RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.19■■■■■ 8.19
UPP1-208ENST00000436673 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.29■■■■■ 7.08
UPP1-208ENST00000436673 ABCC9O60706 1549 aa59.23■■■■■ 7.07
UPP1-208ENST00000436673 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.42■■■■■ 6.62
UPP1-208ENST00000436673 NACADO15069 1562 aa56.08■■■■■ 6.57
UPP1-208ENST00000436673 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.8■■■■■ 6.52
UPP1-208ENST00000436673 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.5■■■■■ 6.48
UPP1-208ENST00000436673 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.37■■■■■ 6.45
UPP1-208ENST00000436673 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.19■■■■■ 6.43
UPP1-208ENST00000436673 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.07■■■■■ 6.41
UPP1-208ENST00000436673 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.89■■■■■ 6.38
UPP1-208ENST00000436673 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.79■■■■■ 6.36
UPP1-208ENST00000436673 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.7■■■■■ 6.35
UPP1-208ENST00000436673 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.08■■■■■ 6.25
UPP1-208ENST00000436673 SCRIBQ14160 1630 aa54.05■■■■■ 6.24
UPP1-208ENST00000436673 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.5■■■■■ 6.15
UPP1-208ENST00000436673 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.43■■■■■ 6.14
UPP1-208ENST00000436673 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.35■■■■■ 6.13
UPP1-208ENST00000436673 NCAPD3P42695 1498 aa51.8■■■■■ 5.88
UPP1-208ENST00000436673 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.65■■■■■ 5.86
UPP1-208ENST00000436673 SMARCA4P51532 1647 aa51.58■■■■■ 5.85
UPP1-208ENST00000436673 SMARCA2P51531 1590 aa51.49■■■■■ 5.83
UPP1-208ENST00000436673 HMGXB3Q12766 1538 aa51.39■■■■■ 5.82
UPP1-208ENST00000436673 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.36■■■■■ 5.81
UPP1-208ENST00000436673 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.13■■■■■ 5.78
UPP1-208ENST00000436673 ERCC6Q03468 1493 aa51.12■■■■■ 5.77
UPP1-208ENST00000436673 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.11■■■■■ 5.77
UPP1-208ENST00000436673 CUX2O14529 1486 aa51.02■■■■■ 5.76
UPP1-208ENST00000436673 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.01■■■■■ 5.76
UPP1-208ENST00000436673 NESP48681 1621 aa50.91■■■■■ 5.74
UPP1-208ENST00000436673 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.89■■■■■ 5.74
UPP1-208ENST00000436673 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.57■■■■■ 5.69
UPP1-208ENST00000436673 WIZO95785 1651 aa50.36■■■■■ 5.65
UPP1-208ENST00000436673 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.36■■■■■ 5.65
UPP1-208ENST00000436673 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.3■■■■■ 5.64
UPP1-208ENST00000436673 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.23■■■■■ 5.63
UPP1-208ENST00000436673 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.2■■■■■ 5.63
UPP1-208ENST00000436673 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.02■■■■■ 5.6
UPP1-208ENST00000436673 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.85■■■■■ 5.57
UPP1-208ENST00000436673 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.75■■■■■ 5.56
UPP1-208ENST00000436673 WDR62O43379 1518 aa49.72■■■■■ 5.55
UPP1-208ENST00000436673 CFTRP13569 1480 aa49.68■■■■■ 5.54
UPP1-208ENST00000436673 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.67■■■■■ 5.54
UPP1-208ENST00000436673 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.63■■■■■ 5.54
UPP1-208ENST00000436673 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
UPP1-208ENST00000436673 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.21■■■■■ 5.47
UPP1-208ENST00000436673 PRDM2Q13029 1718 aa49.07■■■■■ 5.45
UPP1-208ENST00000436673 OSCARQ8IYS5 282 aa48.72■■■■■ 5.39
UPP1-208ENST00000436673 TOPBP1Q92547 1522 aa48.71■■■■■ 5.39
UPP1-208ENST00000436673 IFT140Q96RY7 1462 aa48.69■■■■■ 5.39
UPP1-208ENST00000436673 TRIM41Q8WV44 630 aa48.65■■■■■ 5.38
UPP1-208ENST00000436673 ABCC8Q09428 1581 aa48.61■■■■■ 5.37
UPP1-208ENST00000436673 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.6■■■■■ 5.37
UPP1-208ENST00000436673 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.52■■■■■ 5.36
UPP1-208ENST00000436673 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
UPP1-208ENST00000436673 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
UPP1-208ENST00000436673 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.23■■■■■ 5.31
UPP1-208ENST00000436673 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.17■■■■■ 5.3
UPP1-208ENST00000436673 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.04■■■■■ 5.28
UPP1-208ENST00000436673 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.03■■■■■ 5.28
UPP1-208ENST00000436673 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.03■■■■■ 5.28
UPP1-208ENST00000436673 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.03■■■■■ 5.28
UPP1-208ENST00000436673 SOGA1O94964 1423 aa48.01■■■■■ 5.28
UPP1-208ENST00000436673 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.93■■■■■ 5.26
UPP1-208ENST00000436673 ARHGEF11O15085 1522 aa47.91■■■■■ 5.26
UPP1-208ENST00000436673 CUX1P39880 1505 aa47.91■■■■■ 5.26
UPP1-208ENST00000436673 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
UPP1-208ENST00000436673 CHD1O14646 1710 aa47.88■■■■■ 5.26
UPP1-208ENST00000436673 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
UPP1-208ENST00000436673 FBLN2P98095 1184 aa47.82■■■■■ 5.25
UPP1-208ENST00000436673 WDR97A6NE52 1622 aa47.77■■■■■ 5.24
UPP1-208ENST00000436673 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.68■■■■■ 5.22
UPP1-208ENST00000436673 GRIN2BQ13224 1484 aa47.58■■■■■ 5.21
UPP1-208ENST00000436673 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.57■■■■■ 5.21
UPP1-208ENST00000436673 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.57■■■■■ 5.21
UPP1-208ENST00000436673 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
UPP1-208ENST00000436673 ARAP1Q96P48 1450 aa47.46■■■■■ 5.19
UPP1-208ENST00000436673 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.42■■■■■ 5.18
UPP1-208ENST00000436673 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.4■■■■■ 5.18
UPP1-208ENST00000436673 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.4■■■■■ 5.18
UPP1-208ENST00000436673 SYNJ2O15056 1496 aa47.4■■■■■ 5.18
UPP1-208ENST00000436673 SYNJ1O43426 1573 aa47.37■■■■■ 5.17
UPP1-208ENST00000436673 PBRM1Q86U86 1689 aa47.32■■■■■ 5.17
UPP1-208ENST00000436673 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.3■■■■■ 5.16
UPP1-208ENST00000436673 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.24■■■■■ 5.15
UPP1-208ENST00000436673 TOP2BQ02880 1626 aa47.16■■■■■ 5.14
UPP1-208ENST00000436673 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.14■■■■■ 5.14
UPP1-208ENST00000436673 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.97■■■■■ 5.11
UPP1-208ENST00000436673 GRIN2AQ12879 1464 aa46.96■■■■■ 5.11
UPP1-208ENST00000436673 ADAMTS12P58397 1594 aa46.94■■■■■ 5.1
UPP1-208ENST00000436673 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.84■■■■■ 5.09
UPP1-208ENST00000436673 NUP160Q12769 1436 aa46.82■■■■■ 5.09
UPP1-208ENST00000436673 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.8■■■■■ 5.08
UPP1-208ENST00000436673 CEP170Q5SW79 1584 aa46.77■■■■■ 5.08
UPP1-208ENST00000436673 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.67■■■■■ 5.06
UPP1-208ENST00000436673 SHROOM2Q13796 1616 aa46.56■■■■■ 5.04
UPP1-208ENST00000436673 JPH4Q96JJ6 628 aa46.35■■■■■ 5.01
UPP1-208ENST00000436673 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.35■■■■■ 5.01
UPP1-208ENST00000436673 IGF1RP08069 1367 aa46.27■■■■■ 5
UPP1-208ENST00000436673 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.27■■■■■ 5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms