RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441701.1

TMOD4-202, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD4, Length 493 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-202ENST00000441701 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.49■■□□□ 1.35
TMOD4-202ENST00000441701 ABCC9O60706 1549 aa21.33■■□□□ 1
TMOD4-202ENST00000441701 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.07■□□□□ 0.96
TMOD4-202ENST00000441701 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.35■□□□□ 0.85
TMOD4-202ENST00000441701 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.12■□□□□ 0.81
TMOD4-202ENST00000441701 NACADO15069 1562 aa19.96■□□□□ 0.79
TMOD4-202ENST00000441701 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.77
TMOD4-202ENST00000441701 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.86■□□□□ 0.77
TMOD4-202ENST00000441701 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.83■□□□□ 0.77
TMOD4-202ENST00000441701 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.73■□□□□ 0.75
TMOD4-202ENST00000441701 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.63■□□□□ 0.73
TMOD4-202ENST00000441701 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.54■□□□□ 0.72
TMOD4-202ENST00000441701 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
TMOD4-202ENST00000441701 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.34■□□□□ 0.69
TMOD4-202ENST00000441701 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.25■□□□□ 0.67
TMOD4-202ENST00000441701 SCRIBQ14160 1630 aa19.25■□□□□ 0.67
TMOD4-202ENST00000441701 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.18■□□□□ 0.66
TMOD4-202ENST00000441701 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.18■□□□□ 0.66
TMOD4-202ENST00000441701 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
TMOD4-202ENST00000441701 NCAPD3P42695 1498 aa18.5■□□□□ 0.55
TMOD4-202ENST00000441701 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.43■□□□□ 0.54
TMOD4-202ENST00000441701 NESP48681 1621 aa18.34■□□□□ 0.53
TMOD4-202ENST00000441701 SMARCA4P51532 1647 aa18.34■□□□□ 0.53
TMOD4-202ENST00000441701 CUX2O14529 1486 aa18.34■□□□□ 0.53
TMOD4-202ENST00000441701 ERCC6Q03468 1493 aa18.28■□□□□ 0.52
TMOD4-202ENST00000441701 HMGXB3Q12766 1538 aa18.28■□□□□ 0.52
TMOD4-202ENST00000441701 SMARCA2P51531 1590 aa18.25■□□□□ 0.51
TMOD4-202ENST00000441701 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.17■□□□□ 0.5
TMOD4-202ENST00000441701 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.17■□□□□ 0.5
TMOD4-202ENST00000441701 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
TMOD4-202ENST00000441701 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TMOD4-202ENST00000441701 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TMOD4-202ENST00000441701 TRIM41Q8WV44 630 aa18.08■□□□□ 0.48
TMOD4-202ENST00000441701 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.04■□□□□ 0.48
TMOD4-202ENST00000441701 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.03■□□□□ 0.48
TMOD4-202ENST00000441701 WIZO95785 1651 aa17.93■□□□□ 0.46
TMOD4-202ENST00000441701 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.91■□□□□ 0.46
TMOD4-202ENST00000441701 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.89■□□□□ 0.46
TMOD4-202ENST00000441701 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.81■□□□□ 0.44
TMOD4-202ENST00000441701 WDR62O43379 1518 aa17.79■□□□□ 0.44
TMOD4-202ENST00000441701 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
TMOD4-202ENST00000441701 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.69■□□□□ 0.42
TMOD4-202ENST00000441701 CFTRP13569 1480 aa17.68■□□□□ 0.42
TMOD4-202ENST00000441701 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.67■□□□□ 0.42
TMOD4-202ENST00000441701 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
TMOD4-202ENST00000441701 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
TMOD4-202ENST00000441701 OSCARQ8IYS5 282 aa17.5■□□□□ 0.39
TMOD4-202ENST00000441701 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.48■□□□□ 0.39
TMOD4-202ENST00000441701 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
TMOD4-202ENST00000441701 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
TMOD4-202ENST00000441701 PRDM2Q13029 1718 aa17.44■□□□□ 0.38
TMOD4-202ENST00000441701 TOPBP1Q92547 1522 aa17.37■□□□□ 0.37
TMOD4-202ENST00000441701 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.36■□□□□ 0.37
TMOD4-202ENST00000441701 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.36■□□□□ 0.37
TMOD4-202ENST00000441701 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.36■□□□□ 0.37
TMOD4-202ENST00000441701 IFT140Q96RY7 1462 aa17.33■□□□□ 0.37
TMOD4-202ENST00000441701 ARHGEF11O15085 1522 aa17.26■□□□□ 0.35
TMOD4-202ENST00000441701 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TMOD4-202ENST00000441701 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TMOD4-202ENST00000441701 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
TMOD4-202ENST00000441701 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.24■□□□□ 0.35
TMOD4-202ENST00000441701 CHD1O14646 1710 aa17.2■□□□□ 0.34
TMOD4-202ENST00000441701 ABCC8Q09428 1581 aa17.19■□□□□ 0.34
TMOD4-202ENST00000441701 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.18■□□□□ 0.34
TMOD4-202ENST00000441701 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
TMOD4-202ENST00000441701 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.16■□□□□ 0.34
TMOD4-202ENST00000441701 ARAP1Q96P48 1450 aa17.12■□□□□ 0.33
TMOD4-202ENST00000441701 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
TMOD4-202ENST00000441701 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
TMOD4-202ENST00000441701 SOGA1O94964 1423 aa17.08■□□□□ 0.32
TMOD4-202ENST00000441701 FBLN2P98095 1184 aa17.07■□□□□ 0.32
TMOD4-202ENST00000441701 CUX1P39880 1505 aa17.05■□□□□ 0.32
TMOD4-202ENST00000441701 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.04■□□□□ 0.32
TMOD4-202ENST00000441701 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.01■□□□□ 0.31
TMOD4-202ENST00000441701 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.01■□□□□ 0.31
TMOD4-202ENST00000441701 WDR97A6NE52 1622 aa16.96■□□□□ 0.3
TMOD4-202ENST00000441701 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TMOD4-202ENST00000441701 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
TMOD4-202ENST00000441701 GRIN2BQ13224 1484 aa16.9■□□□□ 0.3
TMOD4-202ENST00000441701 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
TMOD4-202ENST00000441701 SYNJ2O15056 1496 aa16.87■□□□□ 0.29
TMOD4-202ENST00000441701 PBRM1Q86U86 1689 aa16.87■□□□□ 0.29
TMOD4-202ENST00000441701 SYNJ1O43426 1573 aa16.86■□□□□ 0.29
TMOD4-202ENST00000441701 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.85■□□□□ 0.29
TMOD4-202ENST00000441701 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.83■□□□□ 0.28
TMOD4-202ENST00000441701 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.83■□□□□ 0.28
TMOD4-202ENST00000441701 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.82■□□□□ 0.28
TMOD4-202ENST00000441701 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TMOD4-202ENST00000441701 CEP170Q5SW79 1584 aa16.72■□□□□ 0.27
TMOD4-202ENST00000441701 GRIN2AQ12879 1464 aa16.72■□□□□ 0.27
TMOD4-202ENST00000441701 NUP160Q12769 1436 aa16.7■□□□□ 0.26
TMOD4-202ENST00000441701 ADAMTS12P58397 1594 aa16.69■□□□□ 0.26
TMOD4-202ENST00000441701 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.68■□□□□ 0.26
TMOD4-202ENST00000441701 TOP2BQ02880 1626 aa16.67■□□□□ 0.26
TMOD4-202ENST00000441701 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
TMOD4-202ENST00000441701 SHROOM2Q13796 1616 aa16.65■□□□□ 0.26
TMOD4-202ENST00000441701 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.61■□□□□ 0.25
TMOD4-202ENST00000441701 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.56■□□□□ 0.24
TMOD4-202ENST00000441701 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.55■□□□□ 0.24
TMOD4-202ENST00000441701 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms