RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441263.1

BMS1P4-201, Transcript of BMS1, ribosome biogenesis factor pseudogene 4, humanhuman

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Gene BMS1P4, Length 1,332 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMS1P4-201ENST00000441263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.62■■■□□ 2.17
BMS1P4-201ENST00000441263 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.4■■□□□ 1.66
BMS1P4-201ENST00000441263 ABCC9O60706 1549 aa24.97■■□□□ 1.59
BMS1P4-201ENST00000441263 NACADO15069 1562 aa24■■□□□ 1.43
BMS1P4-201ENST00000441263 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.99■■□□□ 1.43
BMS1P4-201ENST00000441263 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.93■■□□□ 1.42
BMS1P4-201ENST00000441263 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.88■■□□□ 1.41
BMS1P4-201ENST00000441263 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
BMS1P4-201ENST00000441263 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.74■■□□□ 1.39
BMS1P4-201ENST00000441263 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
BMS1P4-201ENST00000441263 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.31■■□□□ 1.32
BMS1P4-201ENST00000441263 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.3■■□□□ 1.32
BMS1P4-201ENST00000441263 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.18■■□□□ 1.3
BMS1P4-201ENST00000441263 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.13■■□□□ 1.29
BMS1P4-201ENST00000441263 SCRIBQ14160 1630 aa23.09■■□□□ 1.29
BMS1P4-201ENST00000441263 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
BMS1P4-201ENST00000441263 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.58■■□□□ 1.21
BMS1P4-201ENST00000441263 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.5■■□□□ 1.19
BMS1P4-201ENST00000441263 NCAPD3P42695 1498 aa22.23■■□□□ 1.15
BMS1P4-201ENST00000441263 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.16■■□□□ 1.14
BMS1P4-201ENST00000441263 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
BMS1P4-201ENST00000441263 SMARCA4P51532 1647 aa22.15■■□□□ 1.14
BMS1P4-201ENST00000441263 SMARCA2P51531 1590 aa22.08■■□□□ 1.12
BMS1P4-201ENST00000441263 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.04■■□□□ 1.12
BMS1P4-201ENST00000441263 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.01■■□□□ 1.11
BMS1P4-201ENST00000441263 HMGXB3Q12766 1538 aa22■■□□□ 1.11
BMS1P4-201ENST00000441263 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
BMS1P4-201ENST00000441263 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
BMS1P4-201ENST00000441263 WIZO95785 1651 aa21.68■■□□□ 1.06
BMS1P4-201ENST00000441263 NESP48681 1621 aa21.59■■□□□ 1.05
BMS1P4-201ENST00000441263 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.55■■□□□ 1.04
BMS1P4-201ENST00000441263 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.55■■□□□ 1.04
BMS1P4-201ENST00000441263 ERCC6Q03468 1493 aa21.52■■□□□ 1.04
BMS1P4-201ENST00000441263 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
BMS1P4-201ENST00000441263 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.47■■□□□ 1.03
BMS1P4-201ENST00000441263 CUX2O14529 1486 aa21.44■■□□□ 1.02
BMS1P4-201ENST00000441263 CFTRP13569 1480 aa21.39■■□□□ 1.01
BMS1P4-201ENST00000441263 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
BMS1P4-201ENST00000441263 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.31■■□□□ 1
BMS1P4-201ENST00000441263 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
BMS1P4-201ENST00000441263 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.22■□□□□ 0.99
BMS1P4-201ENST00000441263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.21■□□□□ 0.99
BMS1P4-201ENST00000441263 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.19■□□□□ 0.98
BMS1P4-201ENST00000441263 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.18■□□□□ 0.98
BMS1P4-201ENST00000441263 WDR62O43379 1518 aa21.13■□□□□ 0.97
BMS1P4-201ENST00000441263 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
BMS1P4-201ENST00000441263 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.02■□□□□ 0.95
BMS1P4-201ENST00000441263 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
BMS1P4-201ENST00000441263 PRDM2Q13029 1718 aa20.97■□□□□ 0.95
BMS1P4-201ENST00000441263 ABCC8Q09428 1581 aa20.92■□□□□ 0.94
BMS1P4-201ENST00000441263 TOPBP1Q92547 1522 aa20.86■□□□□ 0.93
BMS1P4-201ENST00000441263 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.8■□□□□ 0.92
BMS1P4-201ENST00000441263 IFT140Q96RY7 1462 aa20.79■□□□□ 0.92
BMS1P4-201ENST00000441263 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
BMS1P4-201ENST00000441263 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
BMS1P4-201ENST00000441263 CUX1P39880 1505 aa20.65■□□□□ 0.9
BMS1P4-201ENST00000441263 SOGA1O94964 1423 aa20.64■□□□□ 0.89
BMS1P4-201ENST00000441263 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
BMS1P4-201ENST00000441263 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.59■□□□□ 0.89
BMS1P4-201ENST00000441263 OSCARQ8IYS5 282 aa20.58■□□□□ 0.89
BMS1P4-201ENST00000441263 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.58■□□□□ 0.88
BMS1P4-201ENST00000441263 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
BMS1P4-201ENST00000441263 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
BMS1P4-201ENST00000441263 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
BMS1P4-201ENST00000441263 WDR97A6NE52 1622 aa20.5■□□□□ 0.87
BMS1P4-201ENST00000441263 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
BMS1P4-201ENST00000441263 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.45■□□□□ 0.86
BMS1P4-201ENST00000441263 TOP2BQ02880 1626 aa20.43■□□□□ 0.86
BMS1P4-201ENST00000441263 GRIN2BQ13224 1484 aa20.4■□□□□ 0.86
BMS1P4-201ENST00000441263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.39■□□□□ 0.86
BMS1P4-201ENST00000441263 SYNJ1O43426 1573 aa20.38■□□□□ 0.85
BMS1P4-201ENST00000441263 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.36■□□□□ 0.85
BMS1P4-201ENST00000441263 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
BMS1P4-201ENST00000441263 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.32■□□□□ 0.84
BMS1P4-201ENST00000441263 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.31■□□□□ 0.84
BMS1P4-201ENST00000441263 FBLN2P98095 1184 aa20.29■□□□□ 0.84
BMS1P4-201ENST00000441263 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.29■□□□□ 0.84
BMS1P4-201ENST00000441263 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
BMS1P4-201ENST00000441263 SYNJ2O15056 1496 aa20.27■□□□□ 0.84
BMS1P4-201ENST00000441263 CHD1O14646 1710 aa20.2■□□□□ 0.82
BMS1P4-201ENST00000441263 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.18■□□□□ 0.82
BMS1P4-201ENST00000441263 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.16■□□□□ 0.82
BMS1P4-201ENST00000441263 PBRM1Q86U86 1689 aa20.16■□□□□ 0.82
BMS1P4-201ENST00000441263 ARHGEF11O15085 1522 aa20.14■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.13■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 IGF1RP08069 1367 aa20.11■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 GRIN2AQ12879 1464 aa20.1■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 KIF27Q86VH2 1401 aa20.1■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 ADAMTS12P58397 1594 aa20.08■□□□□ 0.81
BMS1P4-201ENST00000441263 NUP160Q12769 1436 aa20.08■□□□□ 0.8
BMS1P4-201ENST00000441263 TRIM41Q8WV44 630 aa20.07■□□□□ 0.8
BMS1P4-201ENST00000441263 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.01■□□□□ 0.79
BMS1P4-201ENST00000441263 ARAP1Q96P48 1450 aa19.98■□□□□ 0.79
BMS1P4-201ENST00000441263 CEP170Q5SW79 1584 aa19.97■□□□□ 0.79
BMS1P4-201ENST00000441263 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.93■□□□□ 0.78
BMS1P4-201ENST00000441263 JPH4Q96JJ6 628 aa19.91■□□□□ 0.78
BMS1P4-201ENST00000441263 CUL7Q14999 1698 aa19.89■□□□□ 0.77
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