RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444384.3

SFTPD-202, Transcript of surfactant protein D, humanhuman

TSL 3

Gene SFTPD, Length 659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPD-202ENST00000444384 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.28■■■■■ 5
SFTPD-202ENST00000444384 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.26■■■■■ 4.2
SFTPD-202ENST00000444384 ABCC9O60706 1549 aa40.59■■■■■ 4.09
SFTPD-202ENST00000444384 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.93■■■■□ 3.82
SFTPD-202ENST00000444384 NACADO15069 1562 aa38.82■■■■□ 3.81
SFTPD-202ENST00000444384 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.71■■■■□ 3.79
SFTPD-202ENST00000444384 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
SFTPD-202ENST00000444384 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.5■■■■□ 3.75
SFTPD-202ENST00000444384 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.27■■■■□ 3.72
SFTPD-202ENST00000444384 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.11■■■■□ 3.69
SFTPD-202ENST00000444384 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
SFTPD-202ENST00000444384 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.8■■■■□ 3.64
SFTPD-202ENST00000444384 SCRIBQ14160 1630 aa37.65■■■■□ 3.62
SFTPD-202ENST00000444384 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.45■■■■□ 3.59
SFTPD-202ENST00000444384 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.33■■■■□ 3.57
SFTPD-202ENST00000444384 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
SFTPD-202ENST00000444384 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.72■■■■□ 3.47
SFTPD-202ENST00000444384 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.49■■■■□ 3.43
SFTPD-202ENST00000444384 SMARCA4P51532 1647 aa35.98■■■■□ 3.35
SFTPD-202ENST00000444384 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
SFTPD-202ENST00000444384 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.83■■■■□ 3.33
SFTPD-202ENST00000444384 NCAPD3P42695 1498 aa35.82■■■■□ 3.32
SFTPD-202ENST00000444384 SMARCA2P51531 1590 aa35.76■■■■□ 3.31
SFTPD-202ENST00000444384 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.68■■■■□ 3.3
SFTPD-202ENST00000444384 HMGXB3Q12766 1538 aa35.65■■■■□ 3.3
SFTPD-202ENST00000444384 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.62■■■■□ 3.29
SFTPD-202ENST00000444384 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
SFTPD-202ENST00000444384 WIZO95785 1651 aa35.29■■■■□ 3.24
SFTPD-202ENST00000444384 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
SFTPD-202ENST00000444384 NESP48681 1621 aa35.07■■■■□ 3.21
SFTPD-202ENST00000444384 ERCC6Q03468 1493 aa34.98■■■■□ 3.19
SFTPD-202ENST00000444384 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.92■■■■□ 3.18
SFTPD-202ENST00000444384 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
SFTPD-202ENST00000444384 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.75■■■■□ 3.15
SFTPD-202ENST00000444384 CUX2O14529 1486 aa34.7■■■■□ 3.15
SFTPD-202ENST00000444384 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.67■■■■□ 3.14
SFTPD-202ENST00000444384 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.66■■■■□ 3.14
SFTPD-202ENST00000444384 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
SFTPD-202ENST00000444384 CFTRP13569 1480 aa34.52■■■■□ 3.12
SFTPD-202ENST00000444384 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.46■■■■□ 3.11
SFTPD-202ENST00000444384 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.39■■■■□ 3.1
SFTPD-202ENST00000444384 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.37■■■■□ 3.09
SFTPD-202ENST00000444384 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.36■■■■□ 3.09
SFTPD-202ENST00000444384 PRDM2Q13029 1718 aa34.29■■■■□ 3.08
SFTPD-202ENST00000444384 WDR62O43379 1518 aa34.28■■■■□ 3.08
SFTPD-202ENST00000444384 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
SFTPD-202ENST00000444384 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
SFTPD-202ENST00000444384 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.87■■■■□ 3.01
SFTPD-202ENST00000444384 TOPBP1Q92547 1522 aa33.82■■■■□ 3
SFTPD-202ENST00000444384 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.76■■■□□ 2.99
SFTPD-202ENST00000444384 ABCC8Q09428 1581 aa33.75■■■□□ 2.99
SFTPD-202ENST00000444384 IFT140Q96RY7 1462 aa33.64■■■□□ 2.98
SFTPD-202ENST00000444384 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
SFTPD-202ENST00000444384 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.96
SFTPD-202ENST00000444384 CUX1P39880 1505 aa33.48■■■□□ 2.95
SFTPD-202ENST00000444384 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
SFTPD-202ENST00000444384 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.41■■■□□ 2.94
SFTPD-202ENST00000444384 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
SFTPD-202ENST00000444384 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.37■■■□□ 2.93
SFTPD-202ENST00000444384 SOGA1O94964 1423 aa33.34■■■□□ 2.93
SFTPD-202ENST00000444384 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.3■■■□□ 2.92
SFTPD-202ENST00000444384 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
SFTPD-202ENST00000444384 WDR97A6NE52 1622 aa33.17■■■□□ 2.9
SFTPD-202ENST00000444384 OSCARQ8IYS5 282 aa33.17■■■□□ 2.9
SFTPD-202ENST00000444384 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
SFTPD-202ENST00000444384 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.14■■■□□ 2.9
SFTPD-202ENST00000444384 SYNJ1O43426 1573 aa33.13■■■□□ 2.89
SFTPD-202ENST00000444384 TOP2BQ02880 1626 aa33.13■■■□□ 2.89
SFTPD-202ENST00000444384 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.06■■■□□ 2.88
SFTPD-202ENST00000444384 CHD1O14646 1710 aa33.05■■■□□ 2.88
SFTPD-202ENST00000444384 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33■■■□□ 2.87
SFTPD-202ENST00000444384 GRIN2BQ13224 1484 aa32.99■■■□□ 2.87
SFTPD-202ENST00000444384 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.98■■■□□ 2.87
SFTPD-202ENST00000444384 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.97■■■□□ 2.87
SFTPD-202ENST00000444384 PBRM1Q86U86 1689 aa32.96■■■□□ 2.87
SFTPD-202ENST00000444384 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
SFTPD-202ENST00000444384 FBLN2P98095 1184 aa32.91■■■□□ 2.86
SFTPD-202ENST00000444384 SYNJ2O15056 1496 aa32.81■■■□□ 2.84
SFTPD-202ENST00000444384 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
SFTPD-202ENST00000444384 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.74■■■□□ 2.83
SFTPD-202ENST00000444384 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.74■■■□□ 2.83
SFTPD-202ENST00000444384 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.74■■■□□ 2.83
SFTPD-202ENST00000444384 ARHGEF11O15085 1522 aa32.71■■■□□ 2.83
SFTPD-202ENST00000444384 TRIM41Q8WV44 630 aa32.69■■■□□ 2.82
SFTPD-202ENST00000444384 ADAMTS12P58397 1594 aa32.68■■■□□ 2.82
SFTPD-202ENST00000444384 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.67■■■□□ 2.82
SFTPD-202ENST00000444384 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.65■■■□□ 2.82
SFTPD-202ENST00000444384 GRIN2AQ12879 1464 aa32.58■■■□□ 2.81
SFTPD-202ENST00000444384 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.57■■■□□ 2.8
SFTPD-202ENST00000444384 KIF27Q86VH2 1401 aa32.47■■■□□ 2.79
SFTPD-202ENST00000444384 CEP170Q5SW79 1584 aa32.45■■■□□ 2.79
SFTPD-202ENST00000444384 NUP160Q12769 1436 aa32.45■■■□□ 2.79
SFTPD-202ENST00000444384 ARAP1Q96P48 1450 aa32.44■■■□□ 2.78
SFTPD-202ENST00000444384 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.37■■■□□ 2.77
SFTPD-202ENST00000444384 IGF1RP08069 1367 aa32.36■■■□□ 2.77
SFTPD-202ENST00000444384 CUL7Q14999 1698 aa32.32■■■□□ 2.76
SFTPD-202ENST00000444384 SHROOM2Q13796 1616 aa32.25■■■□□ 2.75
SFTPD-202ENST00000444384 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.21■■■□□ 2.75
SFTPD-202ENST00000444384 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.21■■■□□ 2.75
SFTPD-202ENST00000444384 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms