RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442837.5

PHYHD1-211, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHYHD1, Length 780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-211ENST00000442837 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.16■■■■■ 4.82
PHYHD1-211ENST00000442837 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.44■■■■■ 4.06
PHYHD1-211ENST00000442837 ABCC9O60706 1549 aa40.29■■■■■ 4.04
PHYHD1-211ENST00000442837 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.45■■■■□ 3.75
PHYHD1-211ENST00000442837 NACADO15069 1562 aa38.25■■■■□ 3.71
PHYHD1-211ENST00000442837 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.01■■■■□ 3.68
PHYHD1-211ENST00000442837 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.83■■■■□ 3.65
PHYHD1-211ENST00000442837 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.72■■■■□ 3.63
PHYHD1-211ENST00000442837 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.54■■■■□ 3.6
PHYHD1-211ENST00000442837 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.47■■■■□ 3.59
PHYHD1-211ENST00000442837 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
PHYHD1-211ENST00000442837 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.36■■■■□ 3.57
PHYHD1-211ENST00000442837 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.3■■■■□ 3.56
PHYHD1-211ENST00000442837 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.93■■■■□ 3.5
PHYHD1-211ENST00000442837 SCRIBQ14160 1630 aa36.78■■■■□ 3.48
PHYHD1-211ENST00000442837 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.41■■■■□ 3.42
PHYHD1-211ENST00000442837 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
PHYHD1-211ENST00000442837 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.32■■■■□ 3.41
PHYHD1-211ENST00000442837 NCAPD3P42695 1498 aa35.35■■■■□ 3.25
PHYHD1-211ENST00000442837 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.21■■■■□ 3.23
PHYHD1-211ENST00000442837 SMARCA4P51532 1647 aa35.16■■■■□ 3.22
PHYHD1-211ENST00000442837 SMARCA2P51531 1590 aa35.12■■■■□ 3.21
PHYHD1-211ENST00000442837 HMGXB3Q12766 1538 aa35.05■■■■□ 3.2
PHYHD1-211ENST00000442837 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
PHYHD1-211ENST00000442837 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.87■■■■□ 3.17
PHYHD1-211ENST00000442837 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
PHYHD1-211ENST00000442837 ERCC6Q03468 1493 aa34.79■■■■□ 3.16
PHYHD1-211ENST00000442837 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.76■■■■□ 3.16
PHYHD1-211ENST00000442837 CUX2O14529 1486 aa34.75■■■■□ 3.15
PHYHD1-211ENST00000442837 NESP48681 1621 aa34.64■■■■□ 3.14
PHYHD1-211ENST00000442837 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.61■■■■□ 3.13
PHYHD1-211ENST00000442837 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.49■■■■□ 3.11
PHYHD1-211ENST00000442837 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.3■■■■□ 3.08
PHYHD1-211ENST00000442837 WIZO95785 1651 aa34.3■■■■□ 3.08
PHYHD1-211ENST00000442837 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PHYHD1-211ENST00000442837 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.26■■■■□ 3.08
PHYHD1-211ENST00000442837 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.15■■■■□ 3.06
PHYHD1-211ENST00000442837 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
PHYHD1-211ENST00000442837 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.96■■■■□ 3.03
PHYHD1-211ENST00000442837 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
PHYHD1-211ENST00000442837 CFTRP13569 1480 aa33.89■■■■□ 3.02
PHYHD1-211ENST00000442837 WDR62O43379 1518 aa33.88■■■■□ 3.01
PHYHD1-211ENST00000442837 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.85■■■■□ 3.01
PHYHD1-211ENST00000442837 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.82■■■■□ 3.01
PHYHD1-211ENST00000442837 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.56■■■□□ 2.96
PHYHD1-211ENST00000442837 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
PHYHD1-211ENST00000442837 PRDM2Q13029 1718 aa33.43■■■□□ 2.94
PHYHD1-211ENST00000442837 OSCARQ8IYS5 282 aa33.21■■■□□ 2.91
PHYHD1-211ENST00000442837 ABCC8Q09428 1581 aa33.21■■■□□ 2.91
PHYHD1-211ENST00000442837 IFT140Q96RY7 1462 aa33.2■■■□□ 2.91
PHYHD1-211ENST00000442837 TOPBP1Q92547 1522 aa33.19■■■□□ 2.9
PHYHD1-211ENST00000442837 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.08■■■□□ 2.89
PHYHD1-211ENST00000442837 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.89
PHYHD1-211ENST00000442837 TRIM41Q8WV44 630 aa33.05■■■□□ 2.88
PHYHD1-211ENST00000442837 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
PHYHD1-211ENST00000442837 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
PHYHD1-211ENST00000442837 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
PHYHD1-211ENST00000442837 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
PHYHD1-211ENST00000442837 SOGA1O94964 1423 aa32.74■■■□□ 2.83
PHYHD1-211ENST00000442837 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.71■■■□□ 2.83
PHYHD1-211ENST00000442837 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.67■■■□□ 2.82
PHYHD1-211ENST00000442837 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.66■■■□□ 2.82
PHYHD1-211ENST00000442837 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.66■■■□□ 2.82
PHYHD1-211ENST00000442837 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.66■■■□□ 2.82
PHYHD1-211ENST00000442837 CUX1P39880 1505 aa32.65■■■□□ 2.82
PHYHD1-211ENST00000442837 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
PHYHD1-211ENST00000442837 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
PHYHD1-211ENST00000442837 WDR97A6NE52 1622 aa32.62■■■□□ 2.81
PHYHD1-211ENST00000442837 ARHGEF11O15085 1522 aa32.61■■■□□ 2.81
PHYHD1-211ENST00000442837 CHD1O14646 1710 aa32.57■■■□□ 2.8
PHYHD1-211ENST00000442837 FBLN2P98095 1184 aa32.56■■■□□ 2.8
PHYHD1-211ENST00000442837 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.47■■■□□ 2.79
PHYHD1-211ENST00000442837 GRIN2BQ13224 1484 aa32.45■■■□□ 2.79
PHYHD1-211ENST00000442837 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
PHYHD1-211ENST00000442837 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
PHYHD1-211ENST00000442837 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.38■■■□□ 2.77
PHYHD1-211ENST00000442837 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.34■■■□□ 2.77
PHYHD1-211ENST00000442837 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.34■■■□□ 2.77
PHYHD1-211ENST00000442837 SYNJ2O15056 1496 aa32.32■■■□□ 2.76
PHYHD1-211ENST00000442837 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.29■■■□□ 2.76
PHYHD1-211ENST00000442837 ARAP1Q96P48 1450 aa32.29■■■□□ 2.76
PHYHD1-211ENST00000442837 SYNJ1O43426 1573 aa32.28■■■□□ 2.76
PHYHD1-211ENST00000442837 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.24■■■□□ 2.75
PHYHD1-211ENST00000442837 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.24■■■□□ 2.75
PHYHD1-211ENST00000442837 PBRM1Q86U86 1689 aa32.22■■■□□ 2.75
PHYHD1-211ENST00000442837 TOP2BQ02880 1626 aa32.17■■■□□ 2.74
PHYHD1-211ENST00000442837 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.15■■■□□ 2.74
PHYHD1-211ENST00000442837 GRIN2AQ12879 1464 aa32.01■■■□□ 2.71
PHYHD1-211ENST00000442837 ADAMTS12P58397 1594 aa31.98■■■□□ 2.71
PHYHD1-211ENST00000442837 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.96■■■□□ 2.71
PHYHD1-211ENST00000442837 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
PHYHD1-211ENST00000442837 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.94■■■□□ 2.7
PHYHD1-211ENST00000442837 NUP160Q12769 1436 aa31.92■■■□□ 2.7
PHYHD1-211ENST00000442837 CEP170Q5SW79 1584 aa31.85■■■□□ 2.69
PHYHD1-211ENST00000442837 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.74■■■□□ 2.67
PHYHD1-211ENST00000442837 SHROOM2Q13796 1616 aa31.73■■■□□ 2.67
PHYHD1-211ENST00000442837 JPH4Q96JJ6 628 aa31.62■■■□□ 2.65
PHYHD1-211ENST00000442837 KIF27Q86VH2 1401 aa31.59■■■□□ 2.65
PHYHD1-211ENST00000442837 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
PHYHD1-211ENST00000442837 IGF1RP08069 1367 aa31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms