RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439421.2

AL355500.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL355500.1, Length 297 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL355500.1-201ENST00000439421 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.29■■■□□ 2.6
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AL355500.1-201ENST00000439421 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.67■■□□□ 1.86
AL355500.1-201ENST00000439421 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.33■■□□□ 1.81
AL355500.1-201ENST00000439421 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.31■■□□□ 1.8
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AL355500.1-201ENST00000439421 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.89■■□□□ 1.73
AL355500.1-201ENST00000439421 SCRIBQ14160 1630 aa25.68■■□□□ 1.7
AL355500.1-201ENST00000439421 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.63■■□□□ 1.69
AL355500.1-201ENST00000439421 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.58■■□□□ 1.69
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AL355500.1-201ENST00000439421 CUX2O14529 1486 aa24.6■■□□□ 1.53
AL355500.1-201ENST00000439421 ERCC6Q03468 1493 aa24.52■■□□□ 1.52
AL355500.1-201ENST00000439421 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.52■■□□□ 1.52
AL355500.1-201ENST00000439421 HMGXB3Q12766 1538 aa24.51■■□□□ 1.51
AL355500.1-201ENST00000439421 SMARCA4P51532 1647 aa24.5■■□□□ 1.51
AL355500.1-201ENST00000439421 SMARCA2P51531 1590 aa24.49■■□□□ 1.51
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AL355500.1-201ENST00000439421 NESP48681 1621 aa24.29■■□□□ 1.48
AL355500.1-201ENST00000439421 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.28■■□□□ 1.48
AL355500.1-201ENST00000439421 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
AL355500.1-201ENST00000439421 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.16■■□□□ 1.46
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AL355500.1-201ENST00000439421 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.02■■□□□ 1.44
AL355500.1-201ENST00000439421 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.97■■□□□ 1.43
AL355500.1-201ENST00000439421 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.85■■□□□ 1.41
AL355500.1-201ENST00000439421 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.82■■□□□ 1.4
AL355500.1-201ENST00000439421 WIZO95785 1651 aa23.79■■□□□ 1.4
AL355500.1-201ENST00000439421 WDR62O43379 1518 aa23.79■■□□□ 1.4
AL355500.1-201ENST00000439421 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.68■■□□□ 1.38
AL355500.1-201ENST00000439421 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.62■■□□□ 1.37
AL355500.1-201ENST00000439421 CFTRP13569 1480 aa23.56■■□□□ 1.36
AL355500.1-201ENST00000439421 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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AL355500.1-201ENST00000439421 TRIM41Q8WV44 630 aa23.49■■□□□ 1.35
AL355500.1-201ENST00000439421 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
AL355500.1-201ENST00000439421 PRDM2Q13029 1718 aa23.38■■□□□ 1.33
AL355500.1-201ENST00000439421 OSCARQ8IYS5 282 aa23.29■■□□□ 1.32
AL355500.1-201ENST00000439421 IFT140Q96RY7 1462 aa23.21■■□□□ 1.31
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AL355500.1-201ENST00000439421 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.14■■□□□ 1.29
AL355500.1-201ENST00000439421 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.14■■□□□ 1.29
AL355500.1-201ENST00000439421 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
AL355500.1-201ENST00000439421 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.08■■□□□ 1.29
AL355500.1-201ENST00000439421 ABCC8Q09428 1581 aa23.07■■□□□ 1.28
AL355500.1-201ENST00000439421 ARHGEF11O15085 1522 aa23.05■■□□□ 1.28
AL355500.1-201ENST00000439421 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
AL355500.1-201ENST00000439421 CHD1O14646 1710 aa22.94■■□□□ 1.26
AL355500.1-201ENST00000439421 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
AL355500.1-201ENST00000439421 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
AL355500.1-201ENST00000439421 ARAP1Q96P48 1450 aa22.8■■□□□ 1.24
AL355500.1-201ENST00000439421 WDR97A6NE52 1622 aa22.8■■□□□ 1.24
AL355500.1-201ENST00000439421 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.77■■□□□ 1.24
AL355500.1-201ENST00000439421 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.73■■□□□ 1.23
AL355500.1-201ENST00000439421 SOGA1O94964 1423 aa22.73■■□□□ 1.23
AL355500.1-201ENST00000439421 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.73■■□□□ 1.23
AL355500.1-201ENST00000439421 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.73■■□□□ 1.23
AL355500.1-201ENST00000439421 FBLN2P98095 1184 aa22.7■■□□□ 1.22
AL355500.1-201ENST00000439421 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.69■■□□□ 1.22
AL355500.1-201ENST00000439421 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
AL355500.1-201ENST00000439421 CUX1P39880 1505 aa22.67■■□□□ 1.22
AL355500.1-201ENST00000439421 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
AL355500.1-201ENST00000439421 SYNJ1O43426 1573 aa22.65■■□□□ 1.22
AL355500.1-201ENST00000439421 GRIN2BQ13224 1484 aa22.61■■□□□ 1.21
AL355500.1-201ENST00000439421 SYNJ2O15056 1496 aa22.58■■□□□ 1.2
AL355500.1-201ENST00000439421 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
AL355500.1-201ENST00000439421 PBRM1Q86U86 1689 aa22.55■■□□□ 1.2
AL355500.1-201ENST00000439421 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
AL355500.1-201ENST00000439421 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.49■■□□□ 1.19
AL355500.1-201ENST00000439421 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.48■■□□□ 1.19
AL355500.1-201ENST00000439421 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.47■■□□□ 1.19
AL355500.1-201ENST00000439421 ADAMTS12P58397 1594 aa22.35■■□□□ 1.17
AL355500.1-201ENST00000439421 GRIN2AQ12879 1464 aa22.34■■□□□ 1.17
AL355500.1-201ENST00000439421 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.3■■□□□ 1.16
AL355500.1-201ENST00000439421 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
AL355500.1-201ENST00000439421 CEP170Q5SW79 1584 aa22.28■■□□□ 1.16
AL355500.1-201ENST00000439421 NUP160Q12769 1436 aa22.27■■□□□ 1.16
AL355500.1-201ENST00000439421 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.27■■□□□ 1.16
AL355500.1-201ENST00000439421 TOP2BQ02880 1626 aa22.27■■□□□ 1.16
AL355500.1-201ENST00000439421 SHROOM2Q13796 1616 aa22.23■■□□□ 1.15
AL355500.1-201ENST00000439421 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.21■■□□□ 1.15
AL355500.1-201ENST00000439421 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.19■■□□□ 1.14
AL355500.1-201ENST00000439421 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AL355500.1-201ENST00000439421 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
AL355500.1-201ENST00000439421 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.05■■□□□ 1.12
AL355500.1-201ENST00000439421 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
AL355500.1-201ENST00000439421 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22■■□□□ 1.11
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