RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436645.1

DGCR6-204, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

TSL 5

Gene DGCR6, Length 812 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-204ENST00000436645 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.95■■■■■ 4.63
DGCR6-204ENST00000436645 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.24■■■■□ 3.87
DGCR6-204ENST00000436645 ABCC9O60706 1549 aa38.37■■■■□ 3.73
DGCR6-204ENST00000436645 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.91■■■■□ 3.5
DGCR6-204ENST00000436645 NACADO15069 1562 aa36.84■■■■□ 3.49
DGCR6-204ENST00000436645 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
DGCR6-204ENST00000436645 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.61■■■■□ 3.45
DGCR6-204ENST00000436645 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.52■■■■□ 3.44
DGCR6-204ENST00000436645 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.4■■■■□ 3.42
DGCR6-204ENST00000436645 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.18■■■■□ 3.38
DGCR6-204ENST00000436645 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.85■■■■□ 3.33
DGCR6-204ENST00000436645 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.74■■■■□ 3.31
DGCR6-204ENST00000436645 SCRIBQ14160 1630 aa35.71■■■■□ 3.31
DGCR6-204ENST00000436645 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.47■■■■□ 3.27
DGCR6-204ENST00000436645 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.29■■■■□ 3.24
DGCR6-204ENST00000436645 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
DGCR6-204ENST00000436645 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.77■■■■□ 3.16
DGCR6-204ENST00000436645 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.5■■■■□ 3.11
DGCR6-204ENST00000436645 SMARCA4P51532 1647 aa34.17■■■■□ 3.06
DGCR6-204ENST00000436645 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
DGCR6-204ENST00000436645 NCAPD3P42695 1498 aa33.96■■■■□ 3.03
DGCR6-204ENST00000436645 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.96■■■■□ 3.03
DGCR6-204ENST00000436645 SMARCA2P51531 1590 aa33.94■■■■□ 3.02
DGCR6-204ENST00000436645 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.86■■■■□ 3.01
DGCR6-204ENST00000436645 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.86■■■■□ 3.01
DGCR6-204ENST00000436645 HMGXB3Q12766 1538 aa33.85■■■■□ 3.01
DGCR6-204ENST00000436645 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
DGCR6-204ENST00000436645 WIZO95785 1651 aa33.52■■■□□ 2.96
DGCR6-204ENST00000436645 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
DGCR6-204ENST00000436645 NESP48681 1621 aa33.19■■■□□ 2.9
DGCR6-204ENST00000436645 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
DGCR6-204ENST00000436645 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.13■■■□□ 2.89
DGCR6-204ENST00000436645 ERCC6Q03468 1493 aa33.05■■■□□ 2.88
DGCR6-204ENST00000436645 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.93■■■□□ 2.86
DGCR6-204ENST00000436645 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.88■■■□□ 2.85
DGCR6-204ENST00000436645 CUX2O14529 1486 aa32.82■■■□□ 2.84
DGCR6-204ENST00000436645 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.82■■■□□ 2.84
DGCR6-204ENST00000436645 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
DGCR6-204ENST00000436645 CFTRP13569 1480 aa32.75■■■□□ 2.83
DGCR6-204ENST00000436645 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.71■■■□□ 2.83
DGCR6-204ENST00000436645 PRDM2Q13029 1718 aa32.63■■■□□ 2.81
DGCR6-204ENST00000436645 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.58■■■□□ 2.81
DGCR6-204ENST00000436645 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.56■■■□□ 2.8
DGCR6-204ENST00000436645 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.55■■■□□ 2.8
DGCR6-204ENST00000436645 WDR62O43379 1518 aa32.5■■■□□ 2.79
DGCR6-204ENST00000436645 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
DGCR6-204ENST00000436645 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
DGCR6-204ENST00000436645 TOPBP1Q92547 1522 aa32.07■■■□□ 2.72
DGCR6-204ENST00000436645 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.05■■■□□ 2.72
DGCR6-204ENST00000436645 ABCC8Q09428 1581 aa32.02■■■□□ 2.72
DGCR6-204ENST00000436645 IFT140Q96RY7 1462 aa31.88■■■□□ 2.69
DGCR6-204ENST00000436645 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.87■■■□□ 2.69
DGCR6-204ENST00000436645 CUX1P39880 1505 aa31.79■■■□□ 2.68
DGCR6-204ENST00000436645 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
DGCR6-204ENST00000436645 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
DGCR6-204ENST00000436645 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
DGCR6-204ENST00000436645 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
DGCR6-204ENST00000436645 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.68■■■□□ 2.66
DGCR6-204ENST00000436645 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.61■■■□□ 2.65
DGCR6-204ENST00000436645 SOGA1O94964 1423 aa31.58■■■□□ 2.65
DGCR6-204ENST00000436645 WDR97A6NE52 1622 aa31.55■■■□□ 2.64
DGCR6-204ENST00000436645 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.53■■■□□ 2.64
DGCR6-204ENST00000436645 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.63
DGCR6-204ENST00000436645 TOP2BQ02880 1626 aa31.5■■■□□ 2.63
DGCR6-204ENST00000436645 SYNJ1O43426 1573 aa31.49■■■□□ 2.63
DGCR6-204ENST00000436645 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
DGCR6-204ENST00000436645 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
DGCR6-204ENST00000436645 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.39■■■□□ 2.61
DGCR6-204ENST00000436645 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.34■■■□□ 2.61
DGCR6-204ENST00000436645 CHD1O14646 1710 aa31.33■■■□□ 2.61
DGCR6-204ENST00000436645 PBRM1Q86U86 1689 aa31.31■■■□□ 2.6
DGCR6-204ENST00000436645 OSCARQ8IYS5 282 aa31.3■■■□□ 2.6
DGCR6-204ENST00000436645 GRIN2BQ13224 1484 aa31.27■■■□□ 2.6
DGCR6-204ENST00000436645 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.27■■■□□ 2.6
DGCR6-204ENST00000436645 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.25■■■□□ 2.59
DGCR6-204ENST00000436645 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
DGCR6-204ENST00000436645 SYNJ2O15056 1496 aa31.1■■■□□ 2.57
DGCR6-204ENST00000436645 FBLN2P98095 1184 aa31.04■■■□□ 2.56
DGCR6-204ENST00000436645 ADAMTS12P58397 1594 aa31.04■■■□□ 2.56
DGCR6-204ENST00000436645 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.01■■■□□ 2.55
DGCR6-204ENST00000436645 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
DGCR6-204ENST00000436645 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
DGCR6-204ENST00000436645 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
DGCR6-204ENST00000436645 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.98■■■□□ 2.55
DGCR6-204ENST00000436645 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
DGCR6-204ENST00000436645 ARHGEF11O15085 1522 aa30.93■■■□□ 2.54
DGCR6-204ENST00000436645 GRIN2AQ12879 1464 aa30.89■■■□□ 2.54
DGCR6-204ENST00000436645 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.89■■■□□ 2.53
DGCR6-204ENST00000436645 KIF27Q86VH2 1401 aa30.81■■■□□ 2.52
DGCR6-204ENST00000436645 CEP170Q5SW79 1584 aa30.78■■■□□ 2.52
DGCR6-204ENST00000436645 NUP160Q12769 1436 aa30.77■■■□□ 2.52
DGCR6-204ENST00000436645 CUL7Q14999 1698 aa30.74■■■□□ 2.51
DGCR6-204ENST00000436645 TRIM41Q8WV44 630 aa30.71■■■□□ 2.51
DGCR6-204ENST00000436645 IGF1RP08069 1367 aa30.69■■■□□ 2.5
DGCR6-204ENST00000436645 ARAP1Q96P48 1450 aa30.69■■■□□ 2.5
DGCR6-204ENST00000436645 SHROOM2Q13796 1616 aa30.62■■■□□ 2.49
DGCR6-204ENST00000436645 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.59■■■□□ 2.49
DGCR6-204ENST00000436645 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.51■■■□□ 2.47
DGCR6-204ENST00000436645 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.5■■■□□ 2.47
DGCR6-204ENST00000436645 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.5■■■□□ 2.47
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