RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442029.5

PTPRN-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-206ENST00000442029 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.72■■■■□ 3.31
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PTPRN-206ENST00000442029 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.35■■■□□ 2.45
PTPRN-206ENST00000442029 NACADO15069 1562 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPRN-206ENST00000442029 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRN-206ENST00000442029 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRN-206ENST00000442029 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRN-206ENST00000442029 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
PTPRN-206ENST00000442029 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.52■■■□□ 2.32
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PTPRN-206ENST00000442029 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.37■■■□□ 2.29
PTPRN-206ENST00000442029 SCRIBQ14160 1630 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRN-206ENST00000442029 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.04■■■□□ 2.24
PTPRN-206ENST00000442029 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRN-206ENST00000442029 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
PTPRN-206ENST00000442029 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.53■■■□□ 2.16
PTPRN-206ENST00000442029 SMARCA4P51532 1647 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRN-206ENST00000442029 NCAPD3P42695 1498 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRN-206ENST00000442029 SMARCA2P51531 1590 aa27.76■■■□□ 2.03
PTPRN-206ENST00000442029 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
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PTPRN-206ENST00000442029 HMGXB3Q12766 1538 aa27.67■■■□□ 2.02
PTPRN-206ENST00000442029 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PTPRN-206ENST00000442029 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.55■■■□□ 2
PTPRN-206ENST00000442029 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.51■■□□□ 1.99
PTPRN-206ENST00000442029 ERCC6Q03468 1493 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRN-206ENST00000442029 NESP48681 1621 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-206ENST00000442029 WIZO95785 1651 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-206ENST00000442029 CUX2O14529 1486 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRN-206ENST00000442029 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRN-206ENST00000442029 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRN-206ENST00000442029 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
PTPRN-206ENST00000442029 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRN-206ENST00000442029 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27■■□□□ 1.91
PTPRN-206ENST00000442029 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRN-206ENST00000442029 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PTPRN-206ENST00000442029 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRN-206ENST00000442029 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRN-206ENST00000442029 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRN-206ENST00000442029 CFTRP13569 1480 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRN-206ENST00000442029 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRN-206ENST00000442029 PRDM2Q13029 1718 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRN-206ENST00000442029 WDR62O43379 1518 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRN-206ENST00000442029 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRN-206ENST00000442029 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRN-206ENST00000442029 TOPBP1Q92547 1522 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRN-206ENST00000442029 ABCC8Q09428 1581 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRN-206ENST00000442029 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRN-206ENST00000442029 IFT140Q96RY7 1462 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRN-206ENST00000442029 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRN-206ENST00000442029 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PTPRN-206ENST00000442029 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRN-206ENST00000442029 OSCARQ8IYS5 282 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRN-206ENST00000442029 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRN-206ENST00000442029 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRN-206ENST00000442029 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
PTPRN-206ENST00000442029 TRIM41Q8WV44 630 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRN-206ENST00000442029 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRN-206ENST00000442029 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRN-206ENST00000442029 CUX1P39880 1505 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRN-206ENST00000442029 SOGA1O94964 1423 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRN-206ENST00000442029 CHD1O14646 1710 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRN-206ENST00000442029 WDR97A6NE52 1622 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRN-206ENST00000442029 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRN-206ENST00000442029 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRN-206ENST00000442029 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRN-206ENST00000442029 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRN-206ENST00000442029 FBLN2P98095 1184 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRN-206ENST00000442029 PBRM1Q86U86 1689 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRN-206ENST00000442029 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRN-206ENST00000442029 GRIN2BQ13224 1484 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRN-206ENST00000442029 ARHGEF11O15085 1522 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRN-206ENST00000442029 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRN-206ENST00000442029 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRN-206ENST00000442029 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRN-206ENST00000442029 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRN-206ENST00000442029 TOP2BQ02880 1626 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRN-206ENST00000442029 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRN-206ENST00000442029 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRN-206ENST00000442029 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
PTPRN-206ENST00000442029 SYNJ1O43426 1573 aa25.51■■□□□ 1.67
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PTPRN-206ENST00000442029 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRN-206ENST00000442029 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRN-206ENST00000442029 ARAP1Q96P48 1450 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRN-206ENST00000442029 ADAMTS12P58397 1594 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRN-206ENST00000442029 GRIN2AQ12879 1464 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRN-206ENST00000442029 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRN-206ENST00000442029 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRN-206ENST00000442029 CEP170Q5SW79 1584 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRN-206ENST00000442029 NUP160Q12769 1436 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRN-206ENST00000442029 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRN-206ENST00000442029 SHROOM2Q13796 1616 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRN-206ENST00000442029 KIF27Q86VH2 1401 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRN-206ENST00000442029 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRN-206ENST00000442029 CUL7Q14999 1698 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRN-206ENST00000442029 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRN-206ENST00000442029 IGF1RP08069 1367 aa24.92■■□□□ 1.58
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