RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444999.5

UPP1-209, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 869 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-209ENST00000444999 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.23■■■■■ 4.99
UPP1-209ENST00000444999 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.29■■■■■ 4.2
UPP1-209ENST00000444999 ABCC9O60706 1549 aa41.12■■■■■ 4.17
UPP1-209ENST00000444999 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.19■■■■□ 3.86
UPP1-209ENST00000444999 NACADO15069 1562 aa38.99■■■■□ 3.83
UPP1-209ENST00000444999 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.95■■■■□ 3.83
UPP1-209ENST00000444999 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.53■■■■□ 3.76
UPP1-209ENST00000444999 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.39■■■■□ 3.74
UPP1-209ENST00000444999 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.37■■■■□ 3.73
UPP1-209ENST00000444999 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.36■■■■□ 3.73
UPP1-209ENST00000444999 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.33■■■■□ 3.73
UPP1-209ENST00000444999 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.15■■■■□ 3.7
UPP1-209ENST00000444999 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.1■■■■□ 3.69
UPP1-209ENST00000444999 SCRIBQ14160 1630 aa37.72■■■■□ 3.63
UPP1-209ENST00000444999 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.51■■■■□ 3.59
UPP1-209ENST00000444999 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.14■■■■□ 3.54
UPP1-209ENST00000444999 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
UPP1-209ENST00000444999 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.98■■■■□ 3.51
UPP1-209ENST00000444999 NCAPD3P42695 1498 aa36.02■■■■□ 3.36
UPP1-209ENST00000444999 SMARCA4P51532 1647 aa35.99■■■■□ 3.35
UPP1-209ENST00000444999 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.97■■■■□ 3.35
UPP1-209ENST00000444999 SMARCA2P51531 1590 aa35.84■■■■□ 3.33
UPP1-209ENST00000444999 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
UPP1-209ENST00000444999 HMGXB3Q12766 1538 aa35.75■■■■□ 3.31
UPP1-209ENST00000444999 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.65■■■■□ 3.3
UPP1-209ENST00000444999 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
UPP1-209ENST00000444999 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.62■■■■□ 3.29
UPP1-209ENST00000444999 ERCC6Q03468 1493 aa35.43■■■■□ 3.26
UPP1-209ENST00000444999 NESP48681 1621 aa35.42■■■■□ 3.26
UPP1-209ENST00000444999 CUX2O14529 1486 aa35.25■■■■□ 3.23
UPP1-209ENST00000444999 WIZO95785 1651 aa35.23■■■■□ 3.23
UPP1-209ENST00000444999 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.14■■■■□ 3.22
UPP1-209ENST00000444999 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
UPP1-209ENST00000444999 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.96■■■■□ 3.19
UPP1-209ENST00000444999 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
UPP1-209ENST00000444999 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.95■■■■□ 3.19
UPP1-209ENST00000444999 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.93■■■■□ 3.18
UPP1-209ENST00000444999 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.93■■■■□ 3.18
UPP1-209ENST00000444999 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
UPP1-209ENST00000444999 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.63■■■■□ 3.13
UPP1-209ENST00000444999 CFTRP13569 1480 aa34.61■■■■□ 3.13
UPP1-209ENST00000444999 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.55■■■■□ 3.12
UPP1-209ENST00000444999 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.54■■■■□ 3.12
UPP1-209ENST00000444999 WDR62O43379 1518 aa34.54■■■■□ 3.12
UPP1-209ENST00000444999 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.42■■■■□ 3.1
UPP1-209ENST00000444999 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
UPP1-209ENST00000444999 PRDM2Q13029 1718 aa34.22■■■■□ 3.07
UPP1-209ENST00000444999 TOPBP1Q92547 1522 aa33.94■■■■□ 3.02
UPP1-209ENST00000444999 IFT140Q96RY7 1462 aa33.84■■■■□ 3.01
UPP1-209ENST00000444999 ABCC8Q09428 1581 aa33.82■■■■□ 3
UPP1-209ENST00000444999 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
UPP1-209ENST00000444999 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.81■■■■□ 3
UPP1-209ENST00000444999 OSCARQ8IYS5 282 aa33.73■■■□□ 2.99
UPP1-209ENST00000444999 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
UPP1-209ENST00000444999 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
UPP1-209ENST00000444999 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
UPP1-209ENST00000444999 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
UPP1-209ENST00000444999 TRIM41Q8WV44 630 aa33.59■■■□□ 2.97
UPP1-209ENST00000444999 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.96
UPP1-209ENST00000444999 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.52■■■□□ 2.96
UPP1-209ENST00000444999 CUX1P39880 1505 aa33.48■■■□□ 2.95
UPP1-209ENST00000444999 SOGA1O94964 1423 aa33.46■■■□□ 2.95
UPP1-209ENST00000444999 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.44■■■□□ 2.94
UPP1-209ENST00000444999 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
UPP1-209ENST00000444999 CHD1O14646 1710 aa33.29■■■□□ 2.92
UPP1-209ENST00000444999 FBLN2P98095 1184 aa33.26■■■□□ 2.91
UPP1-209ENST00000444999 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.26■■■□□ 2.91
UPP1-209ENST00000444999 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.26■■■□□ 2.91
UPP1-209ENST00000444999 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.26■■■□□ 2.91
UPP1-209ENST00000444999 WDR97A6NE52 1622 aa33.21■■■□□ 2.91
UPP1-209ENST00000444999 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.19■■■□□ 2.9
UPP1-209ENST00000444999 ARHGEF11O15085 1522 aa33.18■■■□□ 2.9
UPP1-209ENST00000444999 GRIN2BQ13224 1484 aa33.12■■■□□ 2.89
UPP1-209ENST00000444999 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
UPP1-209ENST00000444999 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.06■■■□□ 2.88
UPP1-209ENST00000444999 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.05■■■□□ 2.88
UPP1-209ENST00000444999 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
UPP1-209ENST00000444999 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
UPP1-209ENST00000444999 PBRM1Q86U86 1689 aa33■■■□□ 2.87
UPP1-209ENST00000444999 SYNJ1O43426 1573 aa32.99■■■□□ 2.87
UPP1-209ENST00000444999 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.99■■■□□ 2.87
UPP1-209ENST00000444999 TOP2BQ02880 1626 aa32.98■■■□□ 2.87
UPP1-209ENST00000444999 SYNJ2O15056 1496 aa32.98■■■□□ 2.87
UPP1-209ENST00000444999 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.97■■■□□ 2.87
UPP1-209ENST00000444999 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.96■■■□□ 2.87
UPP1-209ENST00000444999 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.92■■■□□ 2.86
UPP1-209ENST00000444999 ARAP1Q96P48 1450 aa32.89■■■□□ 2.86
UPP1-209ENST00000444999 ADAMTS12P58397 1594 aa32.71■■■□□ 2.83
UPP1-209ENST00000444999 GRIN2AQ12879 1464 aa32.7■■■□□ 2.83
UPP1-209ENST00000444999 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.63■■■□□ 2.81
UPP1-209ENST00000444999 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.63■■■□□ 2.81
UPP1-209ENST00000444999 CEP170Q5SW79 1584 aa32.59■■■□□ 2.81
UPP1-209ENST00000444999 NUP160Q12769 1436 aa32.59■■■□□ 2.81
UPP1-209ENST00000444999 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.49■■■□□ 2.79
UPP1-209ENST00000444999 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
UPP1-209ENST00000444999 SHROOM2Q13796 1616 aa32.39■■■□□ 2.78
UPP1-209ENST00000444999 IGF1RP08069 1367 aa32.34■■■□□ 2.77
UPP1-209ENST00000444999 KIF27Q86VH2 1401 aa32.34■■■□□ 2.77
UPP1-209ENST00000444999 JPH4Q96JJ6 628 aa32.27■■■□□ 2.76
UPP1-209ENST00000444999 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms