RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439368.6

ARHGEF4-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF4, Length 901 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4-208ENST00000439368 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.85■■■■■ 6.37
ARHGEF4-208ENST00000439368 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.9■■■■■ 5.42
ARHGEF4-208ENST00000439368 ABCC9O60706 1549 aa48.35■■■■■ 5.33
ARHGEF4-208ENST00000439368 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.26■■■■■ 5
ARHGEF4-208ENST00000439368 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.15■■■■■ 4.98
ARHGEF4-208ENST00000439368 NACADO15069 1562 aa46.09■■■■■ 4.97
ARHGEF4-208ENST00000439368 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.63■■■■■ 4.9
ARHGEF4-208ENST00000439368 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
ARHGEF4-208ENST00000439368 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.31■■■■■ 4.84
ARHGEF4-208ENST00000439368 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.23■■■■■ 4.83
ARHGEF4-208ENST00000439368 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.15■■■■■ 4.82
ARHGEF4-208ENST00000439368 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.88■■■■■ 4.78
ARHGEF4-208ENST00000439368 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.77■■■■■ 4.76
ARHGEF4-208ENST00000439368 SCRIBQ14160 1630 aa44.68■■■■■ 4.74
ARHGEF4-208ENST00000439368 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.29■■■■■ 4.68
ARHGEF4-208ENST00000439368 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
ARHGEF4-208ENST00000439368 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.68■■■■■ 4.58
ARHGEF4-208ENST00000439368 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.46■■■■■ 4.55
ARHGEF4-208ENST00000439368 SMARCA4P51532 1647 aa42.65■■■■■ 4.42
ARHGEF4-208ENST00000439368 NCAPD3P42695 1498 aa42.55■■■■■ 4.4
ARHGEF4-208ENST00000439368 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
ARHGEF4-208ENST00000439368 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.53■■■■■ 4.4
ARHGEF4-208ENST00000439368 SMARCA2P51531 1590 aa42.44■■■■■ 4.38
ARHGEF4-208ENST00000439368 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF4-208ENST00000439368 HMGXB3Q12766 1538 aa42.28■■■■■ 4.36
ARHGEF4-208ENST00000439368 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.19■■■■■ 4.34
ARHGEF4-208ENST00000439368 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
ARHGEF4-208ENST00000439368 WIZO95785 1651 aa41.84■■■■■ 4.29
ARHGEF4-208ENST00000439368 NESP48681 1621 aa41.72■■■■■ 4.27
ARHGEF4-208ENST00000439368 ERCC6Q03468 1493 aa41.7■■■■■ 4.27
ARHGEF4-208ENST00000439368 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
ARHGEF4-208ENST00000439368 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.48■■■■■ 4.23
ARHGEF4-208ENST00000439368 CUX2O14529 1486 aa41.34■■■■■ 4.21
ARHGEF4-208ENST00000439368 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
ARHGEF4-208ENST00000439368 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF4-208ENST00000439368 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF4-208ENST00000439368 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.19■■■■■ 4.18
ARHGEF4-208ENST00000439368 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
ARHGEF4-208ENST00000439368 CFTRP13569 1480 aa40.96■■■■■ 4.15
ARHGEF4-208ENST00000439368 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.87■■■■■ 4.13
ARHGEF4-208ENST00000439368 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.85■■■■■ 4.13
ARHGEF4-208ENST00000439368 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.84■■■■■ 4.13
ARHGEF4-208ENST00000439368 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.83■■■■■ 4.13
ARHGEF4-208ENST00000439368 WDR62O43379 1518 aa40.7■■■■■ 4.11
ARHGEF4-208ENST00000439368 PRDM2Q13029 1718 aa40.6■■■■■ 4.09
ARHGEF4-208ENST00000439368 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.6■■■■■ 4.09
ARHGEF4-208ENST00000439368 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF4-208ENST00000439368 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
ARHGEF4-208ENST00000439368 TOPBP1Q92547 1522 aa40.15■■■■■ 4.02
ARHGEF4-208ENST00000439368 ABCC8Q09428 1581 aa40.09■■■■■ 4.01
ARHGEF4-208ENST00000439368 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.05■■■■■ 4
ARHGEF4-208ENST00000439368 IFT140Q96RY7 1462 aa39.98■■■■□ 3.99
ARHGEF4-208ENST00000439368 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
ARHGEF4-208ENST00000439368 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
ARHGEF4-208ENST00000439368 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
ARHGEF4-208ENST00000439368 CUX1P39880 1505 aa39.7■■■■□ 3.95
ARHGEF4-208ENST00000439368 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
ARHGEF4-208ENST00000439368 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.65■■■■□ 3.94
ARHGEF4-208ENST00000439368 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.63■■■■□ 3.94
ARHGEF4-208ENST00000439368 SOGA1O94964 1423 aa39.63■■■■□ 3.93
ARHGEF4-208ENST00000439368 OSCARQ8IYS5 282 aa39.62■■■■□ 3.93
ARHGEF4-208ENST00000439368 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.61■■■■□ 3.93
ARHGEF4-208ENST00000439368 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
ARHGEF4-208ENST00000439368 WDR97A6NE52 1622 aa39.32■■■■□ 3.89
ARHGEF4-208ENST00000439368 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.3■■■■□ 3.88
ARHGEF4-208ENST00000439368 FBLN2P98095 1184 aa39.27■■■■□ 3.88
ARHGEF4-208ENST00000439368 CHD1O14646 1710 aa39.26■■■■□ 3.88
ARHGEF4-208ENST00000439368 TOP2BQ02880 1626 aa39.22■■■■□ 3.87
ARHGEF4-208ENST00000439368 SYNJ1O43426 1573 aa39.22■■■■□ 3.87
ARHGEF4-208ENST00000439368 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.22■■■■□ 3.87
ARHGEF4-208ENST00000439368 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.21■■■■□ 3.87
ARHGEF4-208ENST00000439368 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.19■■■■□ 3.86
ARHGEF4-208ENST00000439368 GRIN2BQ13224 1484 aa39.18■■■■□ 3.86
ARHGEF4-208ENST00000439368 TRIM41Q8WV44 630 aa39.18■■■■□ 3.86
ARHGEF4-208ENST00000439368 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.15■■■■□ 3.86
ARHGEF4-208ENST00000439368 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
ARHGEF4-208ENST00000439368 PBRM1Q86U86 1689 aa39.08■■■■□ 3.85
ARHGEF4-208ENST00000439368 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.07■■■■□ 3.85
ARHGEF4-208ENST00000439368 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
ARHGEF4-208ENST00000439368 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
ARHGEF4-208ENST00000439368 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
ARHGEF4-208ENST00000439368 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.01■■■■□ 3.84
ARHGEF4-208ENST00000439368 SYNJ2O15056 1496 aa38.98■■■■□ 3.83
ARHGEF4-208ENST00000439368 ARHGEF11O15085 1522 aa38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF4-208ENST00000439368 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.79■■■■□ 3.8
ARHGEF4-208ENST00000439368 ADAMTS12P58397 1594 aa38.74■■■■□ 3.79
ARHGEF4-208ENST00000439368 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.72■■■■□ 3.79
ARHGEF4-208ENST00000439368 GRIN2AQ12879 1464 aa38.68■■■■□ 3.78
ARHGEF4-208ENST00000439368 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.68■■■■□ 3.78
ARHGEF4-208ENST00000439368 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF4-208ENST00000439368 ARAP1Q96P48 1450 aa38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF4-208ENST00000439368 NUP160Q12769 1436 aa38.52■■■■□ 3.76
ARHGEF4-208ENST00000439368 CEP170Q5SW79 1584 aa38.51■■■■□ 3.76
ARHGEF4-208ENST00000439368 KIF27Q86VH2 1401 aa38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF4-208ENST00000439368 IGF1RP08069 1367 aa38.41■■■■□ 3.74
ARHGEF4-208ENST00000439368 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.28■■■■□ 3.72
ARHGEF4-208ENST00000439368 CUL7Q14999 1698 aa38.28■■■■□ 3.72
ARHGEF4-208ENST00000439368 SHROOM2Q13796 1616 aa38.25■■■■□ 3.71
ARHGEF4-208ENST00000439368 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.19■■■■□ 3.7
ARHGEF4-208ENST00000439368 JPH4Q96JJ6 628 aa38.17■■■■□ 3.7
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