RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439026.1

DNAJB2-206, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2, humanhuman

TSL 3

Gene DNAJB2, Length 652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB2-206ENST00000439026 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.38■■■■■ 5.5
DNAJB2-206ENST00000439026 ABCC9O60706 1549 aa44.24■■■■■ 4.67
DNAJB2-206ENST00000439026 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.19■■■■■ 4.66
DNAJB2-206ENST00000439026 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.05■■■■■ 4.32
DNAJB2-206ENST00000439026 NACADO15069 1562 aa41.79■■■■■ 4.28
DNAJB2-206ENST00000439026 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.63■■■■■ 4.25
DNAJB2-206ENST00000439026 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.51■■■■■ 4.24
DNAJB2-206ENST00000439026 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
DNAJB2-206ENST00000439026 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
DNAJB2-206ENST00000439026 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.13■■■■■ 4.17
DNAJB2-206ENST00000439026 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
DNAJB2-206ENST00000439026 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.92■■■■■ 4.14
DNAJB2-206ENST00000439026 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.75■■■■■ 4.11
DNAJB2-206ENST00000439026 SCRIBQ14160 1630 aa40.36■■■■■ 4.05
DNAJB2-206ENST00000439026 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.26■■■■■ 4.03
DNAJB2-206ENST00000439026 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.93■■■■□ 3.98
DNAJB2-206ENST00000439026 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
DNAJB2-206ENST00000439026 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.81■■■■□ 3.96
DNAJB2-206ENST00000439026 NCAPD3P42695 1498 aa38.62■■■■□ 3.77
DNAJB2-206ENST00000439026 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.54■■■■□ 3.76
DNAJB2-206ENST00000439026 SMARCA4P51532 1647 aa38.49■■■■□ 3.75
DNAJB2-206ENST00000439026 SMARCA2P51531 1590 aa38.36■■■■□ 3.73
DNAJB2-206ENST00000439026 HMGXB3Q12766 1538 aa38.32■■■■□ 3.72
DNAJB2-206ENST00000439026 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
DNAJB2-206ENST00000439026 ERCC6Q03468 1493 aa38.13■■■■□ 3.69
DNAJB2-206ENST00000439026 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
DNAJB2-206ENST00000439026 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.1■■■■□ 3.69
DNAJB2-206ENST00000439026 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.09■■■■□ 3.69
DNAJB2-206ENST00000439026 NESP48681 1621 aa38.05■■■■□ 3.68
DNAJB2-206ENST00000439026 CUX2O14529 1486 aa38.03■■■■□ 3.68
DNAJB2-206ENST00000439026 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.97■■■■□ 3.67
DNAJB2-206ENST00000439026 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.69■■■■□ 3.62
DNAJB2-206ENST00000439026 WIZO95785 1651 aa37.6■■■■□ 3.61
DNAJB2-206ENST00000439026 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
DNAJB2-206ENST00000439026 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.49■■■■□ 3.59
DNAJB2-206ENST00000439026 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.48■■■■□ 3.59
DNAJB2-206ENST00000439026 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.45■■■■□ 3.59
DNAJB2-206ENST00000439026 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
DNAJB2-206ENST00000439026 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.18■■■■□ 3.54
DNAJB2-206ENST00000439026 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
DNAJB2-206ENST00000439026 WDR62O43379 1518 aa37.1■■■■□ 3.53
DNAJB2-206ENST00000439026 CFTRP13569 1480 aa37.05■■■■□ 3.52
DNAJB2-206ENST00000439026 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.04■■■■□ 3.52
DNAJB2-206ENST00000439026 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.03■■■■□ 3.52
DNAJB2-206ENST00000439026 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
DNAJB2-206ENST00000439026 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.73■■■■□ 3.47
DNAJB2-206ENST00000439026 PRDM2Q13029 1718 aa36.58■■■■□ 3.45
DNAJB2-206ENST00000439026 TOPBP1Q92547 1522 aa36.34■■■■□ 3.41
DNAJB2-206ENST00000439026 TRIM41Q8WV44 630 aa36.34■■■■□ 3.41
DNAJB2-206ENST00000439026 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
DNAJB2-206ENST00000439026 OSCARQ8IYS5 282 aa36.3■■■■□ 3.4
DNAJB2-206ENST00000439026 IFT140Q96RY7 1462 aa36.3■■■■□ 3.4
DNAJB2-206ENST00000439026 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.19■■■■□ 3.38
DNAJB2-206ENST00000439026 ABCC8Q09428 1581 aa36.18■■■■□ 3.38
DNAJB2-206ENST00000439026 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
DNAJB2-206ENST00000439026 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
DNAJB2-206ENST00000439026 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
DNAJB2-206ENST00000439026 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.98■■■■□ 3.35
DNAJB2-206ENST00000439026 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.89■■■■□ 3.34
DNAJB2-206ENST00000439026 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
DNAJB2-206ENST00000439026 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
DNAJB2-206ENST00000439026 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
DNAJB2-206ENST00000439026 SOGA1O94964 1423 aa35.8■■■■□ 3.32
DNAJB2-206ENST00000439026 CUX1P39880 1505 aa35.78■■■■□ 3.32
DNAJB2-206ENST00000439026 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.77■■■■□ 3.32
DNAJB2-206ENST00000439026 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
DNAJB2-206ENST00000439026 ARHGEF11O15085 1522 aa35.76■■■■□ 3.31
DNAJB2-206ENST00000439026 CHD1O14646 1710 aa35.74■■■■□ 3.31
DNAJB2-206ENST00000439026 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
DNAJB2-206ENST00000439026 FBLN2P98095 1184 aa35.67■■■■□ 3.3
DNAJB2-206ENST00000439026 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.59■■■■□ 3.29
DNAJB2-206ENST00000439026 WDR97A6NE52 1622 aa35.57■■■■□ 3.28
DNAJB2-206ENST00000439026 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.5■■■■□ 3.27
DNAJB2-206ENST00000439026 GRIN2BQ13224 1484 aa35.47■■■■□ 3.27
DNAJB2-206ENST00000439026 ARAP1Q96P48 1450 aa35.45■■■■□ 3.27
DNAJB2-206ENST00000439026 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
DNAJB2-206ENST00000439026 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
DNAJB2-206ENST00000439026 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.38■■■■□ 3.25
DNAJB2-206ENST00000439026 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.36■■■■□ 3.25
DNAJB2-206ENST00000439026 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.36■■■■□ 3.25
DNAJB2-206ENST00000439026 SYNJ2O15056 1496 aa35.35■■■■□ 3.25
DNAJB2-206ENST00000439026 PBRM1Q86U86 1689 aa35.31■■■■□ 3.24
DNAJB2-206ENST00000439026 SYNJ1O43426 1573 aa35.3■■■■□ 3.24
DNAJB2-206ENST00000439026 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.29■■■■□ 3.24
DNAJB2-206ENST00000439026 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.2■■■■□ 3.23
DNAJB2-206ENST00000439026 TOP2BQ02880 1626 aa35.17■■■■□ 3.22
DNAJB2-206ENST00000439026 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.16■■■■□ 3.22
DNAJB2-206ENST00000439026 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
DNAJB2-206ENST00000439026 GRIN2AQ12879 1464 aa35.03■■■■□ 3.2
DNAJB2-206ENST00000439026 ADAMTS12P58397 1594 aa35.03■■■■□ 3.2
DNAJB2-206ENST00000439026 CEP170Q5SW79 1584 aa34.93■■■■□ 3.18
DNAJB2-206ENST00000439026 NUP160Q12769 1436 aa34.93■■■■□ 3.18
DNAJB2-206ENST00000439026 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.91■■■■□ 3.18
DNAJB2-206ENST00000439026 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.9■■■■□ 3.18
DNAJB2-206ENST00000439026 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.88■■■■□ 3.17
DNAJB2-206ENST00000439026 SHROOM2Q13796 1616 aa34.73■■■■□ 3.15
DNAJB2-206ENST00000439026 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.13
DNAJB2-206ENST00000439026 JPH4Q96JJ6 628 aa34.55■■■■□ 3.12
DNAJB2-206ENST00000439026 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.53■■■■□ 3.12
DNAJB2-206ENST00000439026 IGF1RP08069 1367 aa34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms