RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443532.5

SCLY-211, Transcript of selenocysteine lyase, humanhuman

TSL 5

Gene SCLY, Length 968 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLY-211ENST00000443532 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.52■■■■■ 6.64
SCLY-211ENST00000443532 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.45■■■■■ 5.67
SCLY-211ENST00000443532 ABCC9O60706 1549 aa50.36■■■■■ 5.65
SCLY-211ENST00000443532 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.95■■■■■ 5.27
SCLY-211ENST00000443532 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.73■■■■■ 5.23
SCLY-211ENST00000443532 NACADO15069 1562 aa47.7■■■■■ 5.23
SCLY-211ENST00000443532 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.1■■■■■ 5.13
SCLY-211ENST00000443532 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.05■■■■■ 5.12
SCLY-211ENST00000443532 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.02■■■■■ 5.12
SCLY-211ENST00000443532 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
SCLY-211ENST00000443532 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.81■■■■■ 5.08
SCLY-211ENST00000443532 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.63■■■■■ 5.05
SCLY-211ENST00000443532 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.6■■■■■ 5.05
SCLY-211ENST00000443532 SCRIBQ14160 1630 aa46.14■■■■■ 4.98
SCLY-211ENST00000443532 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.88■■■■■ 4.94
SCLY-211ENST00000443532 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.44■■■■■ 4.86
SCLY-211ENST00000443532 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
SCLY-211ENST00000443532 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.3■■■■■ 4.84
SCLY-211ENST00000443532 NCAPD3P42695 1498 aa44.08■■■■■ 4.65
SCLY-211ENST00000443532 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.02■■■■■ 4.64
SCLY-211ENST00000443532 SMARCA4P51532 1647 aa43.99■■■■■ 4.63
SCLY-211ENST00000443532 SMARCA2P51531 1590 aa43.84■■■■■ 4.61
SCLY-211ENST00000443532 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
SCLY-211ENST00000443532 HMGXB3Q12766 1538 aa43.73■■■■■ 4.59
SCLY-211ENST00000443532 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.59■■■■■ 4.57
SCLY-211ENST00000443532 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
SCLY-211ENST00000443532 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.52■■■■■ 4.56
SCLY-211ENST00000443532 ERCC6Q03468 1493 aa43.43■■■■■ 4.54
SCLY-211ENST00000443532 NESP48681 1621 aa43.37■■■■■ 4.53
SCLY-211ENST00000443532 CUX2O14529 1486 aa43.18■■■■■ 4.5
SCLY-211ENST00000443532 WIZO95785 1651 aa43.05■■■■■ 4.48
SCLY-211ENST00000443532 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.98■■■■■ 4.47
SCLY-211ENST00000443532 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.91■■■■■ 4.46
SCLY-211ENST00000443532 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
SCLY-211ENST00000443532 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.78■■■■■ 4.44
SCLY-211ENST00000443532 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.78■■■■■ 4.44
SCLY-211ENST00000443532 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
SCLY-211ENST00000443532 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.69■■■■■ 4.42
SCLY-211ENST00000443532 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
SCLY-211ENST00000443532 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.4■■■■■ 4.38
SCLY-211ENST00000443532 CFTRP13569 1480 aa42.34■■■■■ 4.37
SCLY-211ENST00000443532 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.3■■■■■ 4.36
SCLY-211ENST00000443532 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.29■■■■■ 4.36
SCLY-211ENST00000443532 WDR62O43379 1518 aa42.25■■■■■ 4.35
SCLY-211ENST00000443532 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.09■■■■■ 4.33
SCLY-211ENST00000443532 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
SCLY-211ENST00000443532 PRDM2Q13029 1718 aa41.76■■■■■ 4.28
SCLY-211ENST00000443532 TOPBP1Q92547 1522 aa41.52■■■■■ 4.24
SCLY-211ENST00000443532 IFT140Q96RY7 1462 aa41.42■■■■■ 4.22
SCLY-211ENST00000443532 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
SCLY-211ENST00000443532 ABCC8Q09428 1581 aa41.37■■■■■ 4.21
SCLY-211ENST00000443532 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.35■■■■■ 4.21
SCLY-211ENST00000443532 OSCARQ8IYS5 282 aa41.35■■■■■ 4.21
SCLY-211ENST00000443532 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
SCLY-211ENST00000443532 TRIM41Q8WV44 630 aa41.23■■■■■ 4.19
SCLY-211ENST00000443532 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
SCLY-211ENST00000443532 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
SCLY-211ENST00000443532 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
SCLY-211ENST00000443532 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.08■■■■■ 4.175e-8■■■□□ 17.8
SCLY-211ENST00000443532 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.02■■■■■ 4.16
SCLY-211ENST00000443532 SOGA1O94964 1423 aa40.96■■■■■ 4.15
SCLY-211ENST00000443532 CUX1P39880 1505 aa40.93■■■■■ 4.14
SCLY-211ENST00000443532 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.91■■■■■ 4.14
SCLY-211ENST00000443532 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SCLY-211ENST00000443532 FBLN2P98095 1184 aa40.78■■■■■ 4.12
SCLY-211ENST00000443532 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.71■■■■■ 4.11
SCLY-211ENST00000443532 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.71■■■■■ 4.11
SCLY-211ENST00000443532 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.71■■■■■ 4.11
SCLY-211ENST00000443532 CHD1O14646 1710 aa40.7■■■■■ 4.11
SCLY-211ENST00000443532 ARHGEF11O15085 1522 aa40.65■■■■■ 4.1
SCLY-211ENST00000443532 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.63■■■■■ 4.09
SCLY-211ENST00000443532 WDR97A6NE52 1622 aa40.6■■■■■ 4.09
SCLY-211ENST00000443532 GRIN2BQ13224 1484 aa40.53■■■■■ 4.08
SCLY-211ENST00000443532 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
SCLY-211ENST00000443532 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
SCLY-211ENST00000443532 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.45■■■■■ 4.07
SCLY-211ENST00000443532 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.43■■■■■ 4.06
SCLY-211ENST00000443532 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.42■■■■■ 4.06
SCLY-211ENST00000443532 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.37■■■■■ 4.05
SCLY-211ENST00000443532 SYNJ2O15056 1496 aa40.36■■■■■ 4.05
SCLY-211ENST00000443532 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.31■■■■■ 4.04
SCLY-211ENST00000443532 PBRM1Q86U86 1689 aa40.31■■■■■ 4.04
SCLY-211ENST00000443532 SYNJ1O43426 1573 aa40.31■■■■■ 4.04
SCLY-211ENST00000443532 TOP2BQ02880 1626 aa40.3■■■■■ 4.04
SCLY-211ENST00000443532 ARAP1Q96P48 1450 aa40.29■■■■■ 4.04
SCLY-211ENST00000443532 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.28■■■■■ 4.04
SCLY-211ENST00000443532 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.27■■■■■ 4.04
SCLY-211ENST00000443532 GRIN2AQ12879 1464 aa40.02■■■■■ 4
SCLY-211ENST00000443532 ADAMTS12P58397 1594 aa40.01■■■■□ 3.99
SCLY-211ENST00000443532 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.94■■■■□ 3.98
SCLY-211ENST00000443532 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.91■■■■□ 3.98
SCLY-211ENST00000443532 NUP160Q12769 1436 aa39.88■■■■□ 3.97
SCLY-211ENST00000443532 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
SCLY-211ENST00000443532 CEP170Q5SW79 1584 aa39.85■■■■□ 3.97
SCLY-211ENST00000443532 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.76■■■■□ 3.95
SCLY-211ENST00000443532 SHROOM2Q13796 1616 aa39.59■■■■□ 3.93
SCLY-211ENST00000443532 IGF1RP08069 1367 aa39.58■■■■□ 3.93
SCLY-211ENST00000443532 KIF27Q86VH2 1401 aa39.57■■■■□ 3.93
SCLY-211ENST00000443532 JPH4Q96JJ6 628 aa39.53■■■■□ 3.92
SCLY-211ENST00000443532 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms