RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436280.5

GPN1-204, Transcript of GPN-loop GTPase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPN1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1-204ENST00000436280 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.4■■■■□ 3.1
GPN1-204ENST00000436280 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.71■■■□□ 2.51
GPN1-204ENST00000436280 ABCC9O60706 1549 aa30.29■■■□□ 2.44
GPN1-204ENST00000436280 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.05■■■□□ 2.24
GPN1-204ENST00000436280 NACADO15069 1562 aa28.96■■■□□ 2.23
GPN1-204ENST00000436280 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.88■■■□□ 2.21
GPN1-204ENST00000436280 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.7■■■□□ 2.19
GPN1-204ENST00000436280 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
GPN1-204ENST00000436280 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.47■■■□□ 2.15
GPN1-204ENST00000436280 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.46■■■□□ 2.15
GPN1-204ENST00000436280 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
GPN1-204ENST00000436280 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.11■■■□□ 2.09
GPN1-204ENST00000436280 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.01■■■□□ 2.07
GPN1-204ENST00000436280 SCRIBQ14160 1630 aa27.97■■■□□ 2.07
GPN1-204ENST00000436280 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.9■■■□□ 2.06
GPN1-204ENST00000436280 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
GPN1-204ENST00000436280 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.38■■□□□ 1.97
GPN1-204ENST00000436280 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.27■■□□□ 1.96
GPN1-204ENST00000436280 SMARCA4P51532 1647 aa26.74■■□□□ 1.87
GPN1-204ENST00000436280 NCAPD3P42695 1498 aa26.72■■□□□ 1.87
GPN1-204ENST00000436280 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
GPN1-204ENST00000436280 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.68■■□□□ 1.86
GPN1-204ENST00000436280 SMARCA2P51531 1590 aa26.66■■□□□ 1.86
GPN1-204ENST00000436280 HMGXB3Q12766 1538 aa26.56■■□□□ 1.84
GPN1-204ENST00000436280 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.5■■□□□ 1.83
GPN1-204ENST00000436280 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.48■■□□□ 1.83
GPN1-204ENST00000436280 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
GPN1-204ENST00000436280 ERCC6Q03468 1493 aa26.18■■□□□ 1.78
GPN1-204ENST00000436280 WIZO95785 1651 aa26.17■■□□□ 1.78
GPN1-204ENST00000436280 NESP48681 1621 aa26.11■■□□□ 1.77
GPN1-204ENST00000436280 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GPN1-204ENST00000436280 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.06■■□□□ 1.76
GPN1-204ENST00000436280 CUX2O14529 1486 aa26■■□□□ 1.75
GPN1-204ENST00000436280 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.93■■□□□ 1.74
GPN1-204ENST00000436280 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.92■■□□□ 1.74
GPN1-204ENST00000436280 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
GPN1-204ENST00000436280 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.83■■□□□ 1.73
GPN1-204ENST00000436280 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
GPN1-204ENST00000436280 CFTRP13569 1480 aa25.71■■□□□ 1.71
GPN1-204ENST00000436280 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.65■■□□□ 1.7
GPN1-204ENST00000436280 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.63■■□□□ 1.69
GPN1-204ENST00000436280 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.62■■□□□ 1.69
GPN1-204ENST00000436280 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.6■■□□□ 1.69
GPN1-204ENST00000436280 PRDM2Q13029 1718 aa25.57■■□□□ 1.68
GPN1-204ENST00000436280 WDR62O43379 1518 aa25.56■■□□□ 1.68
GPN1-204ENST00000436280 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.5■■□□□ 1.67
GPN1-204ENST00000436280 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
GPN1-204ENST00000436280 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
GPN1-204ENST00000436280 ABCC8Q09428 1581 aa25.21■■□□□ 1.63
GPN1-204ENST00000436280 TOPBP1Q92547 1522 aa25.17■■□□□ 1.62
GPN1-204ENST00000436280 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.13■■□□□ 1.61
GPN1-204ENST00000436280 IFT140Q96RY7 1462 aa25.11■■□□□ 1.61
GPN1-204ENST00000436280 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GPN1-204ENST00000436280 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GPN1-204ENST00000436280 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
GPN1-204ENST00000436280 OSCARQ8IYS5 282 aa24.88■■□□□ 1.57
GPN1-204ENST00000436280 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GPN1-204ENST00000436280 CUX1P39880 1505 aa24.86■■□□□ 1.57
GPN1-204ENST00000436280 SOGA1O94964 1423 aa24.86■■□□□ 1.57
GPN1-204ENST00000436280 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.84■■□□□ 1.57
GPN1-204ENST00000436280 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.82■■□□□ 1.56
GPN1-204ENST00000436280 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
GPN1-204ENST00000436280 WDR97A6NE52 1622 aa24.75■■□□□ 1.55
GPN1-204ENST00000436280 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GPN1-204ENST00000436280 CHD1O14646 1710 aa24.64■■□□□ 1.54
GPN1-204ENST00000436280 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
GPN1-204ENST00000436280 FBLN2P98095 1184 aa24.61■■□□□ 1.53
GPN1-204ENST00000436280 GRIN2BQ13224 1484 aa24.6■■□□□ 1.53
GPN1-204ENST00000436280 TOP2BQ02880 1626 aa24.6■■□□□ 1.53
GPN1-204ENST00000436280 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.6■■□□□ 1.53
GPN1-204ENST00000436280 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.58■■□□□ 1.53
GPN1-204ENST00000436280 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.58■■□□□ 1.53
GPN1-204ENST00000436280 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
GPN1-204ENST00000436280 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.56■■□□□ 1.52
GPN1-204ENST00000436280 TRIM41Q8WV44 630 aa24.55■■□□□ 1.52
GPN1-204ENST00000436280 SYNJ1O43426 1573 aa24.54■■□□□ 1.52
GPN1-204ENST00000436280 PBRM1Q86U86 1689 aa24.53■■□□□ 1.52
GPN1-204ENST00000436280 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
GPN1-204ENST00000436280 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.5■■□□□ 1.51
GPN1-204ENST00000436280 SYNJ2O15056 1496 aa24.48■■□□□ 1.51
GPN1-204ENST00000436280 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.46■■□□□ 1.51
GPN1-204ENST00000436280 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.46■■□□□ 1.51
GPN1-204ENST00000436280 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.46■■□□□ 1.51
GPN1-204ENST00000436280 ARHGEF11O15085 1522 aa24.45■■□□□ 1.5
GPN1-204ENST00000436280 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.34■■□□□ 1.49
GPN1-204ENST00000436280 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.31■■□□□ 1.48
GPN1-204ENST00000436280 ADAMTS12P58397 1594 aa24.29■■□□□ 1.48
GPN1-204ENST00000436280 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.27■■□□□ 1.48
GPN1-204ENST00000436280 GRIN2AQ12879 1464 aa24.27■■□□□ 1.48
GPN1-204ENST00000436280 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.25■■□□□ 1.47
GPN1-204ENST00000436280 ARAP1Q96P48 1450 aa24.21■■□□□ 1.47
GPN1-204ENST00000436280 NUP160Q12769 1436 aa24.17■■□□□ 1.46
GPN1-204ENST00000436280 KIF27Q86VH2 1401 aa24.17■■□□□ 1.46
GPN1-204ENST00000436280 CEP170Q5SW79 1584 aa24.13■■□□□ 1.45
GPN1-204ENST00000436280 IGF1RP08069 1367 aa24.06■■□□□ 1.44
GPN1-204ENST00000436280 CUL7Q14999 1698 aa24.03■■□□□ 1.44
GPN1-204ENST00000436280 SHROOM2Q13796 1616 aa24■■□□□ 1.43
GPN1-204ENST00000436280 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.95■■□□□ 1.42
GPN1-204ENST00000436280 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.94■■□□□ 1.42
GPN1-204ENST00000436280 JPH4Q96JJ6 628 aa23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms