RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445098.2

CLEC20A-201, Transcript of C-type lectin domain containing 20A, humanhuman

TSL 4

Gene CLEC20A, Length 1,137 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC20A-201ENST00000445098 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.98■■■■■ 5.91
CLEC20A-201ENST00000445098 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.52■■■■■ 5.04
CLEC20A-201ENST00000445098 ABCC9O60706 1549 aa46.02■■■■■ 4.96
CLEC20A-201ENST00000445098 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.05■■■■■ 4.64
CLEC20A-201ENST00000445098 NACADO15069 1562 aa43.84■■■■■ 4.61
CLEC20A-201ENST00000445098 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.66■■■■■ 4.58
CLEC20A-201ENST00000445098 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.38■■■■■ 4.53
CLEC20A-201ENST00000445098 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
CLEC20A-201ENST00000445098 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.01■■■■■ 4.48
CLEC20A-201ENST00000445098 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.98■■■■■ 4.47
CLEC20A-201ENST00000445098 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.86■■■■■ 4.45
CLEC20A-201ENST00000445098 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.69■■■■■ 4.42
CLEC20A-201ENST00000445098 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.64■■■■■ 4.42
CLEC20A-201ENST00000445098 SCRIBQ14160 1630 aa42.39■■■■■ 4.38
CLEC20A-201ENST00000445098 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.25■■■■■ 4.35
CLEC20A-201ENST00000445098 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
CLEC20A-201ENST00000445098 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.6■■■■■ 4.25
CLEC20A-201ENST00000445098 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.41■■■■■ 4.22
CLEC20A-201ENST00000445098 SMARCA4P51532 1647 aa40.48■■■■■ 4.07
CLEC20A-201ENST00000445098 NCAPD3P42695 1498 aa40.42■■■■■ 4.06
CLEC20A-201ENST00000445098 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.37■■■■■ 4.05
CLEC20A-201ENST00000445098 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
CLEC20A-201ENST00000445098 SMARCA2P51531 1590 aa40.34■■■■■ 4.05
CLEC20A-201ENST00000445098 HMGXB3Q12766 1538 aa40.22■■■■■ 4.03
CLEC20A-201ENST00000445098 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.07■■■■■ 4.01
CLEC20A-201ENST00000445098 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
CLEC20A-201ENST00000445098 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.04■■■■■ 4
CLEC20A-201ENST00000445098 ERCC6Q03468 1493 aa39.76■■■■□ 3.96
CLEC20A-201ENST00000445098 NESP48681 1621 aa39.63■■■■□ 3.93
CLEC20A-201ENST00000445098 WIZO95785 1651 aa39.6■■■■□ 3.93
CLEC20A-201ENST00000445098 CUX2O14529 1486 aa39.51■■■■□ 3.92
CLEC20A-201ENST00000445098 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.5■■■■□ 3.91
CLEC20A-201ENST00000445098 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
CLEC20A-201ENST00000445098 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.24■■■■□ 3.87
CLEC20A-201ENST00000445098 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.21■■■■□ 3.87
CLEC20A-201ENST00000445098 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
CLEC20A-201ENST00000445098 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.19■■■■□ 3.86
CLEC20A-201ENST00000445098 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
CLEC20A-201ENST00000445098 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.09■■■■□ 3.85
CLEC20A-201ENST00000445098 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.88■■■■□ 3.81
CLEC20A-201ENST00000445098 CFTRP13569 1480 aa38.87■■■■□ 3.81
CLEC20A-201ENST00000445098 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.84■■■■□ 3.81
CLEC20A-201ENST00000445098 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.8■■■■□ 3.8
CLEC20A-201ENST00000445098 WDR62O43379 1518 aa38.76■■■■□ 3.8
CLEC20A-201ENST00000445098 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.66■■■■□ 3.78
CLEC20A-201ENST00000445098 PRDM2Q13029 1718 aa38.6■■■■□ 3.77
CLEC20A-201ENST00000445098 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
CLEC20A-201ENST00000445098 TOPBP1Q92547 1522 aa38.11■■■■□ 3.69
CLEC20A-201ENST00000445098 ABCC8Q09428 1581 aa38.1■■■■□ 3.69
CLEC20A-201ENST00000445098 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.05■■■■□ 3.68
CLEC20A-201ENST00000445098 IFT140Q96RY7 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
CLEC20A-201ENST00000445098 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
CLEC20A-201ENST00000445098 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
CLEC20A-201ENST00000445098 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.63
CLEC20A-201ENST00000445098 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
CLEC20A-201ENST00000445098 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
CLEC20A-201ENST00000445098 OSCARQ8IYS5 282 aa37.73■■■■□ 3.63
CLEC20A-201ENST00000445098 CUX1P39880 1505 aa37.61■■■■□ 3.61
CLEC20A-201ENST00000445098 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.58■■■■□ 3.61
CLEC20A-201ENST00000445098 SOGA1O94964 1423 aa37.58■■■■□ 3.61
CLEC20A-201ENST00000445098 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.58■■■■□ 3.61
CLEC20A-201ENST00000445098 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.58■■■■□ 3.61
CLEC20A-201ENST00000445098 WDR97A6NE52 1622 aa37.46■■■■□ 3.59
CLEC20A-201ENST00000445098 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
CLEC20A-201ENST00000445098 TRIM41Q8WV44 630 aa37.42■■■■□ 3.58
CLEC20A-201ENST00000445098 CHD1O14646 1710 aa37.38■■■■□ 3.57
CLEC20A-201ENST00000445098 FBLN2P98095 1184 aa37.28■■■■□ 3.56
CLEC20A-201ENST00000445098 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.26■■■■□ 3.56
CLEC20A-201ENST00000445098 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.23■■■■□ 3.55
CLEC20A-201ENST00000445098 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.23■■■■□ 3.55
CLEC20A-201ENST00000445098 GRIN2BQ13224 1484 aa37.23■■■■□ 3.55
CLEC20A-201ENST00000445098 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.23■■■■□ 3.55
CLEC20A-201ENST00000445098 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.54
CLEC20A-201ENST00000445098 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.18■■■■□ 3.54
CLEC20A-201ENST00000445098 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
CLEC20A-201ENST00000445098 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.17■■■■□ 3.54
CLEC20A-201ENST00000445098 TOP2BQ02880 1626 aa37.16■■■■□ 3.54
CLEC20A-201ENST00000445098 ARHGEF11O15085 1522 aa37.15■■■■□ 3.54
CLEC20A-201ENST00000445098 PBRM1Q86U86 1689 aa37.15■■■■□ 3.54
CLEC20A-201ENST00000445098 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.14■■■■□ 3.54
CLEC20A-201ENST00000445098 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.1■■■■□ 3.53
CLEC20A-201ENST00000445098 SYNJ1O43426 1573 aa37.1■■■■□ 3.53
CLEC20A-201ENST00000445098 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
CLEC20A-201ENST00000445098 SYNJ2O15056 1496 aa37.06■■■■□ 3.52
CLEC20A-201ENST00000445098 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.94■■■■□ 3.5
CLEC20A-201ENST00000445098 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.81■■■■□ 3.48
CLEC20A-201ENST00000445098 ADAMTS12P58397 1594 aa36.81■■■■□ 3.48
CLEC20A-201ENST00000445098 ARAP1Q96P48 1450 aa36.81■■■■□ 3.48
CLEC20A-201ENST00000445098 GRIN2AQ12879 1464 aa36.75■■■■□ 3.47
CLEC20A-201ENST00000445098 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.75■■■■□ 3.47
CLEC20A-201ENST00000445098 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.7■■■■□ 3.47
CLEC20A-201ENST00000445098 CEP170Q5SW79 1584 aa36.59■■■■□ 3.45
CLEC20A-201ENST00000445098 NUP160Q12769 1436 aa36.58■■■■□ 3.45
CLEC20A-201ENST00000445098 KIF27Q86VH2 1401 aa36.44■■■■□ 3.42
CLEC20A-201ENST00000445098 SHROOM2Q13796 1616 aa36.39■■■■□ 3.42
CLEC20A-201ENST00000445098 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.36■■■■□ 3.41
CLEC20A-201ENST00000445098 CUL7Q14999 1698 aa36.34■■■■□ 3.41
CLEC20A-201ENST00000445098 IGF1RP08069 1367 aa36.3■■■■□ 3.4
CLEC20A-201ENST00000445098 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
CLEC20A-201ENST00000445098 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms