RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439014.1

AL353803.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AL353803.1, Length 800 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL353803.1-201ENST00000439014 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.42■■■□□ 2.46
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AL353803.1-201ENST00000439014 ABCC9O60706 1549 aa26.62■■□□□ 1.85
AL353803.1-201ENST00000439014 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.56■■□□□ 1.68
AL353803.1-201ENST00000439014 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.48■■□□□ 1.67
AL353803.1-201ENST00000439014 NACADO15069 1562 aa25.41■■□□□ 1.66
AL353803.1-201ENST00000439014 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
AL353803.1-201ENST00000439014 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.19■■□□□ 1.62
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AL353803.1-201ENST00000439014 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.95■■□□□ 1.58
AL353803.1-201ENST00000439014 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
AL353803.1-201ENST00000439014 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.77■■□□□ 1.56
AL353803.1-201ENST00000439014 SCRIBQ14160 1630 aa24.75■■□□□ 1.55
AL353803.1-201ENST00000439014 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.55■■□□□ 1.52
AL353803.1-201ENST00000439014 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.35■■□□□ 1.49
AL353803.1-201ENST00000439014 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
AL353803.1-201ENST00000439014 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.03■■□□□ 1.44
AL353803.1-201ENST00000439014 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.88■■□□□ 1.41
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AL353803.1-201ENST00000439014 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.51■■□□□ 1.35
AL353803.1-201ENST00000439014 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.49■■□□□ 1.35
AL353803.1-201ENST00000439014 NCAPD3P42695 1498 aa23.48■■□□□ 1.35
AL353803.1-201ENST00000439014 SMARCA2P51531 1590 aa23.43■■□□□ 1.34
AL353803.1-201ENST00000439014 HMGXB3Q12766 1538 aa23.33■■□□□ 1.33
AL353803.1-201ENST00000439014 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.33■■□□□ 1.33
AL353803.1-201ENST00000439014 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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AL353803.1-201ENST00000439014 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
AL353803.1-201ENST00000439014 NESP48681 1621 aa23.04■■□□□ 1.28
AL353803.1-201ENST00000439014 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
AL353803.1-201ENST00000439014 ERCC6Q03468 1493 aa22.9■■□□□ 1.26
AL353803.1-201ENST00000439014 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.84■■□□□ 1.25
AL353803.1-201ENST00000439014 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.81■■□□□ 1.24
AL353803.1-201ENST00000439014 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.71■■□□□ 1.23
AL353803.1-201ENST00000439014 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.71■■□□□ 1.23
AL353803.1-201ENST00000439014 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.71■■□□□ 1.23
AL353803.1-201ENST00000439014 CFTRP13569 1480 aa22.65■■□□□ 1.22
AL353803.1-201ENST00000439014 CUX2O14529 1486 aa22.63■■□□□ 1.21
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AL353803.1-201ENST00000439014 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
AL353803.1-201ENST00000439014 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.56■■□□□ 1.2
AL353803.1-201ENST00000439014 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.53■■□□□ 1.2
AL353803.1-201ENST00000439014 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.51■■□□□ 1.19
AL353803.1-201ENST00000439014 PRDM2Q13029 1718 aa22.43■■□□□ 1.18
AL353803.1-201ENST00000439014 WDR62O43379 1518 aa22.42■■□□□ 1.18
AL353803.1-201ENST00000439014 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
AL353803.1-201ENST00000439014 TOPBP1Q92547 1522 aa22.2■■□□□ 1.14
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AL353803.1-201ENST00000439014 ABCC8Q09428 1581 aa22.11■■□□□ 1.13
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AL353803.1-201ENST00000439014 IFT140Q96RY7 1462 aa22.04■■□□□ 1.12
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AL353803.1-201ENST00000439014 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
AL353803.1-201ENST00000439014 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.96■■□□□ 1.11
AL353803.1-201ENST00000439014 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.96■■□□□ 1.11
AL353803.1-201ENST00000439014 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
AL353803.1-201ENST00000439014 SOGA1O94964 1423 aa21.92■■□□□ 1.1
AL353803.1-201ENST00000439014 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
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AL353803.1-201ENST00000439014 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
AL353803.1-201ENST00000439014 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
AL353803.1-201ENST00000439014 SYNJ1O43426 1573 aa21.82■■□□□ 1.08
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AL353803.1-201ENST00000439014 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.77■■□□□ 1.08
AL353803.1-201ENST00000439014 WDR97A6NE52 1622 aa21.74■■□□□ 1.07
AL353803.1-201ENST00000439014 OSCARQ8IYS5 282 aa21.73■■□□□ 1.07
AL353803.1-201ENST00000439014 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.7■■□□□ 1.06
AL353803.1-201ENST00000439014 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.67■■□□□ 1.06
AL353803.1-201ENST00000439014 FBLN2P98095 1184 aa21.66■■□□□ 1.06
AL353803.1-201ENST00000439014 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.65■■□□□ 1.06
AL353803.1-201ENST00000439014 GRIN2BQ13224 1484 aa21.64■■□□□ 1.06
AL353803.1-201ENST00000439014 CHD1O14646 1710 aa21.63■■□□□ 1.05
AL353803.1-201ENST00000439014 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.62■■□□□ 1.05
AL353803.1-201ENST00000439014 PBRM1Q86U86 1689 aa21.6■■□□□ 1.05
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AL353803.1-201ENST00000439014 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
AL353803.1-201ENST00000439014 SYNJ2O15056 1496 aa21.51■■□□□ 1.03
AL353803.1-201ENST00000439014 ADAMTS12P58397 1594 aa21.44■■□□□ 1.02
AL353803.1-201ENST00000439014 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.42■■□□□ 1.02
AL353803.1-201ENST00000439014 TRIM41Q8WV44 630 aa21.41■■□□□ 1.02
AL353803.1-201ENST00000439014 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.4■■□□□ 1.02
AL353803.1-201ENST00000439014 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.4■■□□□ 1.02
AL353803.1-201ENST00000439014 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.4■■□□□ 1.02
AL353803.1-201ENST00000439014 ARHGEF11O15085 1522 aa21.39■■□□□ 1.01
AL353803.1-201ENST00000439014 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.38■■□□□ 1.01
AL353803.1-201ENST00000439014 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.38■■□□□ 1.01
AL353803.1-201ENST00000439014 GRIN2AQ12879 1464 aa21.38■■□□□ 1.01
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AL353803.1-201ENST00000439014 IGF1RP08069 1367 aa21.33■■□□□ 1
AL353803.1-201ENST00000439014 CEP170Q5SW79 1584 aa21.3■■□□□ 1
AL353803.1-201ENST00000439014 NUP160Q12769 1436 aa21.28■■□□□ 1
AL353803.1-201ENST00000439014 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.27■■□□□ 1
AL353803.1-201ENST00000439014 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.24■□□□□ 0.99
AL353803.1-201ENST00000439014 ARAP1Q96P48 1450 aa21.23■□□□□ 0.99
AL353803.1-201ENST00000439014 CUL7Q14999 1698 aa21.2■□□□□ 0.98
AL353803.1-201ENST00000439014 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.2■□□□□ 0.98
AL353803.1-201ENST00000439014 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.16■□□□□ 0.98
AL353803.1-201ENST00000439014 SHROOM2Q13796 1616 aa21.11■□□□□ 0.97
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