RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439092.6

PAFAH2-203, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 2, humanhuman

TSL 3

Gene PAFAH2, Length 778 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAFAH2-203ENST00000439092 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.65■■■□□ 2.18
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PAFAH2-203ENST00000439092 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.55■■□□□ 1.52
PAFAH2-203ENST00000439092 NACADO15069 1562 aa24.33■■□□□ 1.49
PAFAH2-203ENST00000439092 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.3■■□□□ 1.48
PAFAH2-203ENST00000439092 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.25■■□□□ 1.47
PAFAH2-203ENST00000439092 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
PAFAH2-203ENST00000439092 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.07■■□□□ 1.44
PAFAH2-203ENST00000439092 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.89■■□□□ 1.41
PAFAH2-203ENST00000439092 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.84■■□□□ 1.41
PAFAH2-203ENST00000439092 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
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PAFAH2-203ENST00000439092 SCRIBQ14160 1630 aa23.58■■□□□ 1.36
PAFAH2-203ENST00000439092 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.43■■□□□ 1.34
PAFAH2-203ENST00000439092 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.36■■□□□ 1.33
PAFAH2-203ENST00000439092 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.29■■□□□ 1.32
PAFAH2-203ENST00000439092 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PAFAH2-203ENST00000439092 NCAPD3P42695 1498 aa22.42■■□□□ 1.18
PAFAH2-203ENST00000439092 SMARCA4P51532 1647 aa22.42■■□□□ 1.18
PAFAH2-203ENST00000439092 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.41■■□□□ 1.18
PAFAH2-203ENST00000439092 ERCC6Q03468 1493 aa22.36■■□□□ 1.17
PAFAH2-203ENST00000439092 SMARCA2P51531 1590 aa22.34■■□□□ 1.17
PAFAH2-203ENST00000439092 HMGXB3Q12766 1538 aa22.31■■□□□ 1.16
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PAFAH2-203ENST00000439092 CUX2O14529 1486 aa22.25■■□□□ 1.15
PAFAH2-203ENST00000439092 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PAFAH2-203ENST00000439092 NESP48681 1621 aa22.22■■□□□ 1.15
PAFAH2-203ENST00000439092 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.12■■□□□ 1.13
PAFAH2-203ENST00000439092 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.12■■□□□ 1.13
PAFAH2-203ENST00000439092 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PAFAH2-203ENST00000439092 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.99■■□□□ 1.11
PAFAH2-203ENST00000439092 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.97■■□□□ 1.11
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PAFAH2-203ENST00000439092 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.84■■□□□ 1.09
PAFAH2-203ENST00000439092 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.76■■□□□ 1.07
PAFAH2-203ENST00000439092 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.71■■□□□ 1.07
PAFAH2-203ENST00000439092 WDR62O43379 1518 aa21.65■■□□□ 1.06
PAFAH2-203ENST00000439092 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.62■■□□□ 1.05
PAFAH2-203ENST00000439092 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PAFAH2-203ENST00000439092 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.58■■□□□ 1.05
PAFAH2-203ENST00000439092 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PAFAH2-203ENST00000439092 CFTRP13569 1480 aa21.51■■□□□ 1.03
PAFAH2-203ENST00000439092 TRIM41Q8WV44 630 aa21.42■■□□□ 1.02
PAFAH2-203ENST00000439092 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PAFAH2-203ENST00000439092 PRDM2Q13029 1718 aa21.39■■□□□ 1.01
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PAFAH2-203ENST00000439092 OSCARQ8IYS5 282 aa21.19■□□□□ 0.98
PAFAH2-203ENST00000439092 TOPBP1Q92547 1522 aa21.17■□□□□ 0.98
PAFAH2-203ENST00000439092 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PAFAH2-203ENST00000439092 IFT140Q96RY7 1462 aa21.15■□□□□ 0.98
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PAFAH2-203ENST00000439092 ABCC8Q09428 1581 aa21.03■□□□□ 0.96
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PAFAH2-203ENST00000439092 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.95
PAFAH2-203ENST00000439092 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PAFAH2-203ENST00000439092 ARHGEF11O15085 1522 aa20.94■□□□□ 0.94
PAFAH2-203ENST00000439092 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.9■□□□□ 0.94
PAFAH2-203ENST00000439092 FBLN2P98095 1184 aa20.88■□□□□ 0.93
PAFAH2-203ENST00000439092 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.83■□□□□ 0.93
PAFAH2-203ENST00000439092 SOGA1O94964 1423 aa20.82■□□□□ 0.92
PAFAH2-203ENST00000439092 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PAFAH2-203ENST00000439092 CUX1P39880 1505 aa20.79■□□□□ 0.92
PAFAH2-203ENST00000439092 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.78■□□□□ 0.92
PAFAH2-203ENST00000439092 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.77■□□□□ 0.92
PAFAH2-203ENST00000439092 ARAP1Q96P48 1450 aa20.73■□□□□ 0.91
PAFAH2-203ENST00000439092 WDR97A6NE52 1622 aa20.71■□□□□ 0.91
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PAFAH2-203ENST00000439092 PBRM1Q86U86 1689 aa20.67■□□□□ 0.9
PAFAH2-203ENST00000439092 SYNJ1O43426 1573 aa20.65■□□□□ 0.9
PAFAH2-203ENST00000439092 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.65■□□□□ 0.9
PAFAH2-203ENST00000439092 GRIN2BQ13224 1484 aa20.65■□□□□ 0.9
PAFAH2-203ENST00000439092 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PAFAH2-203ENST00000439092 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PAFAH2-203ENST00000439092 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PAFAH2-203ENST00000439092 SYNJ2O15056 1496 aa20.59■□□□□ 0.89
PAFAH2-203ENST00000439092 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.59■□□□□ 0.89
PAFAH2-203ENST00000439092 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.56■□□□□ 0.88
PAFAH2-203ENST00000439092 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.53■□□□□ 0.88
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PAFAH2-203ENST00000439092 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
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PAFAH2-203ENST00000439092 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.38■□□□□ 0.85
PAFAH2-203ENST00000439092 CEP170Q5SW79 1584 aa20.38■□□□□ 0.85
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PAFAH2-203ENST00000439092 SHROOM2Q13796 1616 aa20.25■□□□□ 0.83
PAFAH2-203ENST00000439092 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PAFAH2-203ENST00000439092 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.15■□□□□ 0.82
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PAFAH2-203ENST00000439092 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.06■□□□□ 0.8
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