00000445402 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
PQLC3-205ENST00000445402 PBRM1Q86U86 1689 aa40.53■■■■■ 4.08
PQLC3-205ENST00000445402 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
PQLC3-205ENST00000445402 SYNJ2O15056 1496 aa40.45■■■■■ 4.07
PQLC3-205ENST00000445402 TRIM41Q8WV44 630 aa40.34■■■■■ 4.05
PQLC3-205ENST00000445402 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.32■■■■■ 4.05
PQLC3-205ENST00000445402 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.32■■■■■ 4.05
PQLC3-205ENST00000445402 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.32■■■■■ 4.05
PQLC3-205ENST00000445402 ARHGEF11O15085 1522 aa40.31■■■■■ 4.04
PQLC3-205ENST00000445402 ADAMTS12P58397 1594 aa40.24■■■■■ 4.03
PQLC3-205ENST00000445402 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.24■■■■■ 4.03
PQLC3-205ENST00000445402 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.24■■■■■ 4.03
PQLC3-205ENST00000445402 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.17■■■■■ 4.02
PQLC3-205ENST00000445402 GRIN2AQ12879 1464 aa40.17■■■■■ 4.02
PQLC3-205ENST00000445402 KIF27Q86VH2 1401 aa40.07■■■■■ 4
PQLC3-205ENST00000445402 NUP160Q12769 1436 aa40■■■■□ 3.99
PQLC3-205ENST00000445402 CEP170Q5SW79 1584 aa39.98■■■■□ 3.99
PQLC3-205ENST00000445402 ARAP1Q96P48 1450 aa39.98■■■■□ 3.99
PQLC3-205ENST00000445402 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.96■■■■□ 3.99
PQLC3-205ENST00000445402 IGF1RP08069 1367 aa39.96■■■■□ 3.99
PQLC3-205ENST00000445402 CUL7Q14999 1698 aa39.8■■■■□ 3.96
PQLC3-205ENST00000445402 SHROOM2Q13796 1616 aa39.71■■■■□ 3.95
PQLC3-205ENST00000445402 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.7■■■■□ 3.95
PQLC3-205ENST00000445402 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.69■■■■□ 3.94
PQLC3-205ENST00000445402 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.66■■■■□ 3.94
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