RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440761.1

TTLL1-204, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL1, Length 1,683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-204ENST00000440761 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.76■■■■■ 6.52
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TTLL1-204ENST00000440761 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.71■■■■■ 5.07
TTLL1-204ENST00000440761 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.51■■■■■ 5.04
TTLL1-204ENST00000440761 NACADO15069 1562 aa46.47■■■■■ 5.03
TTLL1-204ENST00000440761 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
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TTLL1-204ENST00000440761 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.04■■■■■ 4.96
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TTLL1-204ENST00000440761 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.36■■■■■ 4.85
TTLL1-204ENST00000440761 SCRIBQ14160 1630 aa45.25■■■■■ 4.83
TTLL1-204ENST00000440761 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.19■■■■■ 4.82
TTLL1-204ENST00000440761 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.52■■■■■ 4.72
TTLL1-204ENST00000440761 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.48■■■■■ 4.71
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TTLL1-204ENST00000440761 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.78■■■■■ 4.6
TTLL1-204ENST00000440761 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.53■■■■■ 4.56
TTLL1-204ENST00000440761 SMARCA4P51532 1647 aa43.24■■■■■ 4.51
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TTLL1-204ENST00000440761 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.99■■■■■ 4.47
TTLL1-204ENST00000440761 NCAPD3P42695 1498 aa42.93■■■■■ 4.46
TTLL1-204ENST00000440761 SMARCA2P51531 1590 aa42.88■■■■■ 4.46
TTLL1-204ENST00000440761 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.76■■■■■ 4.44
TTLL1-204ENST00000440761 HMGXB3Q12766 1538 aa42.68■■■■■ 4.42
TTLL1-204ENST00000440761 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
TTLL1-204ENST00000440761 WIZO95785 1651 aa42.59■■■■■ 4.41
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TTLL1-204ENST00000440761 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.74■■■■■ 4.27
TTLL1-204ENST00000440761 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.7■■■■■ 4.27
TTLL1-204ENST00000440761 ERCC6Q03468 1493 aa41.69■■■■■ 4.26
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TTLL1-204ENST00000440761 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.48■■■■■ 4.23
TTLL1-204ENST00000440761 CFTRP13569 1480 aa41.47■■■■■ 4.23
TTLL1-204ENST00000440761 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.42■■■■■ 4.22
TTLL1-204ENST00000440761 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.24■■■■■ 4.19
TTLL1-204ENST00000440761 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
TTLL1-204ENST00000440761 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.15■■■■■ 4.18
TTLL1-204ENST00000440761 CUX2O14529 1486 aa41.13■■■■■ 4.17
TTLL1-204ENST00000440761 PRDM2Q13029 1718 aa41.1■■■■■ 4.17
TTLL1-204ENST00000440761 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.06■■■■■ 4.16
TTLL1-204ENST00000440761 WDR62O43379 1518 aa40.92■■■■■ 4.14
TTLL1-204ENST00000440761 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
TTLL1-204ENST00000440761 TOPBP1Q92547 1522 aa40.59■■■■■ 4.09
TTLL1-204ENST00000440761 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.5■■■■■ 4.07
TTLL1-204ENST00000440761 ABCC8Q09428 1581 aa40.48■■■■■ 4.07
TTLL1-204ENST00000440761 CUX1P39880 1505 aa40.35■■■■■ 4.05
TTLL1-204ENST00000440761 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
TTLL1-204ENST00000440761 IFT140Q96RY7 1462 aa40.26■■■■■ 4.03
TTLL1-204ENST00000440761 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.18■■■■■ 4.02
TTLL1-204ENST00000440761 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
TTLL1-204ENST00000440761 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.14■■■■■ 4.02
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TTLL1-204ENST00000440761 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.1■■■■■ 4.01
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TTLL1-204ENST00000440761 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.96■■■■□ 3.99
TTLL1-204ENST00000440761 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
TTLL1-204ENST00000440761 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.86■■■■□ 3.97
TTLL1-204ENST00000440761 WDR97A6NE52 1622 aa39.79■■■■□ 3.96
TTLL1-204ENST00000440761 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.76■■■■□ 3.95
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TTLL1-204ENST00000440761 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.6■■■■□ 3.93
TTLL1-204ENST00000440761 GRIN2BQ13224 1484 aa39.58■■■■□ 3.93
TTLL1-204ENST00000440761 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.55■■■■□ 3.92
TTLL1-204ENST00000440761 OSCARQ8IYS5 282 aa39.54■■■■□ 3.92
TTLL1-204ENST00000440761 PBRM1Q86U86 1689 aa39.52■■■■□ 3.92
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TTLL1-204ENST00000440761 CHD1O14646 1710 aa39.45■■■■□ 3.91
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TTLL1-204ENST00000440761 ADAMTS12P58397 1594 aa39.2■■■■□ 3.87
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TTLL1-204ENST00000440761 CEP170Q5SW79 1584 aa38.93■■■■□ 3.82
TTLL1-204ENST00000440761 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.9■■■■□ 3.82
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TTLL1-204ENST00000440761 ARHGEF11O15085 1522 aa38.9■■■■□ 3.82
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TTLL1-204ENST00000440761 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.89■■■■□ 3.82
TTLL1-204ENST00000440761 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.89■■■■□ 3.82
TTLL1-204ENST00000440761 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.89■■■■□ 3.82
TTLL1-204ENST00000440761 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.86■■■■□ 3.81
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TTLL1-204ENST00000440761 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.62■■■■□ 3.77
TTLL1-204ENST00000440761 ARAP1Q96P48 1450 aa38.6■■■■□ 3.77
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