RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435476.1

MDFI-206, Transcript of MyoD family inhibitor, humanhuman

TSL 2

Gene MDFI, Length 650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDFI-206ENST00000435476 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.9■■■■■ 7.02
MDFI-206ENST00000435476 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.48■■■■■ 5.99
MDFI-206ENST00000435476 ABCC9O60706 1549 aa51.98■■■■■ 5.91
MDFI-206ENST00000435476 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.66■■■■■ 5.54
MDFI-206ENST00000435476 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.54■■■■■ 5.52
MDFI-206ENST00000435476 NACADO15069 1562 aa49.48■■■■■ 5.51
MDFI-206ENST00000435476 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.99■■■■■ 5.43
MDFI-206ENST00000435476 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.96■■■■■ 5.43
MDFI-206ENST00000435476 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.63■■■■■ 5.37
MDFI-206ENST00000435476 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.55■■■■■ 5.36
MDFI-206ENST00000435476 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.52■■■■■ 5.36
MDFI-206ENST00000435476 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.24■■■■■ 5.31
MDFI-206ENST00000435476 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.19■■■■■ 5.3
MDFI-206ENST00000435476 SCRIBQ14160 1630 aa47.99■■■■■ 5.27
MDFI-206ENST00000435476 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.55■■■■■ 5.2
MDFI-206ENST00000435476 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
MDFI-206ENST00000435476 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.93■■■■■ 5.1
MDFI-206ENST00000435476 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.71■■■■■ 5.07
MDFI-206ENST00000435476 SMARCA4P51532 1647 aa45.79■■■■■ 4.92
MDFI-206ENST00000435476 NCAPD3P42695 1498 aa45.7■■■■■ 4.91
MDFI-206ENST00000435476 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.69■■■■■ 4.91
MDFI-206ENST00000435476 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
MDFI-206ENST00000435476 SMARCA2P51531 1590 aa45.55■■■■■ 4.88
MDFI-206ENST00000435476 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.44■■■■■ 4.86
MDFI-206ENST00000435476 HMGXB3Q12766 1538 aa45.4■■■■■ 4.86
MDFI-206ENST00000435476 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.3■■■■■ 4.84
MDFI-206ENST00000435476 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
MDFI-206ENST00000435476 WIZO95785 1651 aa44.9■■■■■ 4.78
MDFI-206ENST00000435476 NESP48681 1621 aa44.85■■■■■ 4.77
MDFI-206ENST00000435476 ERCC6Q03468 1493 aa44.79■■■■■ 4.76
MDFI-206ENST00000435476 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
MDFI-206ENST00000435476 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.54■■■■■ 4.72
MDFI-206ENST00000435476 CUX2O14529 1486 aa44.42■■■■■ 4.7
MDFI-206ENST00000435476 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.37■■■■■ 4.69
MDFI-206ENST00000435476 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
MDFI-206ENST00000435476 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.28■■■■■ 4.68
MDFI-206ENST00000435476 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.22■■■■■ 4.67
MDFI-206ENST00000435476 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
MDFI-206ENST00000435476 CFTRP13569 1480 aa43.99■■■■■ 4.63
MDFI-206ENST00000435476 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.89■■■■■ 4.62
MDFI-206ENST00000435476 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.89■■■■■ 4.62
MDFI-206ENST00000435476 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.88■■■■■ 4.61
MDFI-206ENST00000435476 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.85■■■■■ 4.61
MDFI-206ENST00000435476 WDR62O43379 1518 aa43.73■■■■■ 4.59
MDFI-206ENST00000435476 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.68■■■■■ 4.58
MDFI-206ENST00000435476 PRDM2Q13029 1718 aa43.51■■■■■ 4.56
MDFI-206ENST00000435476 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
MDFI-206ENST00000435476 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
MDFI-206ENST00000435476 TOPBP1Q92547 1522 aa43.12■■■■■ 4.49
MDFI-206ENST00000435476 ABCC8Q09428 1581 aa42.99■■■■■ 4.47
MDFI-206ENST00000435476 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.99■■■■■ 4.47
MDFI-206ENST00000435476 IFT140Q96RY7 1462 aa42.94■■■■■ 4.46
MDFI-206ENST00000435476 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
MDFI-206ENST00000435476 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
MDFI-206ENST00000435476 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
MDFI-206ENST00000435476 CUX1P39880 1505 aa42.64■■■■■ 4.42
MDFI-206ENST00000435476 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
MDFI-206ENST00000435476 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.61■■■■■ 4.41
MDFI-206ENST00000435476 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.57■■■■■ 4.41
MDFI-206ENST00000435476 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.56■■■■■ 4.4
MDFI-206ENST00000435476 OSCARQ8IYS5 282 aa42.56■■■■■ 4.4
MDFI-206ENST00000435476 SOGA1O94964 1423 aa42.55■■■■■ 4.4
MDFI-206ENST00000435476 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
MDFI-206ENST00000435476 WDR97A6NE52 1622 aa42.19■■■■■ 4.34
MDFI-206ENST00000435476 FBLN2P98095 1184 aa42.18■■■■■ 4.34
MDFI-206ENST00000435476 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.18■■■■■ 4.34
MDFI-206ENST00000435476 CHD1O14646 1710 aa42.15■■■■■ 4.34
MDFI-206ENST00000435476 TRIM41Q8WV44 630 aa42.14■■■■■ 4.34
MDFI-206ENST00000435476 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.14■■■■■ 4.34
MDFI-206ENST00000435476 SYNJ1O43426 1573 aa42.12■■■■■ 4.33
MDFI-206ENST00000435476 TOP2BQ02880 1626 aa42.09■■■■■ 4.33
MDFI-206ENST00000435476 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.09■■■■■ 4.33
MDFI-206ENST00000435476 GRIN2BQ13224 1484 aa42.08■■■■■ 4.33
MDFI-206ENST00000435476 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.08■■■■■ 4.33
MDFI-206ENST00000435476 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.04■■■■■ 4.32
MDFI-206ENST00000435476 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
MDFI-206ENST00000435476 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.96■■■■■ 4.31
MDFI-206ENST00000435476 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
MDFI-206ENST00000435476 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
MDFI-206ENST00000435476 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.92■■■■■ 4.3
MDFI-206ENST00000435476 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.92■■■■■ 4.3
MDFI-206ENST00000435476 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.92■■■■■ 4.3
MDFI-206ENST00000435476 ARHGEF11O15085 1522 aa41.87■■■■■ 4.29
MDFI-206ENST00000435476 SYNJ2O15056 1496 aa41.86■■■■■ 4.29
MDFI-206ENST00000435476 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.69■■■■■ 4.27
MDFI-206ENST00000435476 ADAMTS12P58397 1594 aa41.61■■■■■ 4.25
MDFI-206ENST00000435476 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.57■■■■■ 4.25
MDFI-206ENST00000435476 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.55■■■■■ 4.24
MDFI-206ENST00000435476 GRIN2AQ12879 1464 aa41.55■■■■■ 4.24
MDFI-206ENST00000435476 ARAP1Q96P48 1450 aa41.53■■■■■ 4.24
MDFI-206ENST00000435476 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.52■■■■■ 4.24
MDFI-206ENST00000435476 CEP170Q5SW79 1584 aa41.38■■■■■ 4.22
MDFI-206ENST00000435476 NUP160Q12769 1436 aa41.38■■■■■ 4.22
MDFI-206ENST00000435476 KIF27Q86VH2 1401 aa41.32■■■■■ 4.21
MDFI-206ENST00000435476 IGF1RP08069 1367 aa41.25■■■■■ 4.19
MDFI-206ENST00000435476 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.16■■■■■ 4.18
MDFI-206ENST00000435476 SHROOM2Q13796 1616 aa41.08■■■■■ 4.17
MDFI-206ENST00000435476 CUL7Q14999 1698 aa41.07■■■■■ 4.16
MDFI-206ENST00000435476 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41■■■■■ 4.15
MDFI-206ENST00000435476 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.99■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms